Protein–RNA interactions for Protein: Q8BKI2

Tnrc6b, Trinucleotide repeat-containing gene 6B protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,810 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnrc6bQ8BKI2 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tnrc6bQ8BKI2 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tnrc6bQ8BKI2 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tnrc6bQ8BKI2 Actc1-201ENSMUST00000090269 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tnrc6bQ8BKI2 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tnrc6bQ8BKI2 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tnrc6bQ8BKI2 Fetub-201ENSMUST00000023587 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tnrc6bQ8BKI2 Sh2d7-202ENSMUST00000118413 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tnrc6bQ8BKI2 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tnrc6bQ8BKI2 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tnrc6bQ8BKI2 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tnrc6bQ8BKI2 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tnrc6bQ8BKI2 Spsb1-202ENSMUST00000105684 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tnrc6bQ8BKI2 Tmsb10-201ENSMUST00000114048 623 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tnrc6bQ8BKI2 Gm14130-201ENSMUST00000118417 987 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Tnrc6bQ8BKI2 U2af1l4-215ENSMUST00000166257 546 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tnrc6bQ8BKI2 Crb3-205ENSMUST00000169543 778 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tnrc6bQ8BKI2 Rhoc-204ENSMUST00000176347 583 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tnrc6bQ8BKI2 Rnf141-207ENSMUST00000176716 1080 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tnrc6bQ8BKI2 H2al1g-201ENSMUST00000179859 509 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tnrc6bQ8BKI2 Gsdmcl-ps-204ENSMUST00000191285 637 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tnrc6bQ8BKI2 Gm42797-201ENSMUST00000197573 494 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tnrc6bQ8BKI2 Gm45338-203ENSMUST00000210371 1009 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tnrc6bQ8BKI2 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tnrc6bQ8BKI2 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tnrc6bQ8BKI2 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tnrc6bQ8BKI2 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tnrc6bQ8BKI2 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tnrc6bQ8BKI2 Tshr-201ENSMUST00000021343 1339 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tnrc6bQ8BKI2 Gtf2ird1-209ENSMUST00000171794 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tnrc6bQ8BKI2 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tnrc6bQ8BKI2 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tnrc6bQ8BKI2 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tnrc6bQ8BKI2 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tnrc6bQ8BKI2 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tnrc6bQ8BKI2 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tnrc6bQ8BKI2 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tnrc6bQ8BKI2 Gm12715-201ENSMUST00000121430 1128 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Tnrc6bQ8BKI2 Gm14597-202ENSMUST00000129769 715 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tnrc6bQ8BKI2 AC162938.2-203ENSMUST00000216604 1134 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tnrc6bQ8BKI2 Tmem50a-201ENSMUST00000030626 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tnrc6bQ8BKI2 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tnrc6bQ8BKI2 CT009713.10-201ENSMUST00000225013 1986 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Tnrc6bQ8BKI2 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tnrc6bQ8BKI2 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tnrc6bQ8BKI2 Gm4366-201ENSMUST00000201488 1342 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Tnrc6bQ8BKI2 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tnrc6bQ8BKI2 Ppox-201ENSMUST00000073120 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tnrc6bQ8BKI2 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tnrc6bQ8BKI2 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tnrc6bQ8BKI2 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tnrc6bQ8BKI2 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tnrc6bQ8BKI2 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tnrc6bQ8BKI2 Ctsl-201ENSMUST00000021933 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tnrc6bQ8BKI2 Nmral1-202ENSMUST00000079130 1459 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tnrc6bQ8BKI2 Pqbp1-203ENSMUST00000115655 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tnrc6bQ8BKI2 Gm12291-201ENSMUST00000121627 311 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Tnrc6bQ8BKI2 Anapc16-202ENSMUST00000182116 581 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tnrc6bQ8BKI2 Gm29856-201ENSMUST00000191905 1257 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tnrc6bQ8BKI2 AC110091.3-202ENSMUST00000217104 791 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tnrc6bQ8BKI2 AC126253.1-202ENSMUST00000226732 835 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Tnrc6bQ8BKI2 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tnrc6bQ8BKI2 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tnrc6bQ8BKI2 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tnrc6bQ8BKI2 Abhd14b-209ENSMUST00000216130 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tnrc6bQ8BKI2 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tnrc6bQ8BKI2 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tnrc6bQ8BKI2 D730001G18Rik-202ENSMUST00000191407 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tnrc6bQ8BKI2 Oas1f-201ENSMUST00000057814 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tnrc6bQ8BKI2 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tnrc6bQ8BKI2 Gm13442-201ENSMUST00000135749 663 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tnrc6bQ8BKI2 Gm18615-201ENSMUST00000222919 1031 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Tnrc6bQ8BKI2 1810062G17Rik-201ENSMUST00000029268 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tnrc6bQ8BKI2 Odf4-201ENSMUST00000038932 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tnrc6bQ8BKI2 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tnrc6bQ8BKI2 Ube2a-201ENSMUST00000016452 1732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tnrc6bQ8BKI2 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tnrc6bQ8BKI2 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tnrc6bQ8BKI2 AI839979-202ENSMUST00000201790 1539 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tnrc6bQ8BKI2 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tnrc6bQ8BKI2 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tnrc6bQ8BKI2 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tnrc6bQ8BKI2 Naga-201ENSMUST00000023088 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tnrc6bQ8BKI2 Tspan32-203ENSMUST00000082008 1587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tnrc6bQ8BKI2 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tnrc6bQ8BKI2 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tnrc6bQ8BKI2 1110034G24Rik-202ENSMUST00000110132 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tnrc6bQ8BKI2 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tnrc6bQ8BKI2 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tnrc6bQ8BKI2 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tnrc6bQ8BKI2 Rbm3-202ENSMUST00000115615 1183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tnrc6bQ8BKI2 Rbm3-203ENSMUST00000115616 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tnrc6bQ8BKI2 Wsb2-ps-201ENSMUST00000117937 1217 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Tnrc6bQ8BKI2 G630018N14Rik-201ENSMUST00000135656 1231 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tnrc6bQ8BKI2 Gm15829-201ENSMUST00000145415 869 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tnrc6bQ8BKI2 4833427G06Rik-201ENSMUST00000170947 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tnrc6bQ8BKI2 Mymx-203ENSMUST00000178858 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tnrc6bQ8BKI2 Bcdin3d-201ENSMUST00000040313 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tnrc6bQ8BKI2 Ccdc70-202ENSMUST00000070649 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tnrc6bQ8BKI2 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.9 ms