Protein–RNA interactions for Protein: Q8BK35

Nop53, Ribosome biogenesis protein NOP53, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 484 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nop53Q8BK35 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nop53Q8BK35 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nop53Q8BK35 Lrig2-201ENSMUST00000046316 7099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nop53Q8BK35 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nop53Q8BK35 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nop53Q8BK35 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nop53Q8BK35 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nop53Q8BK35 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Nop53Q8BK35 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nop53Q8BK35 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nop53Q8BK35 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nop53Q8BK35 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nop53Q8BK35 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Nop53Q8BK35 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nop53Q8BK35 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nop53Q8BK35 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nop53Q8BK35 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nop53Q8BK35 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nop53Q8BK35 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nop53Q8BK35 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nop53Q8BK35 Cacna1c-225ENSMUST00000219223 7483 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nop53Q8BK35 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nop53Q8BK35 Slc8a2-201ENSMUST00000168693 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nop53Q8BK35 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nop53Q8BK35 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nop53Q8BK35 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Nop53Q8BK35 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nop53Q8BK35 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nop53Q8BK35 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nop53Q8BK35 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nop53Q8BK35 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nop53Q8BK35 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nop53Q8BK35 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nop53Q8BK35 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nop53Q8BK35 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nop53Q8BK35 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nop53Q8BK35 Pcdhgc3-201ENSMUST00000076807 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nop53Q8BK35 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nop53Q8BK35 Ppp1r16b-201ENSMUST00000045503 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nop53Q8BK35 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nop53Q8BK35 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nop53Q8BK35 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nop53Q8BK35 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Nop53Q8BK35 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nop53Q8BK35 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nop53Q8BK35 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nop53Q8BK35 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nop53Q8BK35 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nop53Q8BK35 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Nop53Q8BK35 Zbtb1-201ENSMUST00000042779 12190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nop53Q8BK35 Itgb4-202ENSMUST00000068981 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nop53Q8BK35 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nop53Q8BK35 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nop53Q8BK35 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nop53Q8BK35 Myh7-204ENSMUST00000168485 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nop53Q8BK35 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nop53Q8BK35 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nop53Q8BK35 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nop53Q8BK35 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nop53Q8BK35 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nop53Q8BK35 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nop53Q8BK35 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nop53Q8BK35 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nop53Q8BK35 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nop53Q8BK35 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nop53Q8BK35 Pax2-203ENSMUST00000174490 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nop53Q8BK35 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nop53Q8BK35 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nop53Q8BK35 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nop53Q8BK35 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Nop53Q8BK35 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nop53Q8BK35 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nop53Q8BK35 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Nop53Q8BK35 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Nop53Q8BK35 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Nop53Q8BK35 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nop53Q8BK35 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nop53Q8BK35 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Nop53Q8BK35 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nop53Q8BK35 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nop53Q8BK35 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nop53Q8BK35 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nop53Q8BK35 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nop53Q8BK35 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nop53Q8BK35 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nop53Q8BK35 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nop53Q8BK35 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nop53Q8BK35 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nop53Q8BK35 Slc35d1-203ENSMUST00000150285 4242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nop53Q8BK35 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nop53Q8BK35 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nop53Q8BK35 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Nop53Q8BK35 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nop53Q8BK35 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nop53Q8BK35 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nop53Q8BK35 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nop53Q8BK35 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nop53Q8BK35 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nop53Q8BK35 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Nop53Q8BK35 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms