Protein–RNA interactions for Protein: Q810U5

Ccdc50, Coiled-coil domain-containing protein 50, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 305 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc50Q810U5 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccdc50Q810U5 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccdc50Q810U5 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccdc50Q810U5 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccdc50Q810U5 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccdc50Q810U5 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccdc50Q810U5 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccdc50Q810U5 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccdc50Q810U5 Zfp148-202ENSMUST00000165418 9431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccdc50Q810U5 Gm7049-201ENSMUST00000223520 1712 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccdc50Q810U5 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccdc50Q810U5 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccdc50Q810U5 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc50Q810U5 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc50Q810U5 AC122228.1-201ENSMUST00000223113 2057 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc50Q810U5 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc50Q810U5 Spock1-202ENSMUST00000185502 4614 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc50Q810U5 Etf1-201ENSMUST00000025218 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc50Q810U5 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc50Q810U5 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc50Q810U5 Hipk3-201ENSMUST00000028600 7454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc50Q810U5 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc50Q810U5 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc50Q810U5 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc50Q810U5 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc50Q810U5 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc50Q810U5 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc50Q810U5 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc50Q810U5 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc50Q810U5 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc50Q810U5 Tcf12-218ENSMUST00000184783 3489 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc50Q810U5 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc50Q810U5 Otx1-201ENSMUST00000006071 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc50Q810U5 Gm37105-201ENSMUST00000192251 2085 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc50Q810U5 Gnat2-201ENSMUST00000058669 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc50Q810U5 Pgap2-204ENSMUST00000120879 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc50Q810U5 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc50Q810U5 Zscan20-202ENSMUST00000097877 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc50Q810U5 Klk2-ps-202ENSMUST00000206865 2684 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc50Q810U5 CT025678.1-201ENSMUST00000214795 2972 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc50Q810U5 CT025624.1-201ENSMUST00000224007 2700 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc50Q810U5 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc50Q810U5 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc50Q810U5 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc50Q810U5 Gm19434-201ENSMUST00000204330 2573 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc50Q810U5 Otop1-202ENSMUST00000114099 3141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc50Q810U5 Fgd2-201ENSMUST00000024810 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc50Q810U5 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc50Q810U5 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc50Q810U5 Corin-201ENSMUST00000005352 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc50Q810U5 Irs4-201ENSMUST00000067841 6294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc50Q810U5 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc50Q810U5 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc50Q810U5 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc50Q810U5 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc50Q810U5 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc50Q810U5 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc50Q810U5 Faap100-201ENSMUST00000026448 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc50Q810U5 Tapbp-201ENSMUST00000025161 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc50Q810U5 Tln1-201ENSMUST00000030187 8393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc50Q810U5 Epb41l5-208ENSMUST00000191046 6870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc50Q810U5 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc50Q810U5 Plagl1-201ENSMUST00000121325 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc50Q810U5 Coq3-201ENSMUST00000029909 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc50Q810U5 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc50Q810U5 Itgb4-202ENSMUST00000068981 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc50Q810U5 Rnf17-202ENSMUST00000223627 2077 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc50Q810U5 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc50Q810U5 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc50Q810U5 Atp1a2-201ENSMUST00000085913 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc50Q810U5 Lrrc20-201ENSMUST00000049242 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc50Q810U5 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc50Q810U5 Arhgap22-202ENSMUST00000111956 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc50Q810U5 Ptger4-202ENSMUST00000120563 3312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc50Q810U5 Tesmin-203ENSMUST00000142193 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc50Q810U5 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc50Q810U5 Itgal-201ENSMUST00000106306 5195 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc50Q810U5 Gm15082-201ENSMUST00000147045 1960 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc50Q810U5 Yeats2-201ENSMUST00000090052 5997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc50Q810U5 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc50Q810U5 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc50Q810U5 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc50Q810U5 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc50Q810U5 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc50Q810U5 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc50Q810U5 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc50Q810U5 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc50Q810U5 Urgcp-203ENSMUST00000118076 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc50Q810U5 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc50Q810U5 Drd1-201ENSMUST00000021932 3526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc50Q810U5 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc50Q810U5 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc50Q810U5 Patj-201ENSMUST00000030290 2495 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc50Q810U5 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc50Q810U5 Lhx6-201ENSMUST00000112960 3345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc50Q810U5 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc50Q810U5 Ptprr-204ENSMUST00000128399 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc50Q810U5 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc50Q810U5 Wfs1-201ENSMUST00000043964 3787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc50Q810U5 Zfp595-205ENSMUST00000171466 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
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