Protein–RNA interactions for Protein: Q80W37

Snupn, Snurportin-1, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SnupnQ80W37 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
SnupnQ80W37 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SnupnQ80W37 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SnupnQ80W37 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
SnupnQ80W37 Cdadc1-201ENSMUST00000022555 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SnupnQ80W37 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
SnupnQ80W37 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SnupnQ80W37 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SnupnQ80W37 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SnupnQ80W37 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SnupnQ80W37 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SnupnQ80W37 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SnupnQ80W37 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SnupnQ80W37 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SnupnQ80W37 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SnupnQ80W37 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SnupnQ80W37 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SnupnQ80W37 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SnupnQ80W37 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SnupnQ80W37 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SnupnQ80W37 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SnupnQ80W37 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
SnupnQ80W37 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SnupnQ80W37 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
SnupnQ80W37 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SnupnQ80W37 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SnupnQ80W37 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SnupnQ80W37 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SnupnQ80W37 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SnupnQ80W37 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SnupnQ80W37 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SnupnQ80W37 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SnupnQ80W37 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
SnupnQ80W37 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
SnupnQ80W37 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
SnupnQ80W37 Gm10863-205ENSMUST00000148028 905 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
SnupnQ80W37 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SnupnQ80W37 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
SnupnQ80W37 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
SnupnQ80W37 Gm867-202ENSMUST00000219979 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
SnupnQ80W37 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SnupnQ80W37 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SnupnQ80W37 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SnupnQ80W37 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SnupnQ80W37 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SnupnQ80W37 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SnupnQ80W37 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SnupnQ80W37 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SnupnQ80W37 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SnupnQ80W37 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SnupnQ80W37 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SnupnQ80W37 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
SnupnQ80W37 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SnupnQ80W37 Pja1-201ENSMUST00000036354 2563 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SnupnQ80W37 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
SnupnQ80W37 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SnupnQ80W37 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SnupnQ80W37 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SnupnQ80W37 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SnupnQ80W37 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
SnupnQ80W37 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SnupnQ80W37 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SnupnQ80W37 Gm45003-201ENSMUST00000205875 2158 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
SnupnQ80W37 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SnupnQ80W37 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SnupnQ80W37 Adam22-207ENSMUST00000115388 9161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
SnupnQ80W37 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SnupnQ80W37 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
SnupnQ80W37 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SnupnQ80W37 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SnupnQ80W37 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
SnupnQ80W37 Gm15429-201ENSMUST00000151268 798 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
SnupnQ80W37 Gm38230-201ENSMUST00000193572 1159 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
SnupnQ80W37 Gm42902-201ENSMUST00000199508 662 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
SnupnQ80W37 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
SnupnQ80W37 Gm7067-201ENSMUST00000207698 1249 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
SnupnQ80W37 AC110817.1-201ENSMUST00000225706 605 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
SnupnQ80W37 AC192088.1-201ENSMUST00000227561 301 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
SnupnQ80W37 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SnupnQ80W37 Rps21-201ENSMUST00000059080 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SnupnQ80W37 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SnupnQ80W37 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SnupnQ80W37 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
SnupnQ80W37 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SnupnQ80W37 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
SnupnQ80W37 Nbeal2-210ENSMUST00000167320 8803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SnupnQ80W37 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SnupnQ80W37 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SnupnQ80W37 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SnupnQ80W37 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SnupnQ80W37 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SnupnQ80W37 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
SnupnQ80W37 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SnupnQ80W37 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
SnupnQ80W37 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
SnupnQ80W37 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
SnupnQ80W37 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
SnupnQ80W37 Gm43321-201ENSMUST00000198897 2409 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
SnupnQ80W37 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
SnupnQ80W37 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
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