Protein–RNA interactions for Protein: Q7TMX5

Shq1, Protein SHQ1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 569 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shq1Q7TMX5 Gm5637-201ENSMUST00000153890 1119 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
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Shq1Q7TMX5 Gm6621-201ENSMUST00000193251 772 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Shq1Q7TMX5 Ighv1-62-201ENSMUST00000193406 350 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Shq1Q7TMX5 Gm44069-201ENSMUST00000204898 506 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
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Shq1Q7TMX5 Avpr2-201ENSMUST00000033765 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
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Shq1Q7TMX5 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Shq1Q7TMX5 Art3-206ENSMUST00000120416 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Shq1Q7TMX5 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
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Shq1Q7TMX5 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
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Shq1Q7TMX5 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
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Shq1Q7TMX5 Ufc1-202ENSMUST00000111302 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
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Shq1Q7TMX5 Gm16191-202ENSMUST00000148464 484 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
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Shq1Q7TMX5 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
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Shq1Q7TMX5 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Shq1Q7TMX5 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
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Shq1Q7TMX5 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Shq1Q7TMX5 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Shq1Q7TMX5 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Shq1Q7TMX5 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Shq1Q7TMX5 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Shq1Q7TMX5 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Shq1Q7TMX5 Lrp1-202ENSMUST00000118455 2097 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Shq1Q7TMX5 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Shq1Q7TMX5 Saxo1-201ENSMUST00000030216 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Shq1Q7TMX5 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Shq1Q7TMX5 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Shq1Q7TMX5 Cant1-206ENSMUST00000164927 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Shq1Q7TMX5 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Shq1Q7TMX5 Gm6447-201ENSMUST00000118905 835 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Shq1Q7TMX5 4933406I18Rik-201ENSMUST00000124673 905 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Shq1Q7TMX5 Gm2231-201ENSMUST00000125661 612 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Shq1Q7TMX5 Gm7809-201ENSMUST00000153199 742 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Shq1Q7TMX5 Gm15851-201ENSMUST00000160564 662 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Shq1Q7TMX5 Gm32850-202ENSMUST00000209149 732 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Shq1Q7TMX5 Brk1-201ENSMUST00000035725 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Shq1Q7TMX5 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Shq1Q7TMX5 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Shq1Q7TMX5 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Shq1Q7TMX5 Fam71f1-203ENSMUST00000164560 1411 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
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