Protein–RNA interactions for Protein: Q78T54

Vma21, Vacuolar ATPase assembly integral membrane protein Vma21, mousemouse

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Length 101 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vma21Q78T54 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Vma21Q78T54 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Vma21Q78T54 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Vma21Q78T54 Sp3-202ENSMUST00000102689 4181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Vma21Q78T54 Wdr66-202ENSMUST00000121964 4873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Vma21Q78T54 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Vma21Q78T54 Plch2-206ENSMUST00000135665 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Vma21Q78T54 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Vma21Q78T54 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Vma21Q78T54 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Vma21Q78T54 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Vma21Q78T54 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Vma21Q78T54 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Vma21Q78T54 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Vma21Q78T54 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Vma21Q78T54 Ddx46-202ENSMUST00000172272 5676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Vma21Q78T54 Ddx46-201ENSMUST00000099479 5664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Vma21Q78T54 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Vma21Q78T54 Nxf1-211ENSMUST00000184970 5591 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Vma21Q78T54 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Vma21Q78T54 Sema6d-206ENSMUST00000103239 6225 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.63
Vma21Q78T54 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Vma21Q78T54 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Vma21Q78T54 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Vma21Q78T54 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Vma21Q78T54 Kcnq3-201ENSMUST00000070256 11824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Vma21Q78T54 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.63
Vma21Q78T54 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Vma21Q78T54 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Vma21Q78T54 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Vma21Q78T54 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Vma21Q78T54 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Vma21Q78T54 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Vma21Q78T54 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Vma21Q78T54 Col14a1-203ENSMUST00000110221 5679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Vma21Q78T54 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Vma21Q78T54 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Vma21Q78T54 Dcaf6-201ENSMUST00000027856 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Vma21Q78T54 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Vma21Q78T54 Pcnx2-204ENSMUST00000131127 3782 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Vma21Q78T54 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Vma21Q78T54 Phrf1-201ENSMUST00000106027 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Vma21Q78T54 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Vma21Q78T54 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Vma21Q78T54 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Vma21Q78T54 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Vma21Q78T54 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Vma21Q78T54 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Vma21Q78T54 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Vma21Q78T54 Spock1-202ENSMUST00000185502 4614 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Vma21Q78T54 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Vma21Q78T54 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Vma21Q78T54 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Vma21Q78T54 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Vma21Q78T54 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Vma21Q78T54 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Vma21Q78T54 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Vma21Q78T54 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Vma21Q78T54 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Vma21Q78T54 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Vma21Q78T54 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Vma21Q78T54 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC11.14□□□□□ -0.63
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Vma21Q78T54 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Vma21Q78T54 Dhx37-201ENSMUST00000169485 4760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Vma21Q78T54 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Vma21Q78T54 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
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Vma21Q78T54 Ptk2-201ENSMUST00000110036 4184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Vma21Q78T54 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Vma21Q78T54 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Vma21Q78T54 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Vma21Q78T54 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Vma21Q78T54 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Vma21Q78T54 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Vma21Q78T54 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Vma21Q78T54 Stard8-201ENSMUST00000036606 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Vma21Q78T54 Ttbk1-203ENSMUST00000225808 8926 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Vma21Q78T54 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Vma21Q78T54 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Vma21Q78T54 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Vma21Q78T54 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Vma21Q78T54 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Vma21Q78T54 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Vma21Q78T54 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Vma21Q78T54 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Vma21Q78T54 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Vma21Q78T54 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Vma21Q78T54 Fgfr1-203ENSMUST00000119398 3789 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Vma21Q78T54 Mtus1-202ENSMUST00000059115 6548 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Vma21Q78T54 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Vma21Q78T54 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Vma21Q78T54 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Vma21Q78T54 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Vma21Q78T54 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Vma21Q78T54 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Vma21Q78T54 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
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