Protein–RNA interactions for Protein: Q704Y3

Trpv1, Transient receptor potential cation channel subfamily V member 1, mousemouse

Predictions only

Length 839 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpv1Q704Y3 Gm26110-201ENSMUST00000083971 165 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Trpv1Q704Y3 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trpv1Q704Y3 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trpv1Q704Y3 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trpv1Q704Y3 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trpv1Q704Y3 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trpv1Q704Y3 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trpv1Q704Y3 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trpv1Q704Y3 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Trpv1Q704Y3 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trpv1Q704Y3 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trpv1Q704Y3 Igf1-204ENSMUST00000121161 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trpv1Q704Y3 Gm9333-201ENSMUST00000205452 1323 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Trpv1Q704Y3 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trpv1Q704Y3 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Trpv1Q704Y3 Mmp21-202ENSMUST00000122136 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trpv1Q704Y3 Pacrg-201ENSMUST00000041463 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trpv1Q704Y3 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trpv1Q704Y3 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trpv1Q704Y3 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trpv1Q704Y3 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trpv1Q704Y3 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trpv1Q704Y3 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trpv1Q704Y3 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trpv1Q704Y3 Gm16202-201ENSMUST00000117532 544 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Trpv1Q704Y3 Gm12012-201ENSMUST00000118857 1066 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Trpv1Q704Y3 Gm11222-201ENSMUST00000119005 738 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Trpv1Q704Y3 Gm15046-201ENSMUST00000130153 408 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trpv1Q704Y3 Spata3-211ENSMUST00000159876 760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trpv1Q704Y3 H2al1g-201ENSMUST00000179859 509 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trpv1Q704Y3 1700011D18Rik-201ENSMUST00000205762 277 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Trpv1Q704Y3 Ceacam1-209ENSMUST00000206687 1061 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trpv1Q704Y3 3300002I08Rik-201ENSMUST00000051153 650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trpv1Q704Y3 Gm5129-201ENSMUST00000065372 300 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trpv1Q704Y3 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trpv1Q704Y3 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trpv1Q704Y3 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trpv1Q704Y3 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trpv1Q704Y3 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Trpv1Q704Y3 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trpv1Q704Y3 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trpv1Q704Y3 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trpv1Q704Y3 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trpv1Q704Y3 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trpv1Q704Y3 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trpv1Q704Y3 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trpv1Q704Y3 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trpv1Q704Y3 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trpv1Q704Y3 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trpv1Q704Y3 Tada3-202ENSMUST00000043333 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trpv1Q704Y3 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trpv1Q704Y3 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trpv1Q704Y3 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trpv1Q704Y3 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trpv1Q704Y3 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trpv1Q704Y3 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trpv1Q704Y3 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trpv1Q704Y3 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trpv1Q704Y3 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trpv1Q704Y3 Elovl1-203ENSMUST00000102673 1248 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trpv1Q704Y3 Cox16-202ENSMUST00000110340 668 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trpv1Q704Y3 Gm14017-201ENSMUST00000121934 386 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Trpv1Q704Y3 Fbxw4-203ENSMUST00000160003 387 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trpv1Q704Y3 Bloc1s2-ps-201ENSMUST00000183232 432 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Trpv1Q704Y3 Gm42797-201ENSMUST00000197573 494 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trpv1Q704Y3 Fmr1nb-202ENSMUST00000071848 842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trpv1Q704Y3 Olfr366-201ENSMUST00000091001 930 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trpv1Q704Y3 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trpv1Q704Y3 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trpv1Q704Y3 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Trpv1Q704Y3 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trpv1Q704Y3 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trpv1Q704Y3 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trpv1Q704Y3 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trpv1Q704Y3 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trpv1Q704Y3 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trpv1Q704Y3 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trpv1Q704Y3 Pax7-202ENSMUST00000174681 1725 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trpv1Q704Y3 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trpv1Q704Y3 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trpv1Q704Y3 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trpv1Q704Y3 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trpv1Q704Y3 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trpv1Q704Y3 Lat2-205ENSMUST00000200998 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trpv1Q704Y3 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
Trpv1Q704Y3 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trpv1Q704Y3 BC039966-201ENSMUST00000141582 1371 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trpv1Q704Y3 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trpv1Q704Y3 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trpv1Q704Y3 Kifc5c-ps-201ENSMUST00000179040 1530 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Trpv1Q704Y3 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trpv1Q704Y3 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trpv1Q704Y3 Selenoh-203ENSMUST00000117299 747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trpv1Q704Y3 Cep97-206ENSMUST00000122280 1057 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trpv1Q704Y3 Gm17586-201ENSMUST00000181502 908 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trpv1Q704Y3 Gm2260-201ENSMUST00000184965 657 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Trpv1Q704Y3 1700065D16Rik-203ENSMUST00000189279 393 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trpv1Q704Y3 Gm5896-201ENSMUST00000189662 1024 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Trpv1Q704Y3 Gm31651-201ENSMUST00000198864 560 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trpv1Q704Y3 Rpl10a-201ENSMUST00000042334 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms