Protein–RNA interactions for Protein: Q6PCS8

Zbtb40, Zinc finger and BTB domain-containing 40, mousemouse

Predictions only

Length 1,258 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbtb40Q6PCS8 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Zbtb40Q6PCS8 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Zbtb40Q6PCS8 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Zbtb40Q6PCS8 Snap25-202ENSMUST00000110098 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Zbtb40Q6PCS8 Agbl3-202ENSMUST00000115012 790 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Zbtb40Q6PCS8 Agbl3-203ENSMUST00000115014 805 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Zbtb40Q6PCS8 Gm14350-201ENSMUST00000116642 640 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Zbtb40Q6PCS8 Gm27682-201ENSMUST00000183930 110 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Zbtb40Q6PCS8 Gm36264-202ENSMUST00000221989 1142 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Zbtb40Q6PCS8 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Zbtb40Q6PCS8 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Zbtb40Q6PCS8 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Zbtb40Q6PCS8 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Zbtb40Q6PCS8 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Zbtb40Q6PCS8 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Zbtb40Q6PCS8 Glipr2-202ENSMUST00000107855 1816 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Zbtb40Q6PCS8 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Zbtb40Q6PCS8 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Zbtb40Q6PCS8 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Zbtb40Q6PCS8 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Zbtb40Q6PCS8 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Zbtb40Q6PCS8 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Zbtb40Q6PCS8 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Zbtb40Q6PCS8 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Zbtb40Q6PCS8 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Zbtb40Q6PCS8 Dera-207ENSMUST00000203693 1446 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Zbtb40Q6PCS8 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Zbtb40Q6PCS8 Gm18630-201ENSMUST00000222109 1397 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Zbtb40Q6PCS8 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Zbtb40Q6PCS8 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Zbtb40Q6PCS8 Gm26880-201ENSMUST00000181610 1318 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Zbtb40Q6PCS8 Pelp1-202ENSMUST00000135148 562 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Zbtb40Q6PCS8 Gm26871-201ENSMUST00000180593 700 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Zbtb40Q6PCS8 Gm37497-201ENSMUST00000195830 798 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Zbtb40Q6PCS8 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Zbtb40Q6PCS8 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Zbtb40Q6PCS8 N6amt1-203ENSMUST00000118310 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Zbtb40Q6PCS8 Gm16793-201ENSMUST00000181322 1680 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Zbtb40Q6PCS8 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Zbtb40Q6PCS8 Gm17705-201ENSMUST00000172285 1555 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Zbtb40Q6PCS8 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Zbtb40Q6PCS8 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Zbtb40Q6PCS8 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Zbtb40Q6PCS8 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Zbtb40Q6PCS8 AC153938.1-201ENSMUST00000220354 1425 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Zbtb40Q6PCS8 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Zbtb40Q6PCS8 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Zbtb40Q6PCS8 Rps13-203ENSMUST00000205490 1317 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Zbtb40Q6PCS8 Zfp157-202ENSMUST00000100524 869 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Zbtb40Q6PCS8 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Zbtb40Q6PCS8 Mrpl2-203ENSMUST00000113430 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Zbtb40Q6PCS8 Litaf-202ENSMUST00000117360 763 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Zbtb40Q6PCS8 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Zbtb40Q6PCS8 Gm2639-201ENSMUST00000156881 1297 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Zbtb40Q6PCS8 Gm16315-201ENSMUST00000163009 783 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Zbtb40Q6PCS8 Oaz1-207ENSMUST00000180036 1044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Zbtb40Q6PCS8 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
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Zbtb40Q6PCS8 Lsm7-208ENSMUST00000220225 1129 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Zbtb40Q6PCS8 Mdk-201ENSMUST00000028672 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Zbtb40Q6PCS8 Sit1-201ENSMUST00000030180 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Zbtb40Q6PCS8 Gm10339-203ENSMUST00000225409 1671 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Zbtb40Q6PCS8 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Zbtb40Q6PCS8 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Zbtb40Q6PCS8 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Zbtb40Q6PCS8 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Zbtb40Q6PCS8 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Zbtb40Q6PCS8 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Zbtb40Q6PCS8 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
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Zbtb40Q6PCS8 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Zbtb40Q6PCS8 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Zbtb40Q6PCS8 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Zbtb40Q6PCS8 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Zbtb40Q6PCS8 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Zbtb40Q6PCS8 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Zbtb40Q6PCS8 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Zbtb40Q6PCS8 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Zbtb40Q6PCS8 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Zbtb40Q6PCS8 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Zbtb40Q6PCS8 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Zbtb40Q6PCS8 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Zbtb40Q6PCS8 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Zbtb40Q6PCS8 Rnps1-202ENSMUST00000115371 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Zbtb40Q6PCS8 Arl5c-202ENSMUST00000107563 823 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Zbtb40Q6PCS8 Cabp5-202ENSMUST00000117400 1258 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Zbtb40Q6PCS8 Fuom-203ENSMUST00000121115 872 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Zbtb40Q6PCS8 Myl3-203ENSMUST00000136695 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Zbtb40Q6PCS8 Gm11754-201ENSMUST00000156576 661 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Zbtb40Q6PCS8 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Zbtb40Q6PCS8 Gm5370-201ENSMUST00000187187 574 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Zbtb40Q6PCS8 Gm45331-201ENSMUST00000209868 554 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Zbtb40Q6PCS8 Cebpe-201ENSMUST00000064290 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Zbtb40Q6PCS8 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Zbtb40Q6PCS8 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Zbtb40Q6PCS8 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Zbtb40Q6PCS8 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Zbtb40Q6PCS8 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Zbtb40Q6PCS8 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Zbtb40Q6PCS8 Tex13c2-201ENSMUST00000197237 1834 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.7 ms