Protein–RNA interactions for Protein: Q6P5B0

Rrp12, RRP12-like protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,295 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrp12Q6P5B0 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rrp12Q6P5B0 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rrp12Q6P5B0 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rrp12Q6P5B0 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rrp12Q6P5B0 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rrp12Q6P5B0 Mcpt9-201ENSMUST00000095798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rrp12Q6P5B0 Cyth4-201ENSMUST00000043069 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rrp12Q6P5B0 Sec14l5-201ENSMUST00000165810 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rrp12Q6P5B0 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rrp12Q6P5B0 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rrp12Q6P5B0 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rrp12Q6P5B0 Tbkbp1-204ENSMUST00000107615 3333 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rrp12Q6P5B0 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rrp12Q6P5B0 Gm42706-201ENSMUST00000199733 1910 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Rrp12Q6P5B0 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rrp12Q6P5B0 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rrp12Q6P5B0 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Rrp12Q6P5B0 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rrp12Q6P5B0 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Rrp12Q6P5B0 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Rrp12Q6P5B0 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Rrp12Q6P5B0 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rrp12Q6P5B0 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rrp12Q6P5B0 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rrp12Q6P5B0 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rrp12Q6P5B0 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rrp12Q6P5B0 Foxb1-201ENSMUST00000071281 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rrp12Q6P5B0 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rrp12Q6P5B0 AI661453-202ENSMUST00000150819 4866 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rrp12Q6P5B0 Polrmt-202ENSMUST00000159016 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rrp12Q6P5B0 Rtkn2-203ENSMUST00000117086 2246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rrp12Q6P5B0 Prx-203ENSMUST00000108355 5433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rrp12Q6P5B0 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rrp12Q6P5B0 Ptk2-201ENSMUST00000110036 4184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rrp12Q6P5B0 Adrb3-201ENSMUST00000081438 2795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rrp12Q6P5B0 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rrp12Q6P5B0 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rrp12Q6P5B0 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rrp12Q6P5B0 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Rrp12Q6P5B0 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rrp12Q6P5B0 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Rrp12Q6P5B0 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rrp12Q6P5B0 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rrp12Q6P5B0 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rrp12Q6P5B0 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rrp12Q6P5B0 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rrp12Q6P5B0 Necab1-201ENSMUST00000041606 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rrp12Q6P5B0 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rrp12Q6P5B0 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rrp12Q6P5B0 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rrp12Q6P5B0 Rbfox2-202ENSMUST00000111581 3072 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rrp12Q6P5B0 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rrp12Q6P5B0 Ppp1r16b-201ENSMUST00000045503 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rrp12Q6P5B0 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rrp12Q6P5B0 Stk25-201ENSMUST00000027498 4249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rrp12Q6P5B0 Pcdh19-202ENSMUST00000149154 10289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rrp12Q6P5B0 Fam43a-201ENSMUST00000059078 3075 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rrp12Q6P5B0 Tsku-205ENSMUST00000167405 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rrp12Q6P5B0 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rrp12Q6P5B0 Rasgef1a-202ENSMUST00000203482 2227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rrp12Q6P5B0 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rrp12Q6P5B0 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rrp12Q6P5B0 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rrp12Q6P5B0 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rrp12Q6P5B0 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rrp12Q6P5B0 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Rrp12Q6P5B0 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rrp12Q6P5B0 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Rrp12Q6P5B0 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rrp12Q6P5B0 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rrp12Q6P5B0 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rrp12Q6P5B0 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rrp12Q6P5B0 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rrp12Q6P5B0 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rrp12Q6P5B0 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rrp12Q6P5B0 Lipe-208ENSMUST00000206861 3171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rrp12Q6P5B0 Eme2-201ENSMUST00000119848 5226 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rrp12Q6P5B0 Sgk1-204ENSMUST00000120509 3096 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rrp12Q6P5B0 Tmem230-203ENSMUST00000110164 2957 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rrp12Q6P5B0 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rrp12Q6P5B0 Lrpprc-201ENSMUST00000112308 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rrp12Q6P5B0 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rrp12Q6P5B0 Fastkd3-201ENSMUST00000051784 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rrp12Q6P5B0 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rrp12Q6P5B0 Aldh6a1-201ENSMUST00000085192 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rrp12Q6P5B0 Tnrc6c-201ENSMUST00000026658 8724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rrp12Q6P5B0 Gm16582-201ENSMUST00000159627 1930 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rrp12Q6P5B0 Unc13a-201ENSMUST00000030170 10255 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rrp12Q6P5B0 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rrp12Q6P5B0 Nars-201ENSMUST00000025483 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rrp12Q6P5B0 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rrp12Q6P5B0 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rrp12Q6P5B0 Pcbp3-203ENSMUST00000105411 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rrp12Q6P5B0 Wnt7b-202ENSMUST00000109424 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rrp12Q6P5B0 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rrp12Q6P5B0 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rrp12Q6P5B0 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rrp12Q6P5B0 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rrp12Q6P5B0 Anks1b-221ENSMUST00000182786 3042 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rrp12Q6P5B0 Mynn-202ENSMUST00000192715 5555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms