Protein–RNA interactions for Protein: Q6KCD5

Nipbl, Nipped-B-like protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,798 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NipblQ6KCD5 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
NipblQ6KCD5 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC10.38□□□□□ -0.75
NipblQ6KCD5 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
NipblQ6KCD5 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
NipblQ6KCD5 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
NipblQ6KCD5 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
NipblQ6KCD5 Hsd3b4-202ENSMUST00000196861 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
NipblQ6KCD5 Gm10681-201ENSMUST00000058728 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
NipblQ6KCD5 1700084C06Rik-201ENSMUST00000135674 750 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
NipblQ6KCD5 Ube4bos1-202ENSMUST00000151896 1286 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
NipblQ6KCD5 Gm5637-201ENSMUST00000153890 1119 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
NipblQ6KCD5 Mcpt8-201ENSMUST00000015594 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
NipblQ6KCD5 Vmn1r-ps63-201ENSMUST00000174565 989 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
NipblQ6KCD5 Gstp-ps-201ENSMUST00000195526 631 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
NipblQ6KCD5 D3Ertd751e-215ENSMUST00000195882 680 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.37□□□□□ -0.75
NipblQ6KCD5 Gm44100-201ENSMUST00000204329 436 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
NipblQ6KCD5 Ifi35-201ENSMUST00000010502 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
NipblQ6KCD5 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
NipblQ6KCD5 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
NipblQ6KCD5 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
NipblQ6KCD5 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
NipblQ6KCD5 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
NipblQ6KCD5 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
NipblQ6KCD5 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
NipblQ6KCD5 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
NipblQ6KCD5 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
NipblQ6KCD5 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
NipblQ6KCD5 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
NipblQ6KCD5 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
NipblQ6KCD5 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
NipblQ6KCD5 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
NipblQ6KCD5 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
NipblQ6KCD5 Mir686-201ENSMUST00000102174 109 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
NipblQ6KCD5 Phlda2-201ENSMUST00000010904 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
NipblQ6KCD5 Clic3-202ENSMUST00000114265 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
NipblQ6KCD5 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
NipblQ6KCD5 Gm17087-201ENSMUST00000184183 471 ntAPPRIS P1 BASIC10.37□□□□□ -0.75
NipblQ6KCD5 Tomt-202ENSMUST00000106970 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
NipblQ6KCD5 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
NipblQ6KCD5 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
NipblQ6KCD5 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
NipblQ6KCD5 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
NipblQ6KCD5 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
NipblQ6KCD5 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
NipblQ6KCD5 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
NipblQ6KCD5 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
NipblQ6KCD5 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
NipblQ6KCD5 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
NipblQ6KCD5 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
NipblQ6KCD5 Etfrf1-207ENSMUST00000111726 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
NipblQ6KCD5 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
NipblQ6KCD5 Mpc1-202ENSMUST00000124023 555 ntTSL 2 BASIC10.37□□□□□ -0.75
NipblQ6KCD5 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC10.37□□□□□ -0.75
NipblQ6KCD5 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
NipblQ6KCD5 Gm28694-201ENSMUST00000190681 722 ntTSL 3 BASIC10.37□□□□□ -0.75
NipblQ6KCD5 Gm45564-201ENSMUST00000210460 530 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
NipblQ6KCD5 Itm2b-204ENSMUST00000228637 783 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
NipblQ6KCD5 Plp2-201ENSMUST00000033486 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
NipblQ6KCD5 Kcnk7-201ENSMUST00000052448 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
NipblQ6KCD5 Olfr156-202ENSMUST00000079465 1099 ntAPPRIS P1 BASIC10.37□□□□□ -0.75
NipblQ6KCD5 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
NipblQ6KCD5 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
NipblQ6KCD5 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
NipblQ6KCD5 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
NipblQ6KCD5 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
NipblQ6KCD5 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
NipblQ6KCD5 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
NipblQ6KCD5 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
NipblQ6KCD5 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
NipblQ6KCD5 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
NipblQ6KCD5 Gm25880-201ENSMUST00000104331 132 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
NipblQ6KCD5 Gm2991-201ENSMUST00000173338 480 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
NipblQ6KCD5 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
NipblQ6KCD5 Zfp709-202ENSMUST00000188374 717 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
NipblQ6KCD5 4930539M17Rik-201ENSMUST00000194792 846 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
NipblQ6KCD5 4930442H23Rik-201ENSMUST00000056086 1245 ntAPPRIS P1 BASIC10.36□□□□□ -0.75
NipblQ6KCD5 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
NipblQ6KCD5 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
NipblQ6KCD5 Tsta3-201ENSMUST00000023231 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
NipblQ6KCD5 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
NipblQ6KCD5 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
NipblQ6KCD5 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
NipblQ6KCD5 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
NipblQ6KCD5 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
NipblQ6KCD5 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
NipblQ6KCD5 Apoc1-202ENSMUST00000108451 532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
NipblQ6KCD5 Gm9431-201ENSMUST00000119765 1051 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
NipblQ6KCD5 Tnfrsf18-203ENSMUST00000122001 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
NipblQ6KCD5 Sncb-202ENSMUST00000134110 722 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.36□□□□□ -0.75
NipblQ6KCD5 Sct-204ENSMUST00000211667 506 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
NipblQ6KCD5 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
NipblQ6KCD5 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
NipblQ6KCD5 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
NipblQ6KCD5 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
NipblQ6KCD5 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
NipblQ6KCD5 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
NipblQ6KCD5 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
NipblQ6KCD5 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
NipblQ6KCD5 Saxo1-201ENSMUST00000030216 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
NipblQ6KCD5 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
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