Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZL1

Fgd6, FYVE, RhoGEF and PH domain-containing protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 1,399 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fgd6Q69ZL1 Rpl36-ps4-201ENSMUST00000179601 354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Fgd6Q69ZL1 Defb36-201ENSMUST00000058086 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Fgd6Q69ZL1 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Fgd6Q69ZL1 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Fgd6Q69ZL1 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Fgd6Q69ZL1 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Fgd6Q69ZL1 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Fgd6Q69ZL1 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Fgd6Q69ZL1 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Fgd6Q69ZL1 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Fgd6Q69ZL1 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Fgd6Q69ZL1 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Fgd6Q69ZL1 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Fgd6Q69ZL1 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Fgd6Q69ZL1 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Fgd6Q69ZL1 Gtf2ird1-209ENSMUST00000171794 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Fgd6Q69ZL1 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Fgd6Q69ZL1 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Fgd6Q69ZL1 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Fgd6Q69ZL1 Mapkapk5-204ENSMUST00000111783 1513 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Fgd6Q69ZL1 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Fgd6Q69ZL1 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Fgd6Q69ZL1 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Fgd6Q69ZL1 AC101677.2-201ENSMUST00000218733 741 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Fgd6Q69ZL1 Rpl17-ps3-201ENSMUST00000221295 556 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Fgd6Q69ZL1 AC154849.4-201ENSMUST00000224868 365 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Fgd6Q69ZL1 AC154222.2-201ENSMUST00000225848 607 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Fgd6Q69ZL1 Lcn6-201ENSMUST00000059693 1254 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Fgd6Q69ZL1 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Fgd6Q69ZL1 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Fgd6Q69ZL1 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Fgd6Q69ZL1 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Fgd6Q69ZL1 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Fgd6Q69ZL1 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Fgd6Q69ZL1 Slc25a22-223ENSMUST00000201710 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Fgd6Q69ZL1 Fcna-201ENSMUST00000028307 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Fgd6Q69ZL1 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Fgd6Q69ZL1 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Fgd6Q69ZL1 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Fgd6Q69ZL1 Spata48-201ENSMUST00000020410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Fgd6Q69ZL1 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Fgd6Q69ZL1 Jmjd8-201ENSMUST00000026832 2091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Fgd6Q69ZL1 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Fgd6Q69ZL1 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Fgd6Q69ZL1 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Fgd6Q69ZL1 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Fgd6Q69ZL1 Cyp2d26-201ENSMUST00000006094 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Fgd6Q69ZL1 Dnajb5-203ENSMUST00000098112 3093 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Fgd6Q69ZL1 Cstad-201ENSMUST00000102853 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Fgd6Q69ZL1 Limd2-203ENSMUST00000106875 936 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Fgd6Q69ZL1 BC026585-202ENSMUST00000119891 1125 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Fgd6Q69ZL1 Igfbp2-202ENSMUST00000120564 991 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Fgd6Q69ZL1 Gm39460-201ENSMUST00000215728 1266 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Fgd6Q69ZL1 AC135469.1-201ENSMUST00000225984 772 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Fgd6Q69ZL1 Ppie-201ENSMUST00000030404 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Fgd6Q69ZL1 Bcdin3d-201ENSMUST00000040313 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Fgd6Q69ZL1 Olfr462-201ENSMUST00000049743 936 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Fgd6Q69ZL1 Nudt7-201ENSMUST00000066514 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Fgd6Q69ZL1 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Fgd6Q69ZL1 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Fgd6Q69ZL1 Rec8-201ENSMUST00000002395 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Fgd6Q69ZL1 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Fgd6Q69ZL1 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Fgd6Q69ZL1 Strada-202ENSMUST00000103072 1517 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Fgd6Q69ZL1 Tssk5-201ENSMUST00000071119 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Fgd6Q69ZL1 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Fgd6Q69ZL1 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Fgd6Q69ZL1 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Fgd6Q69ZL1 Zfp82-201ENSMUST00000080834 2181 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Fgd6Q69ZL1 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Fgd6Q69ZL1 Trav13-1-201ENSMUST00000103651 331 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Fgd6Q69ZL1 Gm14704-201ENSMUST00000120300 874 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Fgd6Q69ZL1 Nudt6-207ENSMUST00000141438 899 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Fgd6Q69ZL1 Gm11755-201ENSMUST00000144096 891 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Fgd6Q69ZL1 1110018N20Rik-202ENSMUST00000147446 1162 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Fgd6Q69ZL1 Gm12589-201ENSMUST00000153767 638 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Fgd6Q69ZL1 Gm19353-201ENSMUST00000184561 445 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Fgd6Q69ZL1 2310047D07Rik-201ENSMUST00000189493 735 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Fgd6Q69ZL1 Gm38092-201ENSMUST00000195600 653 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Fgd6Q69ZL1 9230114K14Rik-203ENSMUST00000199547 437 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Fgd6Q69ZL1 Gzmn-202ENSMUST00000225535 989 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Fgd6Q69ZL1 Tead3-207ENSMUST00000219703 1320 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Fgd6Q69ZL1 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Fgd6Q69ZL1 Gm7789-202ENSMUST00000211273 1400 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Fgd6Q69ZL1 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Fgd6Q69ZL1 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Fgd6Q69ZL1 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Fgd6Q69ZL1 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Fgd6Q69ZL1 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Fgd6Q69ZL1 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Fgd6Q69ZL1 Ube2a-201ENSMUST00000016452 1732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Fgd6Q69ZL1 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Fgd6Q69ZL1 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Fgd6Q69ZL1 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Fgd6Q69ZL1 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Fgd6Q69ZL1 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Fgd6Q69ZL1 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Fgd6Q69ZL1 Hsd17b10-202ENSMUST00000112617 992 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Fgd6Q69ZL1 D630024D03Rik-201ENSMUST00000126265 720 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Fgd6Q69ZL1 Bcas3os2-201ENSMUST00000134305 661 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.8 ms