Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZB0

Lrrcc1, Leucine-rich repeat and coiled-coil domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,026 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrcc1Q69ZB0 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lrrcc1Q69ZB0 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lrrcc1Q69ZB0 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lrrcc1Q69ZB0 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lrrcc1Q69ZB0 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lrrcc1Q69ZB0 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lrrcc1Q69ZB0 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lrrcc1Q69ZB0 Pcdha11-203ENSMUST00000192447 4583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lrrcc1Q69ZB0 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lrrcc1Q69ZB0 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lrrcc1Q69ZB0 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lrrcc1Q69ZB0 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lrrcc1Q69ZB0 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lrrcc1Q69ZB0 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lrrcc1Q69ZB0 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lrrcc1Q69ZB0 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lrrcc1Q69ZB0 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lrrcc1Q69ZB0 Asxl1-201ENSMUST00000109790 6968 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lrrcc1Q69ZB0 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
Lrrcc1Q69ZB0 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Lrrcc1Q69ZB0 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Lrrcc1Q69ZB0 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lrrcc1Q69ZB0 Crybg1-202ENSMUST00000200401 7525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lrrcc1Q69ZB0 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lrrcc1Q69ZB0 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lrrcc1Q69ZB0 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lrrcc1Q69ZB0 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lrrcc1Q69ZB0 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lrrcc1Q69ZB0 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lrrcc1Q69ZB0 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lrrcc1Q69ZB0 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lrrcc1Q69ZB0 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lrrcc1Q69ZB0 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lrrcc1Q69ZB0 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Lrrcc1Q69ZB0 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lrrcc1Q69ZB0 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lrrcc1Q69ZB0 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lrrcc1Q69ZB0 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lrrcc1Q69ZB0 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lrrcc1Q69ZB0 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lrrcc1Q69ZB0 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lrrcc1Q69ZB0 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lrrcc1Q69ZB0 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lrrcc1Q69ZB0 Oxr1-204ENSMUST00000110297 4596 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lrrcc1Q69ZB0 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lrrcc1Q69ZB0 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lrrcc1Q69ZB0 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lrrcc1Q69ZB0 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lrrcc1Q69ZB0 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lrrcc1Q69ZB0 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lrrcc1Q69ZB0 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Lrrcc1Q69ZB0 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lrrcc1Q69ZB0 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lrrcc1Q69ZB0 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lrrcc1Q69ZB0 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Lrrcc1Q69ZB0 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lrrcc1Q69ZB0 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lrrcc1Q69ZB0 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Lrrcc1Q69ZB0 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Lrrcc1Q69ZB0 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lrrcc1Q69ZB0 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lrrcc1Q69ZB0 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lrrcc1Q69ZB0 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lrrcc1Q69ZB0 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lrrcc1Q69ZB0 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Lrrcc1Q69ZB0 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lrrcc1Q69ZB0 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lrrcc1Q69ZB0 Abcc6-201ENSMUST00000002850 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lrrcc1Q69ZB0 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lrrcc1Q69ZB0 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lrrcc1Q69ZB0 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lrrcc1Q69ZB0 Sp9-201ENSMUST00000090813 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lrrcc1Q69ZB0 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lrrcc1Q69ZB0 Arhgef17-201ENSMUST00000107032 10190 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lrrcc1Q69ZB0 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lrrcc1Q69ZB0 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lrrcc1Q69ZB0 Nfatc2-202ENSMUST00000074618 6637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lrrcc1Q69ZB0 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lrrcc1Q69ZB0 Sppl2a-201ENSMUST00000028844 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lrrcc1Q69ZB0 Zfp236-201ENSMUST00000171071 9626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lrrcc1Q69ZB0 Hdac5-203ENSMUST00000107151 4852 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lrrcc1Q69ZB0 Kif1c-202ENSMUST00000094499 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lrrcc1Q69ZB0 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lrrcc1Q69ZB0 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lrrcc1Q69ZB0 Nr4a3-201ENSMUST00000030025 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lrrcc1Q69ZB0 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lrrcc1Q69ZB0 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lrrcc1Q69ZB0 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lrrcc1Q69ZB0 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lrrcc1Q69ZB0 Rab11fip1-202ENSMUST00000054212 7965 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lrrcc1Q69ZB0 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lrrcc1Q69ZB0 Mbp-205ENSMUST00000091789 4797 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lrrcc1Q69ZB0 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lrrcc1Q69ZB0 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lrrcc1Q69ZB0 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lrrcc1Q69ZB0 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lrrcc1Q69ZB0 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lrrcc1Q69ZB0 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lrrcc1Q69ZB0 Ptgr2-205ENSMUST00000135001 1286 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lrrcc1Q69ZB0 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
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