Protein–RNA interactions for Protein: Q64213

Sf1, Splicing factor 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 653 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf1Q64213 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sf1Q64213 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sf1Q64213 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sf1Q64213 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sf1Q64213 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sf1Q64213 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Sf1Q64213 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sf1Q64213 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sf1Q64213 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Sf1Q64213 1700016P03Rik-201ENSMUST00000134252 863 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sf1Q64213 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sf1Q64213 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Sf1Q64213 Coprs-202ENSMUST00000209371 601 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sf1Q64213 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sf1Q64213 Gm17794-201ENSMUST00000220252 955 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Sf1Q64213 Gm25857-201ENSMUST00000082788 129 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Sf1Q64213 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Sf1Q64213 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Sf1Q64213 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sf1Q64213 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sf1Q64213 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sf1Q64213 Myh3-201ENSMUST00000007301 5992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sf1Q64213 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sf1Q64213 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sf1Q64213 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sf1Q64213 C530008M17Rik-202ENSMUST00000120639 6826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sf1Q64213 C530008M17Rik-211ENSMUST00000163347 6835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sf1Q64213 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Sf1Q64213 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sf1Q64213 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sf1Q64213 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sf1Q64213 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sf1Q64213 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sf1Q64213 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sf1Q64213 Nrxn1-201ENSMUST00000054059 4697 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sf1Q64213 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sf1Q64213 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sf1Q64213 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sf1Q64213 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sf1Q64213 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sf1Q64213 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sf1Q64213 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sf1Q64213 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sf1Q64213 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sf1Q64213 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sf1Q64213 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sf1Q64213 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sf1Q64213 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sf1Q64213 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sf1Q64213 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sf1Q64213 Dab2ip-206ENSMUST00000112987 6287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sf1Q64213 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sf1Q64213 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sf1Q64213 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Sf1Q64213 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sf1Q64213 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sf1Q64213 Gm16194-204ENSMUST00000141797 475 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sf1Q64213 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sf1Q64213 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sf1Q64213 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sf1Q64213 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
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Sf1Q64213 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sf1Q64213 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Sf1Q64213 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
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Sf1Q64213 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sf1Q64213 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sf1Q64213 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sf1Q64213 Pxdn-202ENSMUST00000122328 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sf1Q64213 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sf1Q64213 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sf1Q64213 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sf1Q64213 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sf1Q64213 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Sf1Q64213 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sf1Q64213 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sf1Q64213 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sf1Q64213 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sf1Q64213 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sf1Q64213 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sf1Q64213 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sf1Q64213 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sf1Q64213 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sf1Q64213 Dido1-207ENSMUST00000130986 4898 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sf1Q64213 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sf1Q64213 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sf1Q64213 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sf1Q64213 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sf1Q64213 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sf1Q64213 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sf1Q64213 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sf1Q64213 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sf1Q64213 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sf1Q64213 Myh3-203ENSMUST00000165221 5994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sf1Q64213 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sf1Q64213 Zc3h4-201ENSMUST00000098789 6039 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sf1Q64213 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sf1Q64213 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43 ms