Protein–RNA interactions for Protein: Q62170

Selplg, P-selectin glycoprotein ligand 1, mousemouse

Predictions only

Length 397 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SelplgQ62170 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
SelplgQ62170 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
SelplgQ62170 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
SelplgQ62170 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC10.76□□□□□ -0.69
SelplgQ62170 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
SelplgQ62170 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
SelplgQ62170 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
SelplgQ62170 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
SelplgQ62170 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
SelplgQ62170 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
SelplgQ62170 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
SelplgQ62170 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
SelplgQ62170 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
SelplgQ62170 Fam171a1-201ENSMUST00000062934 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
SelplgQ62170 Lrrc8e-201ENSMUST00000053035 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
SelplgQ62170 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
SelplgQ62170 Azi2-201ENSMUST00000044454 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
SelplgQ62170 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
SelplgQ62170 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
SelplgQ62170 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
SelplgQ62170 Slc7a15-201ENSMUST00000036938 1907 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
SelplgQ62170 Gnaz-202ENSMUST00000159991 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
SelplgQ62170 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
SelplgQ62170 Clspn-201ENSMUST00000048391 5027 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
SelplgQ62170 Abca3-201ENSMUST00000039013 6476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
SelplgQ62170 Kif26b-201ENSMUST00000160789 6216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
SelplgQ62170 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
SelplgQ62170 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
SelplgQ62170 Ptp4a3-204ENSMUST00000167582 2640 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
SelplgQ62170 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
SelplgQ62170 Taf1c-201ENSMUST00000093099 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
SelplgQ62170 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
SelplgQ62170 Prpf8-201ENSMUST00000018449 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
SelplgQ62170 Rusc1-201ENSMUST00000052539 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
SelplgQ62170 5830432E09Rik-203ENSMUST00000210953 2428 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
SelplgQ62170 Lrrc8c-201ENSMUST00000067924 6976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
SelplgQ62170 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
SelplgQ62170 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
SelplgQ62170 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
SelplgQ62170 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
SelplgQ62170 Slc6a8-201ENSMUST00000033752 3964 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
SelplgQ62170 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
SelplgQ62170 Spib-201ENSMUST00000035323 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
SelplgQ62170 5031415H12Rik-201ENSMUST00000181546 2481 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
SelplgQ62170 Dysf-212ENSMUST00000203695 6504 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
SelplgQ62170 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
SelplgQ62170 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
SelplgQ62170 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
SelplgQ62170 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
SelplgQ62170 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
SelplgQ62170 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
SelplgQ62170 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
SelplgQ62170 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
SelplgQ62170 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
SelplgQ62170 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
SelplgQ62170 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
SelplgQ62170 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
SelplgQ62170 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
SelplgQ62170 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
SelplgQ62170 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
SelplgQ62170 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
SelplgQ62170 Cul9-204ENSMUST00000182485 7848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
SelplgQ62170 Grhl2-201ENSMUST00000022895 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
SelplgQ62170 Vwa7-201ENSMUST00000007245 4313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
SelplgQ62170 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
SelplgQ62170 Gm5422-201ENSMUST00000050717 2721 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
SelplgQ62170 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
SelplgQ62170 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC10.75□□□□□ -0.69
SelplgQ62170 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
SelplgQ62170 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
SelplgQ62170 Cux1-204ENSMUST00000175975 10945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
SelplgQ62170 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
SelplgQ62170 Tbc1d1-204ENSMUST00000121370 5419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
SelplgQ62170 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
SelplgQ62170 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
SelplgQ62170 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
SelplgQ62170 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
SelplgQ62170 Olfr71-202ENSMUST00000107862 2587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.69
SelplgQ62170 Rbpj-207ENSMUST00000201883 4961 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
SelplgQ62170 Myc-205ENSMUST00000161976 2338 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
SelplgQ62170 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
SelplgQ62170 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
SelplgQ62170 Gm26593-201ENSMUST00000181848 1970 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
SelplgQ62170 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
SelplgQ62170 Rnft2-202ENSMUST00000121369 4431 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
SelplgQ62170 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
SelplgQ62170 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
SelplgQ62170 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
SelplgQ62170 Cyyr1-201ENSMUST00000114174 5464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
SelplgQ62170 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
SelplgQ62170 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
SelplgQ62170 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
SelplgQ62170 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
SelplgQ62170 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
SelplgQ62170 A430093F15Rik-204ENSMUST00000186596 2115 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
SelplgQ62170 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
SelplgQ62170 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
SelplgQ62170 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
SelplgQ62170 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
SelplgQ62170 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.7 ms