Protein–RNA interactions for Protein: Q60976

Jrk, Jerky protein, mousemouse

Predictions only

Length 557 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
JrkQ60976 Mpp3-202ENSMUST00000100400 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
JrkQ60976 Ralgps2-214ENSMUST00000191605 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
JrkQ60976 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
JrkQ60976 Sema4a-214ENSMUST00000166237 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
JrkQ60976 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
JrkQ60976 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
JrkQ60976 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
JrkQ60976 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
JrkQ60976 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
JrkQ60976 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
JrkQ60976 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
JrkQ60976 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
JrkQ60976 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
JrkQ60976 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
JrkQ60976 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
JrkQ60976 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
JrkQ60976 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
JrkQ60976 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
JrkQ60976 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
JrkQ60976 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
JrkQ60976 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
JrkQ60976 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
JrkQ60976 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
JrkQ60976 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
JrkQ60976 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
JrkQ60976 Mark2-215ENSMUST00000168872 2124 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
JrkQ60976 Zfp354a-202ENSMUST00000102766 2592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
JrkQ60976 Gm19434-201ENSMUST00000204330 2573 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
JrkQ60976 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
JrkQ60976 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
JrkQ60976 Rasgef1a-202ENSMUST00000203482 2227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
JrkQ60976 Cpn1-201ENSMUST00000026210 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
JrkQ60976 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
JrkQ60976 Paupar-201ENSMUST00000194826 3482 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
JrkQ60976 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
JrkQ60976 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
JrkQ60976 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
JrkQ60976 Dars2-201ENSMUST00000035430 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
JrkQ60976 Gm15082-201ENSMUST00000147045 1960 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
JrkQ60976 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
JrkQ60976 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
JrkQ60976 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
JrkQ60976 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
JrkQ60976 Atxn7l3b-201ENSMUST00000099276 3566 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
JrkQ60976 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
JrkQ60976 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
JrkQ60976 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
JrkQ60976 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
JrkQ60976 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
JrkQ60976 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
JrkQ60976 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
JrkQ60976 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
JrkQ60976 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
JrkQ60976 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
JrkQ60976 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
JrkQ60976 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
JrkQ60976 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
JrkQ60976 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
JrkQ60976 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
JrkQ60976 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
JrkQ60976 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
JrkQ60976 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
JrkQ60976 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
JrkQ60976 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
JrkQ60976 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
JrkQ60976 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
JrkQ60976 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
JrkQ60976 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
JrkQ60976 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
JrkQ60976 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
JrkQ60976 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
JrkQ60976 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
JrkQ60976 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
JrkQ60976 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
JrkQ60976 Gm853-201ENSMUST00000023884 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
JrkQ60976 Hnrnph2-202ENSMUST00000059297 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
JrkQ60976 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
JrkQ60976 Kdm4b-201ENSMUST00000025036 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
JrkQ60976 Gm7114-201ENSMUST00000190159 1789 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
JrkQ60976 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
JrkQ60976 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
JrkQ60976 Gabpb1-204ENSMUST00000103227 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
JrkQ60976 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
JrkQ60976 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
JrkQ60976 Nif3l1-206ENSMUST00000171597 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
JrkQ60976 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
JrkQ60976 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
JrkQ60976 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
JrkQ60976 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
JrkQ60976 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
JrkQ60976 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
JrkQ60976 Gimap3-202ENSMUST00000204036 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
JrkQ60976 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
JrkQ60976 Mip-201ENSMUST00000026455 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
JrkQ60976 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
JrkQ60976 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
JrkQ60976 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
JrkQ60976 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
JrkQ60976 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
JrkQ60976 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.2 ms