Protein–RNA interactions for Protein: Q60765

Atf3, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-3, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atf3Q60765 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Atf3Q60765 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Atf3Q60765 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Atf3Q60765 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Atf3Q60765 Hist1h4b-201ENSMUST00000102965 397 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Atf3Q60765 Gm13587-201ENSMUST00000152645 366 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Atf3Q60765 Mcpt8-201ENSMUST00000015594 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Atf3Q60765 Gm43378-201ENSMUST00000199336 582 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Atf3Q60765 Mt3-203ENSMUST00000211930 477 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Atf3Q60765 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Atf3Q60765 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Atf3Q60765 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Atf3Q60765 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Atf3Q60765 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Atf3Q60765 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Atf3Q60765 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Atf3Q60765 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Atf3Q60765 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Atf3Q60765 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Atf3Q60765 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Atf3Q60765 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Atf3Q60765 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Atf3Q60765 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Atf3Q60765 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Atf3Q60765 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Atf3Q60765 Gm26799-201ENSMUST00000180959 1361 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Atf3Q60765 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Atf3Q60765 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Atf3Q60765 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Atf3Q60765 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Atf3Q60765 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Atf3Q60765 Pmp22-203ENSMUST00000108701 723 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Atf3Q60765 Zfp157-203ENSMUST00000110912 886 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Atf3Q60765 Gm5846-201ENSMUST00000193146 1414 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Atf3Q60765 Pcgf5-203ENSMUST00000224679 1269 ntAPPRIS P5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Atf3Q60765 Duoxa2-201ENSMUST00000028656 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Atf3Q60765 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Atf3Q60765 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Atf3Q60765 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Atf3Q60765 Ccdc94-201ENSMUST00000086869 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Atf3Q60765 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Atf3Q60765 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Atf3Q60765 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Atf3Q60765 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Atf3Q60765 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Atf3Q60765 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Atf3Q60765 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Atf3Q60765 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Atf3Q60765 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Atf3Q60765 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Atf3Q60765 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Atf3Q60765 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Atf3Q60765 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Atf3Q60765 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Atf3Q60765 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Atf3Q60765 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Atf3Q60765 Has2os-201ENSMUST00000125401 485 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Atf3Q60765 1700030C14Rik-201ENSMUST00000139912 756 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Atf3Q60765 Gm16099-202ENSMUST00000151873 660 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Atf3Q60765 1700020N18Rik-201ENSMUST00000188956 547 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Atf3Q60765 Gm5896-201ENSMUST00000189662 1024 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Atf3Q60765 Gm10308-201ENSMUST00000095183 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Atf3Q60765 Gm28590-201ENSMUST00000185679 1609 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Atf3Q60765 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Atf3Q60765 Ccnc-204ENSMUST00000120679 1453 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Atf3Q60765 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Atf3Q60765 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Atf3Q60765 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Atf3Q60765 Banp-210ENSMUST00000173254 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Atf3Q60765 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Atf3Q60765 Apoc1-202ENSMUST00000108451 532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Atf3Q60765 Cabp1-203ENSMUST00000112112 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Atf3Q60765 Gm6447-201ENSMUST00000118905 835 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Atf3Q60765 Gm11331-201ENSMUST00000119764 288 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Atf3Q60765 Gm13716-201ENSMUST00000126401 808 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Atf3Q60765 2810405F17Rik-201ENSMUST00000189334 1117 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Atf3Q60765 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Atf3Q60765 AC154680.1-201ENSMUST00000224376 859 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Atf3Q60765 Lcn10-201ENSMUST00000058912 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Atf3Q60765 Rpl10a-ps2-201ENSMUST00000071184 642 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Atf3Q60765 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Atf3Q60765 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Atf3Q60765 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Atf3Q60765 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Atf3Q60765 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Atf3Q60765 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Atf3Q60765 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Atf3Q60765 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Atf3Q60765 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Atf3Q60765 Gm10097-201ENSMUST00000180100 2784 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Atf3Q60765 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Atf3Q60765 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Atf3Q60765 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Atf3Q60765 Gm23270-201ENSMUST00000104055 131 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Atf3Q60765 E130114P18Rik-202ENSMUST00000107068 1132 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Atf3Q60765 Pigp-205ENSMUST00000113917 805 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Atf3Q60765 Lamr1-ps1-201ENSMUST00000119759 874 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Atf3Q60765 Mrps17-205ENSMUST00000119985 859 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Atf3Q60765 Ggnbp1-202ENSMUST00000122106 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Atf3Q60765 Gm11985-201ENSMUST00000122910 1007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms