Protein–RNA interactions for Protein: Q45KJ6

Lin28b, Protein lin-28 homolog B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 247 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lin28bQ45KJ6 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Lin28bQ45KJ6 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Lin28bQ45KJ6 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Lin28bQ45KJ6 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Lin28bQ45KJ6 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Lin28bQ45KJ6 Gm11684-201ENSMUST00000144975 757 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Lin28bQ45KJ6 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Lin28bQ45KJ6 Oprm1-229ENSMUST00000152674 1179 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Lin28bQ45KJ6 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Lin28bQ45KJ6 Gm7561-201ENSMUST00000211203 886 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Lin28bQ45KJ6 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Lin28bQ45KJ6 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Lin28bQ45KJ6 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Lin28bQ45KJ6 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Lin28bQ45KJ6 Zscan30-202ENSMUST00000224144 1458 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Lin28bQ45KJ6 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Lin28bQ45KJ6 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Lin28bQ45KJ6 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Lin28bQ45KJ6 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Lin28bQ45KJ6 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Lin28bQ45KJ6 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Lin28bQ45KJ6 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Lin28bQ45KJ6 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Lin28bQ45KJ6 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Lin28bQ45KJ6 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Lin28bQ45KJ6 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Lin28bQ45KJ6 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Lin28bQ45KJ6 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Lin28bQ45KJ6 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Lin28bQ45KJ6 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Lin28bQ45KJ6 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Lin28bQ45KJ6 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Lin28bQ45KJ6 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Lin28bQ45KJ6 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Lin28bQ45KJ6 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Lin28bQ45KJ6 Pnpo-202ENSMUST00000107629 681 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Lin28bQ45KJ6 Zbtb32-201ENSMUST00000108150 854 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Lin28bQ45KJ6 Tpd52l2-203ENSMUST00000108799 985 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Lin28bQ45KJ6 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Lin28bQ45KJ6 Neat1-203ENSMUST00000174829 1030 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Lin28bQ45KJ6 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Lin28bQ45KJ6 1700094J05Rik-202ENSMUST00000190491 997 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Lin28bQ45KJ6 Gm20219-201ENSMUST00000209718 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Lin28bQ45KJ6 Gm6983-201ENSMUST00000214912 628 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Lin28bQ45KJ6 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Lin28bQ45KJ6 Gm6091-201ENSMUST00000098307 165 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Lin28bQ45KJ6 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Lin28bQ45KJ6 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Lin28bQ45KJ6 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Lin28bQ45KJ6 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Lin28bQ45KJ6 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Lin28bQ45KJ6 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Lin28bQ45KJ6 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Lin28bQ45KJ6 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Lin28bQ45KJ6 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Lin28bQ45KJ6 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Lin28bQ45KJ6 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC13□□□□□ -0.33
Lin28bQ45KJ6 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Lin28bQ45KJ6 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Lin28bQ45KJ6 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Lin28bQ45KJ6 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Lin28bQ45KJ6 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Lin28bQ45KJ6 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Lin28bQ45KJ6 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Lin28bQ45KJ6 Nmi-202ENSMUST00000112705 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Lin28bQ45KJ6 Gm12957-201ENSMUST00000117835 377 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Lin28bQ45KJ6 Gm11814-201ENSMUST00000119515 929 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Lin28bQ45KJ6 Gm27847-201ENSMUST00000183711 107 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Lin28bQ45KJ6 Gm27375-201ENSMUST00000183799 107 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Lin28bQ45KJ6 2610306M01Rik-201ENSMUST00000185414 1042 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Lin28bQ45KJ6 Gm43240-201ENSMUST00000198543 630 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Lin28bQ45KJ6 Gm42906-201ENSMUST00000202365 408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Lin28bQ45KJ6 Gm867-202ENSMUST00000219979 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Lin28bQ45KJ6 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Lin28bQ45KJ6 AC140451.2-201ENSMUST00000228030 664 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Lin28bQ45KJ6 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Lin28bQ45KJ6 Rps21-201ENSMUST00000059080 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Lin28bQ45KJ6 Cracr2a-201ENSMUST00000071563 1094 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Lin28bQ45KJ6 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Lin28bQ45KJ6 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Lin28bQ45KJ6 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Lin28bQ45KJ6 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Lin28bQ45KJ6 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Lin28bQ45KJ6 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Lin28bQ45KJ6 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Lin28bQ45KJ6 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Lin28bQ45KJ6 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Lin28bQ45KJ6 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Lin28bQ45KJ6 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Lin28bQ45KJ6 4933435G04Rik-201ENSMUST00000205892 2108 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Lin28bQ45KJ6 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Lin28bQ45KJ6 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Lin28bQ45KJ6 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Lin28bQ45KJ6 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Lin28bQ45KJ6 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Lin28bQ45KJ6 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Lin28bQ45KJ6 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Lin28bQ45KJ6 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Lin28bQ45KJ6 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Lin28bQ45KJ6 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.2 ms