Protein–RNA interactions for Protein: Q3UWL8

Pfdn4, Prefoldin subunit 4, mousemouse

Predictions only

Length 134 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pfdn4Q3UWL8 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pfdn4Q3UWL8 Aqr-201ENSMUST00000043160 4888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pfdn4Q3UWL8 Gm37105-201ENSMUST00000192251 2085 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Pfdn4Q3UWL8 Epm2aip1-201ENSMUST00000060711 7149 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pfdn4Q3UWL8 Mapt-204ENSMUST00000106992 5253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pfdn4Q3UWL8 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pfdn4Q3UWL8 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Pfdn4Q3UWL8 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pfdn4Q3UWL8 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pfdn4Q3UWL8 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pfdn4Q3UWL8 Rbpjl-201ENSMUST00000017151 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pfdn4Q3UWL8 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Pfdn4Q3UWL8 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Pfdn4Q3UWL8 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Pfdn4Q3UWL8 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pfdn4Q3UWL8 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pfdn4Q3UWL8 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pfdn4Q3UWL8 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pfdn4Q3UWL8 Rsbn1l-202ENSMUST00000196780 7651 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pfdn4Q3UWL8 Plcd3-201ENSMUST00000103077 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pfdn4Q3UWL8 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pfdn4Q3UWL8 Snph-202ENSMUST00000094456 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pfdn4Q3UWL8 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pfdn4Q3UWL8 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pfdn4Q3UWL8 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pfdn4Q3UWL8 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pfdn4Q3UWL8 Mrpl3-201ENSMUST00000035177 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pfdn4Q3UWL8 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pfdn4Q3UWL8 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pfdn4Q3UWL8 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pfdn4Q3UWL8 Glis2-201ENSMUST00000014447 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pfdn4Q3UWL8 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pfdn4Q3UWL8 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pfdn4Q3UWL8 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pfdn4Q3UWL8 Rab10os-202ENSMUST00000177896 2872 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pfdn4Q3UWL8 Sema6d-206ENSMUST00000103239 6225 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pfdn4Q3UWL8 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pfdn4Q3UWL8 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pfdn4Q3UWL8 Gm37644-201ENSMUST00000192190 2270 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Pfdn4Q3UWL8 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pfdn4Q3UWL8 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pfdn4Q3UWL8 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pfdn4Q3UWL8 Ip6k1-201ENSMUST00000035214 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pfdn4Q3UWL8 Stard8-201ENSMUST00000036606 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pfdn4Q3UWL8 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pfdn4Q3UWL8 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pfdn4Q3UWL8 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pfdn4Q3UWL8 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Pfdn4Q3UWL8 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pfdn4Q3UWL8 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Pfdn4Q3UWL8 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Pfdn4Q3UWL8 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pfdn4Q3UWL8 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pfdn4Q3UWL8 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pfdn4Q3UWL8 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pfdn4Q3UWL8 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pfdn4Q3UWL8 Corin-201ENSMUST00000005352 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pfdn4Q3UWL8 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pfdn4Q3UWL8 4930430F08Rik-201ENSMUST00000054471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pfdn4Q3UWL8 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Pfdn4Q3UWL8 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pfdn4Q3UWL8 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pfdn4Q3UWL8 Fzd4-201ENSMUST00000058755 6720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pfdn4Q3UWL8 Ncoa7-201ENSMUST00000068567 5105 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pfdn4Q3UWL8 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pfdn4Q3UWL8 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pfdn4Q3UWL8 Dtnb-223ENSMUST00000174547 2112 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pfdn4Q3UWL8 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pfdn4Q3UWL8 Ciz1-202ENSMUST00000113331 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pfdn4Q3UWL8 Pcnx2-201ENSMUST00000047239 7236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pfdn4Q3UWL8 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pfdn4Q3UWL8 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pfdn4Q3UWL8 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pfdn4Q3UWL8 C5ar1-201ENSMUST00000050770 2481 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pfdn4Q3UWL8 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pfdn4Q3UWL8 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pfdn4Q3UWL8 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pfdn4Q3UWL8 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pfdn4Q3UWL8 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pfdn4Q3UWL8 Ncald-211ENSMUST00000168992 3538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pfdn4Q3UWL8 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Pfdn4Q3UWL8 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pfdn4Q3UWL8 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Pfdn4Q3UWL8 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pfdn4Q3UWL8 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pfdn4Q3UWL8 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pfdn4Q3UWL8 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pfdn4Q3UWL8 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Pfdn4Q3UWL8 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pfdn4Q3UWL8 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Pfdn4Q3UWL8 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pfdn4Q3UWL8 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pfdn4Q3UWL8 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pfdn4Q3UWL8 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pfdn4Q3UWL8 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pfdn4Q3UWL8 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pfdn4Q3UWL8 Kars-202ENSMUST00000093120 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pfdn4Q3UWL8 Uggt2-212ENSMUST00000156203 6456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pfdn4Q3UWL8 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pfdn4Q3UWL8 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.5 ms