Protein–RNA interactions for Protein: Q3ULW6

Ccdc33, Coiled-coil domain-containing protein 33, mousemouse

Predictions only

Length 985 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc33Q3ULW6 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc33Q3ULW6 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc33Q3ULW6 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc33Q3ULW6 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc33Q3ULW6 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc33Q3ULW6 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc33Q3ULW6 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc33Q3ULW6 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc33Q3ULW6 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc33Q3ULW6 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc33Q3ULW6 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc33Q3ULW6 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc33Q3ULW6 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc33Q3ULW6 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc33Q3ULW6 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc33Q3ULW6 St6galnac6-209ENSMUST00000131229 1013 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc33Q3ULW6 Dnase2a-206ENSMUST00000145292 678 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc33Q3ULW6 Gm26602-201ENSMUST00000181321 285 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc33Q3ULW6 Gm28511-201ENSMUST00000191594 450 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc33Q3ULW6 Gm33474-201ENSMUST00000199486 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc33Q3ULW6 Csrp3-201ENSMUST00000032658 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc33Q3ULW6 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc33Q3ULW6 Mypopos-202ENSMUST00000205975 2321 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc33Q3ULW6 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc33Q3ULW6 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc33Q3ULW6 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc33Q3ULW6 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc33Q3ULW6 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc33Q3ULW6 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc33Q3ULW6 Vax2os-201ENSMUST00000123402 1435 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc33Q3ULW6 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc33Q3ULW6 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc33Q3ULW6 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc33Q3ULW6 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc33Q3ULW6 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc33Q3ULW6 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc33Q3ULW6 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc33Q3ULW6 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc33Q3ULW6 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc33Q3ULW6 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc33Q3ULW6 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc33Q3ULW6 Gm14723-201ENSMUST00000118686 215 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc33Q3ULW6 Gm2639-201ENSMUST00000156881 1297 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc33Q3ULW6 Gm24644-201ENSMUST00000157114 139 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc33Q3ULW6 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc33Q3ULW6 Naa60-209ENSMUST00000175809 279 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc33Q3ULW6 1600014C10Rik-203ENSMUST00000177983 403 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc33Q3ULW6 Crip2-206ENSMUST00000200380 864 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc33Q3ULW6 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc33Q3ULW6 Fxyd1-217ENSMUST00000206860 594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc33Q3ULW6 Reep1-202ENSMUST00000212631 953 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc33Q3ULW6 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc33Q3ULW6 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc33Q3ULW6 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc33Q3ULW6 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc33Q3ULW6 Gm13050-201ENSMUST00000122149 1345 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc33Q3ULW6 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc33Q3ULW6 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc33Q3ULW6 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc33Q3ULW6 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc33Q3ULW6 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc33Q3ULW6 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc33Q3ULW6 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc33Q3ULW6 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc33Q3ULW6 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ccdc33Q3ULW6 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ccdc33Q3ULW6 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ccdc33Q3ULW6 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ccdc33Q3ULW6 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ccdc33Q3ULW6 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ccdc33Q3ULW6 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc33Q3ULW6 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc33Q3ULW6 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc33Q3ULW6 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc33Q3ULW6 Gm14508-201ENSMUST00000127049 901 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc33Q3ULW6 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc33Q3ULW6 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc33Q3ULW6 2900093K20Rik-201ENSMUST00000190930 567 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc33Q3ULW6 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc33Q3ULW6 Rad51d-202ENSMUST00000021033 1201 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc33Q3ULW6 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc33Q3ULW6 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc33Q3ULW6 CU024892.2-201ENSMUST00000224608 832 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc33Q3ULW6 AC154276.1-201ENSMUST00000228874 1299 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc33Q3ULW6 B230118H07Rik-202ENSMUST00000099682 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc33Q3ULW6 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc33Q3ULW6 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc33Q3ULW6 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc33Q3ULW6 Psmb9-204ENSMUST00000174576 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc33Q3ULW6 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc33Q3ULW6 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc33Q3ULW6 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc33Q3ULW6 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc33Q3ULW6 AC153938.1-201ENSMUST00000220354 1425 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc33Q3ULW6 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc33Q3ULW6 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc33Q3ULW6 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc33Q3ULW6 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc33Q3ULW6 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc33Q3ULW6 Gm26878-201ENSMUST00000181778 1644 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.9 ms