Protein–RNA interactions for Protein: Q3UDE2

Ttll12, Tubulin--tyrosine ligase-like protein 12, mousemouse

Predictions only

Length 639 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttll12Q3UDE2 Gm16177-201ENSMUST00000120728 718 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Ttll12Q3UDE2 Gm14508-201ENSMUST00000127049 901 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ttll12Q3UDE2 E130006D01Rik-203ENSMUST00000137398 906 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ttll12Q3UDE2 Ablim2-213ENSMUST00000150146 415 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ttll12Q3UDE2 Gm17180-201ENSMUST00000172211 435 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ttll12Q3UDE2 1700065I16Rik-202ENSMUST00000185477 813 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ttll12Q3UDE2 Rpl10-202ENSMUST00000074085 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ttll12Q3UDE2 Rpl10-201ENSMUST00000008826 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ttll12Q3UDE2 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ttll12Q3UDE2 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ttll12Q3UDE2 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ttll12Q3UDE2 Fam118b-203ENSMUST00000121564 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ttll12Q3UDE2 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ttll12Q3UDE2 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ttll12Q3UDE2 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ttll12Q3UDE2 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ttll12Q3UDE2 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ttll12Q3UDE2 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ttll12Q3UDE2 Gm38100-201ENSMUST00000194391 1329 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ttll12Q3UDE2 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ttll12Q3UDE2 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ttll12Q3UDE2 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ttll12Q3UDE2 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ttll12Q3UDE2 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ttll12Q3UDE2 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ttll12Q3UDE2 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ttll12Q3UDE2 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ttll12Q3UDE2 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ttll12Q3UDE2 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ttll12Q3UDE2 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ttll12Q3UDE2 Inca1-203ENSMUST00000108542 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ttll12Q3UDE2 Gm15351-201ENSMUST00000123920 419 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ttll12Q3UDE2 Sbk3-201ENSMUST00000133272 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ttll12Q3UDE2 Gm15444-201ENSMUST00000148335 388 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ttll12Q3UDE2 Hoxb5os-202ENSMUST00000150698 596 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ttll12Q3UDE2 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ttll12Q3UDE2 Gm26602-201ENSMUST00000181321 285 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ttll12Q3UDE2 1700120C18Rik-201ENSMUST00000182952 985 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ttll12Q3UDE2 Gm38241-201ENSMUST00000192641 898 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Ttll12Q3UDE2 Gm38266-201ENSMUST00000194931 421 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Ttll12Q3UDE2 Gm19184-201ENSMUST00000196798 928 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Ttll12Q3UDE2 9230020A06Rik-204ENSMUST00000215201 1116 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ttll12Q3UDE2 Tpd52l1-205ENSMUST00000215515 857 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ttll12Q3UDE2 Comt-201ENSMUST00000000335 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ttll12Q3UDE2 Txn2-201ENSMUST00000005487 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ttll12Q3UDE2 Mapt-201ENSMUST00000100347 1362 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ttll12Q3UDE2 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ttll12Q3UDE2 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ttll12Q3UDE2 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ttll12Q3UDE2 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Ttll12Q3UDE2 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Ttll12Q3UDE2 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Ttll12Q3UDE2 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Ttll12Q3UDE2 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ttll12Q3UDE2 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Ttll12Q3UDE2 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ttll12Q3UDE2 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ttll12Q3UDE2 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ttll12Q3UDE2 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ttll12Q3UDE2 Wfdc9-202ENSMUST00000109335 547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ttll12Q3UDE2 Gm11803-201ENSMUST00000119966 444 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Ttll12Q3UDE2 Abhd14a-202ENSMUST00000171678 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ttll12Q3UDE2 1700092C10Rik-201ENSMUST00000172547 585 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ttll12Q3UDE2 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Ttll12Q3UDE2 Gm3961-201ENSMUST00000204425 994 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Ttll12Q3UDE2 Fxyd1-217ENSMUST00000206860 594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ttll12Q3UDE2 1700127F24Rik-201ENSMUST00000221685 604 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Ttll12Q3UDE2 Mrps22-201ENSMUST00000035034 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ttll12Q3UDE2 Atpif1-201ENSMUST00000067496 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ttll12Q3UDE2 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ttll12Q3UDE2 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ttll12Q3UDE2 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ttll12Q3UDE2 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ttll12Q3UDE2 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ttll12Q3UDE2 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ttll12Q3UDE2 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ttll12Q3UDE2 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ttll12Q3UDE2 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ttll12Q3UDE2 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ttll12Q3UDE2 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ttll12Q3UDE2 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ttll12Q3UDE2 Mrpl2-203ENSMUST00000113430 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ttll12Q3UDE2 Rps2-ps9-201ENSMUST00000121414 817 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Ttll12Q3UDE2 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Ttll12Q3UDE2 Gm12050-201ENSMUST00000127483 615 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ttll12Q3UDE2 Rdh18-ps-201ENSMUST00000137395 944 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Ttll12Q3UDE2 Rdh18-ps-202ENSMUST00000143917 953 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ttll12Q3UDE2 Spdye4b-202ENSMUST00000159781 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ttll12Q3UDE2 Gm27516-201ENSMUST00000184237 98 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Ttll12Q3UDE2 Ssr2-202ENSMUST00000192495 620 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ttll12Q3UDE2 1600017P15Rik-202ENSMUST00000193960 890 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Ttll12Q3UDE2 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Ttll12Q3UDE2 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ttll12Q3UDE2 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ttll12Q3UDE2 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ttll12Q3UDE2 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ttll12Q3UDE2 4933435G04Rik-201ENSMUST00000205892 2108 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Ttll12Q3UDE2 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ttll12Q3UDE2 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ttll12Q3UDE2 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms