Protein–RNA interactions for Protein: Q3U155

Ccdc174, Coiled-coil domain-containing protein 174, mousemouse

Predictions only

Length 467 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc174Q3U155 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc174Q3U155 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc174Q3U155 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc174Q3U155 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc174Q3U155 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc174Q3U155 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc174Q3U155 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc174Q3U155 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc174Q3U155 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc174Q3U155 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc174Q3U155 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc174Q3U155 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc174Q3U155 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc174Q3U155 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc174Q3U155 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc174Q3U155 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc174Q3U155 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc174Q3U155 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc174Q3U155 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc174Q3U155 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc174Q3U155 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc174Q3U155 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc174Q3U155 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc174Q3U155 Gm9002-201ENSMUST00000178437 499 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc174Q3U155 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc174Q3U155 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc174Q3U155 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc174Q3U155 Gm18307-201ENSMUST00000206864 949 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc174Q3U155 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc174Q3U155 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc174Q3U155 Rsph9-201ENSMUST00000024762 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc174Q3U155 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc174Q3U155 Gm5161-201ENSMUST00000075243 853 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc174Q3U155 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc174Q3U155 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc174Q3U155 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc174Q3U155 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc174Q3U155 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc174Q3U155 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc174Q3U155 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc174Q3U155 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc174Q3U155 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc174Q3U155 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc174Q3U155 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc174Q3U155 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc174Q3U155 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc174Q3U155 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc174Q3U155 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc174Q3U155 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc174Q3U155 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc174Q3U155 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc174Q3U155 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc174Q3U155 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc174Q3U155 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc174Q3U155 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc174Q3U155 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc174Q3U155 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc174Q3U155 Eno2-216ENSMUST00000204896 1640 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc174Q3U155 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc174Q3U155 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc174Q3U155 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc174Q3U155 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc174Q3U155 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc174Q3U155 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc174Q3U155 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc174Q3U155 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc174Q3U155 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc174Q3U155 Rpsa-ps10-201ENSMUST00000057740 885 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc174Q3U155 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc174Q3U155 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc174Q3U155 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc174Q3U155 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc174Q3U155 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc174Q3U155 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc174Q3U155 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc174Q3U155 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc174Q3U155 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc174Q3U155 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc174Q3U155 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc174Q3U155 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc174Q3U155 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc174Q3U155 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc174Q3U155 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc174Q3U155 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc174Q3U155 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc174Q3U155 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc174Q3U155 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc174Q3U155 Pisd-ps1-201ENSMUST00000119128 1115 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc174Q3U155 Gm16175-201ENSMUST00000128181 248 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc174Q3U155 Atpif1-203ENSMUST00000152993 462 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc174Q3U155 Mir7085-201ENSMUST00000184353 66 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc174Q3U155 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc174Q3U155 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc174Q3U155 Gm17330-201ENSMUST00000221047 165 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc174Q3U155 Tnfrsf19-205ENSMUST00000225730 744 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc174Q3U155 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc174Q3U155 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc174Q3U155 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc174Q3U155 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc174Q3U155 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.9 ms