Protein–RNA interactions for Protein: Q3TP92

Ctdnep1, CTD nuclear envelope phosphatase 1, mousemouse

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Length 244 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdnep1Q3TP92 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ctdnep1Q3TP92 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Ctdnep1Q3TP92 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Ctdnep1Q3TP92 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ctdnep1Q3TP92 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Ctdnep1Q3TP92 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Ctdnep1Q3TP92 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Ctdnep1Q3TP92 0610005C13Rik-202ENSMUST00000209510 671 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ctdnep1Q3TP92 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ctdnep1Q3TP92 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ctdnep1Q3TP92 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ctdnep1Q3TP92 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ctdnep1Q3TP92 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ctdnep1Q3TP92 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ctdnep1Q3TP92 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ctdnep1Q3TP92 Foxo6os-201ENSMUST00000152384 2291 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ctdnep1Q3TP92 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ctdnep1Q3TP92 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ctdnep1Q3TP92 Nol10-201ENSMUST00000046011 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ctdnep1Q3TP92 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ctdnep1Q3TP92 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ctdnep1Q3TP92 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ctdnep1Q3TP92 Pde8b-207ENSMUST00000162153 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ctdnep1Q3TP92 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ctdnep1Q3TP92 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ctdnep1Q3TP92 Tmprss11d-202ENSMUST00000122377 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ctdnep1Q3TP92 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ctdnep1Q3TP92 Chrnd-202ENSMUST00000186373 2949 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ctdnep1Q3TP92 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ctdnep1Q3TP92 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ctdnep1Q3TP92 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ctdnep1Q3TP92 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ctdnep1Q3TP92 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ctdnep1Q3TP92 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ctdnep1Q3TP92 Gm10327-201ENSMUST00000105222 1002 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Ctdnep1Q3TP92 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ctdnep1Q3TP92 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ctdnep1Q3TP92 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ctdnep1Q3TP92 Ptgr2-205ENSMUST00000135001 1286 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ctdnep1Q3TP92 Gm13070-201ENSMUST00000146532 768 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ctdnep1Q3TP92 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ctdnep1Q3TP92 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ctdnep1Q3TP92 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ctdnep1Q3TP92 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Ctdnep1Q3TP92 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Ctdnep1Q3TP92 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Ctdnep1Q3TP92 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ctdnep1Q3TP92 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Ctdnep1Q3TP92 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ctdnep1Q3TP92 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ctdnep1Q3TP92 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ctdnep1Q3TP92 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Ctdnep1Q3TP92 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ctdnep1Q3TP92 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ctdnep1Q3TP92 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ctdnep1Q3TP92 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ctdnep1Q3TP92 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ctdnep1Q3TP92 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ctdnep1Q3TP92 Zfp853-202ENSMUST00000212355 2871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ctdnep1Q3TP92 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ctdnep1Q3TP92 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ctdnep1Q3TP92 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ctdnep1Q3TP92 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ctdnep1Q3TP92 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ctdnep1Q3TP92 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ctdnep1Q3TP92 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ctdnep1Q3TP92 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ctdnep1Q3TP92 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ctdnep1Q3TP92 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ctdnep1Q3TP92 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ctdnep1Q3TP92 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ctdnep1Q3TP92 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ctdnep1Q3TP92 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ctdnep1Q3TP92 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ctdnep1Q3TP92 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ctdnep1Q3TP92 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Ctdnep1Q3TP92 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ctdnep1Q3TP92 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ctdnep1Q3TP92 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Ctdnep1Q3TP92 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ctdnep1Q3TP92 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ctdnep1Q3TP92 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ctdnep1Q3TP92 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ctdnep1Q3TP92 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ctdnep1Q3TP92 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ctdnep1Q3TP92 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ctdnep1Q3TP92 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ctdnep1Q3TP92 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Ctdnep1Q3TP92 Olfr61-202ENSMUST00000210241 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ctdnep1Q3TP92 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Ctdnep1Q3TP92 B230206H07Rik-202ENSMUST00000134845 3269 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ctdnep1Q3TP92 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ctdnep1Q3TP92 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ctdnep1Q3TP92 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ctdnep1Q3TP92 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ctdnep1Q3TP92 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Ctdnep1Q3TP92 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ctdnep1Q3TP92 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Ctdnep1Q3TP92 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ctdnep1Q3TP92 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.5 ms