Protein–RNA interactions for Protein: Q0VG85

Ccdc162p, Coiled-coil domain-containing protein 162, mousemouse

Predictions only

Length 912 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc162pQ0VG85 Gm13814-201ENSMUST00000141341 3077 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc162pQ0VG85 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc162pQ0VG85 Gm26616-202ENSMUST00000195676 3107 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc162pQ0VG85 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc162pQ0VG85 Hist1h2be-202ENSMUST00000091704 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc162pQ0VG85 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc162pQ0VG85 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc162pQ0VG85 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc162pQ0VG85 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc162pQ0VG85 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc162pQ0VG85 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc162pQ0VG85 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc162pQ0VG85 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc162pQ0VG85 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc162pQ0VG85 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc162pQ0VG85 Ntsr1-202ENSMUST00000170448 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc162pQ0VG85 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc162pQ0VG85 Fam219a-202ENSMUST00000108050 3321 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc162pQ0VG85 AC137842.1-201ENSMUST00000227896 2064 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc162pQ0VG85 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc162pQ0VG85 Klc2-202ENSMUST00000113727 2874 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc162pQ0VG85 Gm45643-201ENSMUST00000211364 1484 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc162pQ0VG85 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc162pQ0VG85 Micu1-201ENSMUST00000020311 2336 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc162pQ0VG85 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc162pQ0VG85 Gm5592-202ENSMUST00000206490 2623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc162pQ0VG85 Mettl1-201ENSMUST00000006915 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc162pQ0VG85 Lrrc30-201ENSMUST00000097290 1759 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc162pQ0VG85 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc162pQ0VG85 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc162pQ0VG85 Tnpo2-202ENSMUST00000166592 4884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc162pQ0VG85 AC158633.2-201ENSMUST00000222959 6046 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc162pQ0VG85 Cdc45-201ENSMUST00000000028 2143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc162pQ0VG85 Bach2-201ENSMUST00000037416 3462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc162pQ0VG85 Zfp467-206ENSMUST00000114561 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc162pQ0VG85 1700128E19Rik-201ENSMUST00000134409 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc162pQ0VG85 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc162pQ0VG85 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc162pQ0VG85 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc162pQ0VG85 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc162pQ0VG85 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc162pQ0VG85 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc162pQ0VG85 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc162pQ0VG85 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc162pQ0VG85 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc162pQ0VG85 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc162pQ0VG85 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc162pQ0VG85 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc162pQ0VG85 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc162pQ0VG85 Aldh9a1-201ENSMUST00000028004 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc162pQ0VG85 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc162pQ0VG85 Zbtb20-201ENSMUST00000079441 3086 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc162pQ0VG85 Fam160a2-202ENSMUST00000074686 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc162pQ0VG85 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc162pQ0VG85 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc162pQ0VG85 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc162pQ0VG85 4930513N10Rik-204ENSMUST00000212647 3957 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc162pQ0VG85 Ifnlr1-201ENSMUST00000074408 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc162pQ0VG85 Astl-204ENSMUST00000179618 2236 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc162pQ0VG85 2900089D17Rik-201ENSMUST00000124015 2475 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc162pQ0VG85 Ska1-202ENSMUST00000177604 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc162pQ0VG85 Pcdh8-201ENSMUST00000039568 4000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc162pQ0VG85 Tmem132e-202ENSMUST00000092852 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc162pQ0VG85 Cit-203ENSMUST00000112008 6087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc162pQ0VG85 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc162pQ0VG85 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc162pQ0VG85 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc162pQ0VG85 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc162pQ0VG85 Wdr45-204ENSMUST00000115689 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc162pQ0VG85 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc162pQ0VG85 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc162pQ0VG85 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc162pQ0VG85 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc162pQ0VG85 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc162pQ0VG85 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc162pQ0VG85 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc162pQ0VG85 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc162pQ0VG85 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc162pQ0VG85 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc162pQ0VG85 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc162pQ0VG85 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc162pQ0VG85 Fastkd3-201ENSMUST00000051784 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc162pQ0VG85 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc162pQ0VG85 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc162pQ0VG85 Ampd2-202ENSMUST00000102637 3586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc162pQ0VG85 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc162pQ0VG85 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc162pQ0VG85 Chfr-202ENSMUST00000112519 3159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc162pQ0VG85 Snph-202ENSMUST00000094456 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc162pQ0VG85 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc162pQ0VG85 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc162pQ0VG85 Ctbs-201ENSMUST00000029840 2629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc162pQ0VG85 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc162pQ0VG85 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc162pQ0VG85 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc162pQ0VG85 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc162pQ0VG85 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc162pQ0VG85 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc162pQ0VG85 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc162pQ0VG85 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms