Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF76

Ttc39d, Tetratricopeptide repeat domain 39D, mousemouse

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Length 604 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc39dQ0VF76 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Ttc39dQ0VF76 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Ttc39dQ0VF76 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Ttc39dQ0VF76 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ttc39dQ0VF76 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Ttc39dQ0VF76 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Ttc39dQ0VF76 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Ttc39dQ0VF76 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ttc39dQ0VF76 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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Ttc39dQ0VF76 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
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Ttc39dQ0VF76 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
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Ttc39dQ0VF76 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ttc39dQ0VF76 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ttc39dQ0VF76 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ttc39dQ0VF76 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ttc39dQ0VF76 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ttc39dQ0VF76 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ttc39dQ0VF76 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ttc39dQ0VF76 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ttc39dQ0VF76 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ttc39dQ0VF76 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ttc39dQ0VF76 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ttc39dQ0VF76 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ttc39dQ0VF76 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ttc39dQ0VF76 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
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