Protein–RNA interactions for Protein: Q0P5X1

Lrriq1, Leucine-rich repeat and IQ domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,673 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrriq1Q0P5X1 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Lrriq1Q0P5X1 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Lrriq1Q0P5X1 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Lrriq1Q0P5X1 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Lrriq1Q0P5X1 Zfp637-210ENSMUST00000164472 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Lrriq1Q0P5X1 Rwdd2a-202ENSMUST00000179212 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Lrriq1Q0P5X1 Mir7076-201ENSMUST00000183519 74 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Lrriq1Q0P5X1 Gm29292-201ENSMUST00000186169 766 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Lrriq1Q0P5X1 Gm37229-201ENSMUST00000191643 732 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Lrriq1Q0P5X1 Gm45242-201ENSMUST00000210666 2129 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Lrriq1Q0P5X1 4930447K03Rik-201ENSMUST00000222745 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Lrriq1Q0P5X1 CT030637.1-201ENSMUST00000228016 669 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Lrriq1Q0P5X1 Gm9873-201ENSMUST00000063891 1097 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Lrriq1Q0P5X1 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Lrriq1Q0P5X1 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Lrriq1Q0P5X1 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Lrriq1Q0P5X1 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Lrriq1Q0P5X1 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Lrriq1Q0P5X1 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Lrriq1Q0P5X1 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Lrriq1Q0P5X1 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Lrriq1Q0P5X1 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Lrriq1Q0P5X1 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Lrriq1Q0P5X1 Kcnab2-203ENSMUST00000159186 1552 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Lrriq1Q0P5X1 Shbg-201ENSMUST00000005334 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Lrriq1Q0P5X1 Pcnp-203ENSMUST00000119981 901 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Lrriq1Q0P5X1 Gm8018-201ENSMUST00000173536 789 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Lrriq1Q0P5X1 Gm43634-201ENSMUST00000202671 675 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Lrriq1Q0P5X1 4933421D24Rik-201ENSMUST00000209302 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Lrriq1Q0P5X1 AC159376.1-201ENSMUST00000218504 630 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Lrriq1Q0P5X1 AC167013.1-201ENSMUST00000228592 202 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Lrriq1Q0P5X1 Tex30-201ENSMUST00000027215 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Lrriq1Q0P5X1 1700012P22Rik-201ENSMUST00000030323 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Lrriq1Q0P5X1 Tas2r126-201ENSMUST00000059534 930 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Lrriq1Q0P5X1 Sftpd-201ENSMUST00000077136 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Lrriq1Q0P5X1 Vmn1r197-201ENSMUST00000091734 897 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Lrriq1Q0P5X1 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Lrriq1Q0P5X1 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Lrriq1Q0P5X1 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Lrriq1Q0P5X1 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC21.27■■□□□ 1
Lrriq1Q0P5X1 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Lrriq1Q0P5X1 Nppa-201ENSMUST00000103230 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Lrriq1Q0P5X1 Rhox3c-202ENSMUST00000115189 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Lrriq1Q0P5X1 Gm11246-201ENSMUST00000120880 345 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Lrriq1Q0P5X1 Rhox3a2-204ENSMUST00000184565 823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Lrriq1Q0P5X1 Gm45398-201ENSMUST00000210561 165 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Lrriq1Q0P5X1 AC135669.1-202ENSMUST00000216742 540 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Lrriq1Q0P5X1 Smco2-201ENSMUST00000032433 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Lrriq1Q0P5X1 Olfr524-201ENSMUST00000051943 1058 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
Lrriq1Q0P5X1 Olfr354-201ENSMUST00000068475 1084 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
Lrriq1Q0P5X1 Rhox3e-201ENSMUST00000081327 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Lrriq1Q0P5X1 Rhox3a2-201ENSMUST00000096459 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Lrriq1Q0P5X1 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Lrriq1Q0P5X1 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Lrriq1Q0P5X1 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Lrriq1Q0P5X1 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Lrriq1Q0P5X1 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Lrriq1Q0P5X1 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Lrriq1Q0P5X1 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Lrriq1Q0P5X1 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Lrriq1Q0P5X1 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Lrriq1Q0P5X1 Odf2-201ENSMUST00000028128 2376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Lrriq1Q0P5X1 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Lrriq1Q0P5X1 Gm3793-201ENSMUST00000204973 672 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Lrriq1Q0P5X1 Gm11634-202ENSMUST00000209862 573 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Lrriq1Q0P5X1 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Lrriq1Q0P5X1 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Lrriq1Q0P5X1 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Lrriq1Q0P5X1 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Lrriq1Q0P5X1 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Lrriq1Q0P5X1 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Lrriq1Q0P5X1 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Lrriq1Q0P5X1 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Lrriq1Q0P5X1 Esam-201ENSMUST00000002011 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Lrriq1Q0P5X1 E130307A14Rik-203ENSMUST00000136862 608 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Lrriq1Q0P5X1 Plgrkt-209ENSMUST00000152936 604 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Lrriq1Q0P5X1 Agtpbp1-219ENSMUST00000170378 653 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Lrriq1Q0P5X1 Gm45925-201ENSMUST00000218882 744 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Lrriq1Q0P5X1 CT009713.8-202ENSMUST00000224732 385 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Lrriq1Q0P5X1 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Lrriq1Q0P5X1 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Lrriq1Q0P5X1 Trp63-204ENSMUST00000115305 1729 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Lrriq1Q0P5X1 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Lrriq1Q0P5X1 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Lrriq1Q0P5X1 Cd72-204ENSMUST00000107925 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Lrriq1Q0P5X1 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Lrriq1Q0P5X1 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Lrriq1Q0P5X1 Gstm4-202ENSMUST00000106670 777 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Lrriq1Q0P5X1 Gm12628-201ENSMUST00000122193 382 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Lrriq1Q0P5X1 Lmo3-202ENSMUST00000161450 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Lrriq1Q0P5X1 Gm7902-201ENSMUST00000198842 947 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Lrriq1Q0P5X1 Gm45184-201ENSMUST00000206354 955 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Lrriq1Q0P5X1 Gm21811-201ENSMUST00000096485 930 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Lrriq1Q0P5X1 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Lrriq1Q0P5X1 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Lrriq1Q0P5X1 Slc6a9-210ENSMUST00000169885 1876 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Lrriq1Q0P5X1 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Lrriq1Q0P5X1 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Lrriq1Q0P5X1 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Lrriq1Q0P5X1 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
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