Protein–RNA interactions for Protein: Q0P5V2

Sobp, Sine oculis-binding protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 864 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SobpQ0P5V2 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SobpQ0P5V2 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SobpQ0P5V2 Rhbdl2-202ENSMUST00000106204 1120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SobpQ0P5V2 Skap1-206ENSMUST00000107663 742 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SobpQ0P5V2 Gm6890-201ENSMUST00000114117 776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SobpQ0P5V2 Acyp1-204ENSMUST00000121930 634 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SobpQ0P5V2 Rps2-ps4-201ENSMUST00000121977 633 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SobpQ0P5V2 Rbm18-202ENSMUST00000122456 781 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SobpQ0P5V2 Cabp2-202ENSMUST00000159556 781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SobpQ0P5V2 9030616G12Rik-201ENSMUST00000181142 644 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SobpQ0P5V2 Gm45433-201ENSMUST00000209386 247 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SobpQ0P5V2 AC156501.1-201ENSMUST00000228219 270 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SobpQ0P5V2 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SobpQ0P5V2 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SobpQ0P5V2 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SobpQ0P5V2 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SobpQ0P5V2 AC091458.1-201ENSMUST00000220902 1361 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SobpQ0P5V2 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SobpQ0P5V2 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SobpQ0P5V2 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SobpQ0P5V2 Gm37165-201ENSMUST00000193815 1463 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SobpQ0P5V2 Cd8b1-201ENSMUST00000065248 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SobpQ0P5V2 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SobpQ0P5V2 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SobpQ0P5V2 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SobpQ0P5V2 6230400D17Rik-201ENSMUST00000180987 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SobpQ0P5V2 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SobpQ0P5V2 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SobpQ0P5V2 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SobpQ0P5V2 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SobpQ0P5V2 Cd74-202ENSMUST00000097563 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SobpQ0P5V2 Tbata-201ENSMUST00000035894 1506 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SobpQ0P5V2 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SobpQ0P5V2 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SobpQ0P5V2 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SobpQ0P5V2 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SobpQ0P5V2 N6amt1-203ENSMUST00000118310 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SobpQ0P5V2 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SobpQ0P5V2 Tada3-202ENSMUST00000043333 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SobpQ0P5V2 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SobpQ0P5V2 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SobpQ0P5V2 Cspp1-204ENSMUST00000119714 1268 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SobpQ0P5V2 Gm15432-201ENSMUST00000121106 195 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SobpQ0P5V2 Gm14460-201ENSMUST00000121511 639 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SobpQ0P5V2 Bcas3os2-201ENSMUST00000134305 661 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SobpQ0P5V2 Gm13061-201ENSMUST00000137962 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SobpQ0P5V2 Gm24749-201ENSMUST00000157838 343 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SobpQ0P5V2 Gm5597-201ENSMUST00000182353 1193 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SobpQ0P5V2 Gm45224-201ENSMUST00000208203 414 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SobpQ0P5V2 Calml4-207ENSMUST00000215968 526 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SobpQ0P5V2 Sat1-201ENSMUST00000026318 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SobpQ0P5V2 Prss34-201ENSMUST00000037453 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SobpQ0P5V2 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SobpQ0P5V2 Clec4b2-201ENSMUST00000088455 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SobpQ0P5V2 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SobpQ0P5V2 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SobpQ0P5V2 Hsd17b6-201ENSMUST00000026462 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SobpQ0P5V2 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SobpQ0P5V2 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SobpQ0P5V2 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SobpQ0P5V2 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SobpQ0P5V2 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SobpQ0P5V2 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SobpQ0P5V2 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SobpQ0P5V2 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SobpQ0P5V2 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SobpQ0P5V2 Gm13045-201ENSMUST00000119019 712 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SobpQ0P5V2 Tlx1-202ENSMUST00000174617 806 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SobpQ0P5V2 Crnde-207ENSMUST00000180102 732 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SobpQ0P5V2 Gm37905-201ENSMUST00000195310 341 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SobpQ0P5V2 Gm6458-201ENSMUST00000211573 635 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SobpQ0P5V2 AC107638.1-201ENSMUST00000213690 1061 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SobpQ0P5V2 Tmem247-201ENSMUST00000042172 752 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SobpQ0P5V2 Olfr398-201ENSMUST00000053874 945 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SobpQ0P5V2 Mrps21-201ENSMUST00000067298 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SobpQ0P5V2 Efemp2-209ENSMUST00000167371 1382 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SobpQ0P5V2 Gm38049-201ENSMUST00000195698 1372 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SobpQ0P5V2 Ccnc-204ENSMUST00000120679 1453 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SobpQ0P5V2 Cyp4f17-201ENSMUST00000165999 1693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SobpQ0P5V2 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SobpQ0P5V2 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SobpQ0P5V2 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SobpQ0P5V2 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SobpQ0P5V2 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SobpQ0P5V2 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SobpQ0P5V2 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SobpQ0P5V2 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SobpQ0P5V2 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SobpQ0P5V2 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SobpQ0P5V2 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SobpQ0P5V2 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SobpQ0P5V2 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SobpQ0P5V2 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SobpQ0P5V2 AI839979-202ENSMUST00000201790 1539 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SobpQ0P5V2 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SobpQ0P5V2 Ccdc94-201ENSMUST00000086869 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SobpQ0P5V2 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SobpQ0P5V2 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SobpQ0P5V2 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SobpQ0P5V2 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms