Protein–RNA interactions for Protein: Q0KL01

Ubxn2b, UBX domain-containing protein 2B, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn2bQ0KL01 Gm12690-201ENSMUST00000132108 354 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ubxn2bQ0KL01 Gm17391-201ENSMUST00000171036 126 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Ubxn2bQ0KL01 Ighv5-7-201ENSMUST00000192302 244 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Ubxn2bQ0KL01 Gm33222-201ENSMUST00000193725 654 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ubxn2bQ0KL01 AC125206.1-201ENSMUST00000214070 739 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ubxn2bQ0KL01 AC159462.1-201ENSMUST00000214822 687 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ubxn2bQ0KL01 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ubxn2bQ0KL01 Ccdc153-201ENSMUST00000092426 1087 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ubxn2bQ0KL01 Asb18-202ENSMUST00000097656 788 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ubxn2bQ0KL01 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ubxn2bQ0KL01 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ubxn2bQ0KL01 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ubxn2bQ0KL01 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ubxn2bQ0KL01 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ubxn2bQ0KL01 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ubxn2bQ0KL01 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ubxn2bQ0KL01 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Ubxn2bQ0KL01 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ubxn2bQ0KL01 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ubxn2bQ0KL01 Tmub1-203ENSMUST00000115036 1455 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ubxn2bQ0KL01 Tubb2a-ps2-201ENSMUST00000221547 1339 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Ubxn2bQ0KL01 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ubxn2bQ0KL01 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ubxn2bQ0KL01 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ubxn2bQ0KL01 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ubxn2bQ0KL01 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ubxn2bQ0KL01 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ubxn2bQ0KL01 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ubxn2bQ0KL01 Gm11595-201ENSMUST00000107440 1200 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ubxn2bQ0KL01 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ubxn2bQ0KL01 Gm13296-201ENSMUST00000117854 997 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Ubxn2bQ0KL01 Eif4e1b-204ENSMUST00000132005 706 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ubxn2bQ0KL01 Gm15972-201ENSMUST00000132571 418 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ubxn2bQ0KL01 Gm17208-201ENSMUST00000168388 535 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Ubxn2bQ0KL01 Gm8492-201ENSMUST00000182375 987 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Ubxn2bQ0KL01 1190007I07Rik-205ENSMUST00000185168 469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ubxn2bQ0KL01 Ankrd7-201ENSMUST00000031489 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ubxn2bQ0KL01 Nceh1-202ENSMUST00000091284 830 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ubxn2bQ0KL01 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Ubxn2bQ0KL01 H2-T22-201ENSMUST00000058801 1534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ubxn2bQ0KL01 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ubxn2bQ0KL01 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ubxn2bQ0KL01 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ubxn2bQ0KL01 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ubxn2bQ0KL01 Slc22a13b-ps-201ENSMUST00000173185 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ubxn2bQ0KL01 Rfx7-203ENSMUST00000183372 1457 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ubxn2bQ0KL01 Ncf4-201ENSMUST00000096357 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ubxn2bQ0KL01 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ubxn2bQ0KL01 Rab30-202ENSMUST00000107179 1304 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ubxn2bQ0KL01 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ubxn2bQ0KL01 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ubxn2bQ0KL01 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ubxn2bQ0KL01 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ubxn2bQ0KL01 4933421I07Rik-201ENSMUST00000032648 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ubxn2bQ0KL01 Mcfd2-205ENSMUST00000145895 751 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ubxn2bQ0KL01 Aamdc-213ENSMUST00000154853 883 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ubxn2bQ0KL01 1700099I09Rik-201ENSMUST00000167834 769 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ubxn2bQ0KL01 Gm27230-202ENSMUST00000184671 857 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ubxn2bQ0KL01 Gm42779-201ENSMUST00000198807 406 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Ubxn2bQ0KL01 Gm13522-202ENSMUST00000209682 997 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ubxn2bQ0KL01 Gm39460-201ENSMUST00000215728 1266 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ubxn2bQ0KL01 Gm32025-201ENSMUST00000217960 307 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Ubxn2bQ0KL01 Dnajc4-201ENSMUST00000025915 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ubxn2bQ0KL01 Rsg1-201ENSMUST00000097813 985 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ubxn2bQ0KL01 Olfr1250-201ENSMUST00000099768 1139 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ubxn2bQ0KL01 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Ubxn2bQ0KL01 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ubxn2bQ0KL01 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ubxn2bQ0KL01 F830115B05Rik-201ENSMUST00000197638 1894 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Ubxn2bQ0KL01 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ubxn2bQ0KL01 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ubxn2bQ0KL01 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ubxn2bQ0KL01 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ubxn2bQ0KL01 Crx-203ENSMUST00000172758 1469 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ubxn2bQ0KL01 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ubxn2bQ0KL01 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ubxn2bQ0KL01 Dclk1-215ENSMUST00000200352 1662 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ubxn2bQ0KL01 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ubxn2bQ0KL01 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ubxn2bQ0KL01 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Ubxn2bQ0KL01 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ubxn2bQ0KL01 Ccl27a-204ENSMUST00000108035 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ubxn2bQ0KL01 Ccl27a-205ENSMUST00000108036 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ubxn2bQ0KL01 Ccl27a-206ENSMUST00000108037 590 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ubxn2bQ0KL01 Gm6447-201ENSMUST00000118905 835 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Ubxn2bQ0KL01 B230119M05Rik-201ENSMUST00000154072 979 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ubxn2bQ0KL01 Isl1-202ENSMUST00000176044 1198 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ubxn2bQ0KL01 AC156504.2-201ENSMUST00000213800 711 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ubxn2bQ0KL01 AC159376.1-201ENSMUST00000218504 630 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Ubxn2bQ0KL01 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ubxn2bQ0KL01 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ubxn2bQ0KL01 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ubxn2bQ0KL01 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ubxn2bQ0KL01 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Ubxn2bQ0KL01 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Ubxn2bQ0KL01 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Ubxn2bQ0KL01 Nmt2-202ENSMUST00000091504 1676 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Ubxn2bQ0KL01 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ubxn2bQ0KL01 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ubxn2bQ0KL01 Odf3-202ENSMUST00000106049 1509 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms