Protein–RNA interactions for Protein: Q0GA42

Cnnm1, Metal transporter CNNM1, mousemouse

Predictions only

Length 951 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnnm1Q0GA42 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cnnm1Q0GA42 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cnnm1Q0GA42 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cnnm1Q0GA42 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cnnm1Q0GA42 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cnnm1Q0GA42 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cnnm1Q0GA42 Tagln2-201ENSMUST00000111228 716 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cnnm1Q0GA42 Agbl3-202ENSMUST00000115012 790 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cnnm1Q0GA42 Agbl3-203ENSMUST00000115014 805 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cnnm1Q0GA42 Cabp5-202ENSMUST00000117400 1258 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cnnm1Q0GA42 Gm2639-201ENSMUST00000156881 1297 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Cnnm1Q0GA42 Tmem52-204ENSMUST00000178188 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cnnm1Q0GA42 Tmem52-205ENSMUST00000178238 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cnnm1Q0GA42 Gm27572-201ENSMUST00000183702 255 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Cnnm1Q0GA42 Mturn-202ENSMUST00000187701 503 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cnnm1Q0GA42 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cnnm1Q0GA42 Gm44974-201ENSMUST00000206387 1279 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Cnnm1Q0GA42 Gm9803-202ENSMUST00000216543 456 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cnnm1Q0GA42 Gm36198-201ENSMUST00000217490 416 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cnnm1Q0GA42 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cnnm1Q0GA42 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cnnm1Q0GA42 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cnnm1Q0GA42 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cnnm1Q0GA42 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cnnm1Q0GA42 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cnnm1Q0GA42 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cnnm1Q0GA42 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cnnm1Q0GA42 Tex13c2-201ENSMUST00000197237 1834 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cnnm1Q0GA42 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cnnm1Q0GA42 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cnnm1Q0GA42 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cnnm1Q0GA42 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cnnm1Q0GA42 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cnnm1Q0GA42 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cnnm1Q0GA42 Litaf-202ENSMUST00000117360 763 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cnnm1Q0GA42 Gm13886-201ENSMUST00000117876 1183 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Cnnm1Q0GA42 Ecscr-204ENSMUST00000133064 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cnnm1Q0GA42 Gm27206-201ENSMUST00000154038 979 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cnnm1Q0GA42 Ppm1h-208ENSMUST00000162969 811 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cnnm1Q0GA42 Ssr4-208ENSMUST00000166518 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cnnm1Q0GA42 Aif1-206ENSMUST00000173324 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cnnm1Q0GA42 Dnm3os-203ENSMUST00000185878 557 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cnnm1Q0GA42 Gm5370-201ENSMUST00000187187 574 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Cnnm1Q0GA42 Sox2ot-208ENSMUST00000197103 802 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cnnm1Q0GA42 Gm4610-201ENSMUST00000198222 905 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cnnm1Q0GA42 Gm42929-201ENSMUST00000198374 1286 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Cnnm1Q0GA42 Alkbh3-201ENSMUST00000040005 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cnnm1Q0GA42 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cnnm1Q0GA42 Upk2-201ENSMUST00000047740 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cnnm1Q0GA42 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cnnm1Q0GA42 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cnnm1Q0GA42 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cnnm1Q0GA42 Vax2os-201ENSMUST00000123402 1435 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cnnm1Q0GA42 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cnnm1Q0GA42 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cnnm1Q0GA42 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cnnm1Q0GA42 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cnnm1Q0GA42 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cnnm1Q0GA42 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cnnm1Q0GA42 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cnnm1Q0GA42 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cnnm1Q0GA42 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cnnm1Q0GA42 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cnnm1Q0GA42 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cnnm1Q0GA42 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cnnm1Q0GA42 Gpr19-208ENSMUST00000165392 1643 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cnnm1Q0GA42 Gpr19-202ENSMUST00000066107 1647 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cnnm1Q0GA42 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cnnm1Q0GA42 Plaur-201ENSMUST00000002284 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cnnm1Q0GA42 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cnnm1Q0GA42 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cnnm1Q0GA42 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cnnm1Q0GA42 Ypel3-202ENSMUST00000106356 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cnnm1Q0GA42 Gm5187-201ENSMUST00000117317 991 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Cnnm1Q0GA42 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cnnm1Q0GA42 6030498E09Rik-202ENSMUST00000168144 510 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cnnm1Q0GA42 Gm34084-201ENSMUST00000222236 1298 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cnnm1Q0GA42 Fkbp7-201ENSMUST00000002809 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cnnm1Q0GA42 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cnnm1Q0GA42 Bphl-201ENSMUST00000040656 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cnnm1Q0GA42 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cnnm1Q0GA42 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cnnm1Q0GA42 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cnnm1Q0GA42 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cnnm1Q0GA42 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cnnm1Q0GA42 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cnnm1Q0GA42 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cnnm1Q0GA42 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cnnm1Q0GA42 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cnnm1Q0GA42 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cnnm1Q0GA42 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cnnm1Q0GA42 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cnnm1Q0GA42 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cnnm1Q0GA42 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cnnm1Q0GA42 Spatc1l-202ENSMUST00000105414 1060 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cnnm1Q0GA42 Aurkaip1-202ENSMUST00000105591 773 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cnnm1Q0GA42 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cnnm1Q0GA42 Gm11400-201ENSMUST00000120853 1214 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Cnnm1Q0GA42 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cnnm1Q0GA42 Gm15336-201ENSMUST00000128894 1571 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms