Protein–RNA interactions for Protein: Q03717

Kcnb1, Potassium voltage-gated channel subfamily B member 1, mousemouse

Predictions only

Length 857 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnb1Q03717 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Kcnb1Q03717 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Kcnb1Q03717 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Kcnb1Q03717 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Kcnb1Q03717 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Kcnb1Q03717 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Kcnb1Q03717 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Kcnb1Q03717 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Kcnb1Q03717 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Kcnb1Q03717 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Kcnb1Q03717 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Kcnb1Q03717 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Kcnb1Q03717 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Kcnb1Q03717 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Kcnb1Q03717 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Kcnb1Q03717 Adal-205ENSMUST00000119031 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Kcnb1Q03717 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Kcnb1Q03717 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Kcnb1Q03717 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Kcnb1Q03717 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Kcnb1Q03717 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Kcnb1Q03717 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Kcnb1Q03717 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Kcnb1Q03717 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Kcnb1Q03717 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Kcnb1Q03717 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Kcnb1Q03717 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Kcnb1Q03717 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Kcnb1Q03717 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Kcnb1Q03717 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Kcnb1Q03717 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Kcnb1Q03717 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Kcnb1Q03717 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Kcnb1Q03717 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Kcnb1Q03717 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Kcnb1Q03717 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Kcnb1Q03717 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Kcnb1Q03717 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Kcnb1Q03717 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Kcnb1Q03717 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Kcnb1Q03717 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Kcnb1Q03717 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Kcnb1Q03717 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Kcnb1Q03717 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Kcnb1Q03717 Olfr142-201ENSMUST00000099752 918 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Kcnb1Q03717 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Kcnb1Q03717 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Kcnb1Q03717 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Kcnb1Q03717 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Kcnb1Q03717 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Kcnb1Q03717 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Kcnb1Q03717 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Kcnb1Q03717 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Kcnb1Q03717 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Kcnb1Q03717 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Kcnb1Q03717 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Kcnb1Q03717 Ctbs-202ENSMUST00000061937 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Kcnb1Q03717 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Kcnb1Q03717 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Kcnb1Q03717 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Kcnb1Q03717 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Kcnb1Q03717 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Kcnb1Q03717 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Kcnb1Q03717 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Kcnb1Q03717 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Kcnb1Q03717 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Kcnb1Q03717 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Kcnb1Q03717 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Kcnb1Q03717 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Kcnb1Q03717 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Kcnb1Q03717 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Kcnb1Q03717 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Kcnb1Q03717 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Kcnb1Q03717 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Kcnb1Q03717 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Kcnb1Q03717 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Kcnb1Q03717 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Kcnb1Q03717 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Kcnb1Q03717 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Kcnb1Q03717 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Kcnb1Q03717 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Kcnb1Q03717 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Kcnb1Q03717 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Kcnb1Q03717 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Kcnb1Q03717 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Kcnb1Q03717 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Kcnb1Q03717 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Kcnb1Q03717 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Kcnb1Q03717 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Kcnb1Q03717 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Kcnb1Q03717 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Kcnb1Q03717 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Kcnb1Q03717 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Kcnb1Q03717 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Kcnb1Q03717 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Kcnb1Q03717 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Kcnb1Q03717 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Kcnb1Q03717 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Kcnb1Q03717 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Kcnb1Q03717 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.7 ms