Protein–RNA interactions for Protein: Q00LT2

Prcd, Progressive rod-cone degeneration protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 53 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrcdQ00LT2 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.67□□□□□ -0.86
PrcdQ00LT2 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
PrcdQ00LT2 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
PrcdQ00LT2 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
PrcdQ00LT2 Wdr66-202ENSMUST00000121964 4873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.67□□□□□ -0.86
PrcdQ00LT2 Bend3-201ENSMUST00000040147 5882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
PrcdQ00LT2 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
PrcdQ00LT2 Tmem200a-201ENSMUST00000066049 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
PrcdQ00LT2 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
PrcdQ00LT2 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
PrcdQ00LT2 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
PrcdQ00LT2 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC9.66□□□□□ -0.86
PrcdQ00LT2 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
PrcdQ00LT2 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
PrcdQ00LT2 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
PrcdQ00LT2 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
PrcdQ00LT2 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
PrcdQ00LT2 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
PrcdQ00LT2 Gpd2-201ENSMUST00000028167 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
PrcdQ00LT2 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
PrcdQ00LT2 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
PrcdQ00LT2 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC9.66□□□□□ -0.86
PrcdQ00LT2 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
PrcdQ00LT2 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
PrcdQ00LT2 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC9.66□□□□□ -0.86
PrcdQ00LT2 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC9.66□□□□□ -0.86
PrcdQ00LT2 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC9.66□□□□□ -0.86
PrcdQ00LT2 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC9.66□□□□□ -0.86
PrcdQ00LT2 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC9.66□□□□□ -0.86
PrcdQ00LT2 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
PrcdQ00LT2 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.66□□□□□ -0.86
PrcdQ00LT2 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.66□□□□□ -0.86
PrcdQ00LT2 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
PrcdQ00LT2 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
PrcdQ00LT2 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
PrcdQ00LT2 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
PrcdQ00LT2 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
PrcdQ00LT2 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
PrcdQ00LT2 Grm5-202ENSMUST00000125009 8047 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.66□□□□□ -0.86
PrcdQ00LT2 Cacna1g-205ENSMUST00000107786 7984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
PrcdQ00LT2 Cacna1g-210ENSMUST00000107792 7981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.66□□□□□ -0.86
PrcdQ00LT2 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.66□□□□□ -0.86
PrcdQ00LT2 Epha8-201ENSMUST00000030420 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
PrcdQ00LT2 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.66□□□□□ -0.86
PrcdQ00LT2 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
PrcdQ00LT2 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
PrcdQ00LT2 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC9.66□□□□□ -0.86
PrcdQ00LT2 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
PrcdQ00LT2 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
PrcdQ00LT2 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
PrcdQ00LT2 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
PrcdQ00LT2 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
PrcdQ00LT2 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
PrcdQ00LT2 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
PrcdQ00LT2 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
PrcdQ00LT2 Nacc1-201ENSMUST00000001975 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
PrcdQ00LT2 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
PrcdQ00LT2 Cyyr1-201ENSMUST00000114174 5464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
PrcdQ00LT2 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
PrcdQ00LT2 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
PrcdQ00LT2 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
PrcdQ00LT2 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
PrcdQ00LT2 Usp19-203ENSMUST00000166103 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
PrcdQ00LT2 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
PrcdQ00LT2 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC9.65□□□□□ -0.86
PrcdQ00LT2 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
PrcdQ00LT2 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
PrcdQ00LT2 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
PrcdQ00LT2 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
PrcdQ00LT2 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
PrcdQ00LT2 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
PrcdQ00LT2 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
PrcdQ00LT2 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
PrcdQ00LT2 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
PrcdQ00LT2 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
PrcdQ00LT2 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
PrcdQ00LT2 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
PrcdQ00LT2 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
PrcdQ00LT2 Gm16010-202ENSMUST00000145410 4427 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
PrcdQ00LT2 Vax2os-203ENSMUST00000155159 4063 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
PrcdQ00LT2 Plekhg2-203ENSMUST00000121085 4649 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.65□□□□□ -0.86
PrcdQ00LT2 Map4k2-201ENSMUST00000025897 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
PrcdQ00LT2 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
PrcdQ00LT2 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
PrcdQ00LT2 Grin1-201ENSMUST00000028335 4238 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
PrcdQ00LT2 Plch2-206ENSMUST00000135665 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.87
PrcdQ00LT2 Itgal-201ENSMUST00000106306 5195 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
PrcdQ00LT2 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC9.65□□□□□ -0.87
PrcdQ00LT2 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.87
PrcdQ00LT2 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.87
PrcdQ00LT2 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
PrcdQ00LT2 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
PrcdQ00LT2 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.65□□□□□ -0.87
PrcdQ00LT2 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
PrcdQ00LT2 Cops7b-202ENSMUST00000121534 5383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
PrcdQ00LT2 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
PrcdQ00LT2 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
PrcdQ00LT2 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
PrcdQ00LT2 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
PrcdQ00LT2 Adamts16-201ENSMUST00000080145 4981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.7 ms