Protein–RNA interactions for Protein: Q00288

Pax8, Paired box protein Pax-8, mousemouse

Predictions only

Length 457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pax8Q00288 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pax8Q00288 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pax8Q00288 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pax8Q00288 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pax8Q00288 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pax8Q00288 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pax8Q00288 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pax8Q00288 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pax8Q00288 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pax8Q00288 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pax8Q00288 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pax8Q00288 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pax8Q00288 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pax8Q00288 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pax8Q00288 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Pax8Q00288 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Pax8Q00288 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Pax8Q00288 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Pax8Q00288 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Pax8Q00288 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Pax8Q00288 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Pax8Q00288 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Pax8Q00288 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Pax8Q00288 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Pax8Q00288 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Pax8Q00288 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Pax8Q00288 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Pax8Q00288 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Pax8Q00288 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Pax8Q00288 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Pax8Q00288 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Pax8Q00288 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Pax8Q00288 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Pax8Q00288 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Pax8Q00288 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Pax8Q00288 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Pax8Q00288 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Pax8Q00288 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Pax8Q00288 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Pax8Q00288 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Pax8Q00288 Gm13070-201ENSMUST00000146532 768 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Pax8Q00288 Atp6v1f-203ENSMUST00000149646 806 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Pax8Q00288 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Pax8Q00288 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Pax8Q00288 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Pax8Q00288 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Pax8Q00288 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Pax8Q00288 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Pax8Q00288 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Pax8Q00288 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Pax8Q00288 Gm18307-201ENSMUST00000206864 949 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Pax8Q00288 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Pax8Q00288 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Pax8Q00288 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Pax8Q00288 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Pax8Q00288 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Pax8Q00288 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Pax8Q00288 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Pax8Q00288 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Pax8Q00288 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Pax8Q00288 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Pax8Q00288 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Pax8Q00288 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Pax8Q00288 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Pax8Q00288 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Pax8Q00288 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Pax8Q00288 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Pax8Q00288 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Pax8Q00288 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Pax8Q00288 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Pax8Q00288 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Pax8Q00288 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Pax8Q00288 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Pax8Q00288 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Pax8Q00288 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Pax8Q00288 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Pax8Q00288 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Pax8Q00288 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Pax8Q00288 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Pax8Q00288 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Pax8Q00288 Foxo6os-201ENSMUST00000152384 2291 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Pax8Q00288 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Pax8Q00288 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Pax8Q00288 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Pax8Q00288 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Pax8Q00288 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Pax8Q00288 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Pax8Q00288 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Pax8Q00288 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Pax8Q00288 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Pax8Q00288 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Pax8Q00288 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Pax8Q00288 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Pax8Q00288 Gm13689-201ENSMUST00000119360 685 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Pax8Q00288 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Pax8Q00288 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Pax8Q00288 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Pax8Q00288 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Pax8Q00288 Stk19-ps1-201ENSMUST00000174597 517 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Pax8Q00288 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55 ms