Protein–RNA interactions for Protein: P70232

Chl1, Neural cell adhesion molecule L1-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chl1P70232 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Chl1P70232 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Chl1P70232 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Chl1P70232 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Chl1P70232 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Chl1P70232 Gm11638-201ENSMUST00000153672 1615 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Chl1P70232 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
Chl1P70232 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Chl1P70232 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Chl1P70232 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Chl1P70232 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Chl1P70232 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Chl1P70232 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Chl1P70232 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Chl1P70232 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Chl1P70232 Aqp6-201ENSMUST00000023754 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Chl1P70232 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Chl1P70232 Fbxl12-207ENSMUST00000151861 1668 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Chl1P70232 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Chl1P70232 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Chl1P70232 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Chl1P70232 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Chl1P70232 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Chl1P70232 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Chl1P70232 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Chl1P70232 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Chl1P70232 Rasgrp2-207ENSMUST00000113475 573 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Chl1P70232 Gm15966-201ENSMUST00000136853 480 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Chl1P70232 Egfl7-208ENSMUST00000149789 683 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Chl1P70232 Nat8f4-202ENSMUST00000159755 1129 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Chl1P70232 Gm17150-201ENSMUST00000165577 381 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Chl1P70232 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Chl1P70232 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Chl1P70232 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Chl1P70232 Gm13199-201ENSMUST00000071016 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Chl1P70232 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Chl1P70232 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Chl1P70232 AC096628.2-201ENSMUST00000225443 1413 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Chl1P70232 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Chl1P70232 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Chl1P70232 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Chl1P70232 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Chl1P70232 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Chl1P70232 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Chl1P70232 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Chl1P70232 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Chl1P70232 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Chl1P70232 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Chl1P70232 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Chl1P70232 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Chl1P70232 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Chl1P70232 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Chl1P70232 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Chl1P70232 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Chl1P70232 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Chl1P70232 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Chl1P70232 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Chl1P70232 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Chl1P70232 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Chl1P70232 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Chl1P70232 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Chl1P70232 Selenoh-203ENSMUST00000117299 747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Chl1P70232 Gm11814-201ENSMUST00000119515 929 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Chl1P70232 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Chl1P70232 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Chl1P70232 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Chl1P70232 Gm42906-201ENSMUST00000202365 408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Chl1P70232 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Chl1P70232 Mrps22-201ENSMUST00000035034 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Chl1P70232 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Chl1P70232 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Chl1P70232 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Chl1P70232 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Chl1P70232 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Chl1P70232 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Chl1P70232 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Chl1P70232 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Chl1P70232 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Chl1P70232 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Chl1P70232 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Chl1P70232 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Chl1P70232 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Chl1P70232 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Chl1P70232 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Chl1P70232 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Chl1P70232 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Chl1P70232 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Chl1P70232 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Chl1P70232 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Chl1P70232 N6amt1-203ENSMUST00000118310 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Chl1P70232 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Chl1P70232 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Chl1P70232 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Chl1P70232 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Chl1P70232 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Chl1P70232 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Chl1P70232 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Chl1P70232 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Chl1P70232 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Chl1P70232 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.5 ms