Protein–RNA interactions for Protein: P62892

Rpl39, 60S ribosomal protein L39, mousemouse

Predictions only

Length 51 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl39P62892 Plch2-206ENSMUST00000135665 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Rpl39P62892 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Rpl39P62892 Gse1-201ENSMUST00000034279 7127 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Rpl39P62892 Ak4-202ENSMUST00000106945 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Rpl39P62892 Gm20633-201ENSMUST00000176742 2831 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
Rpl39P62892 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Rpl39P62892 Sugp2-201ENSMUST00000093458 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Rpl39P62892 Klc2-202ENSMUST00000113727 2874 ntTSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Rpl39P62892 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Rpl39P62892 Phactr3-202ENSMUST00000103066 2680 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Rpl39P62892 Acap1-201ENSMUST00000001631 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Rpl39P62892 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Rpl39P62892 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Rpl39P62892 Lrig2-201ENSMUST00000046316 7099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Rpl39P62892 Dcst1-201ENSMUST00000070820 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Rpl39P62892 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Rpl39P62892 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Rpl39P62892 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Rpl39P62892 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Rpl39P62892 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Rpl39P62892 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
Rpl39P62892 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
Rpl39P62892 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Rpl39P62892 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Rpl39P62892 Sacs-202ENSMUST00000119509 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Rpl39P62892 Phldb1-218ENSMUST00000156918 3485 ntTSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Rpl39P62892 Gm10433-202ENSMUST00000146364 1984 ntTSL 2 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Rpl39P62892 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Rpl39P62892 Frzb-201ENSMUST00000028389 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Rpl39P62892 Spryd7-201ENSMUST00000022497 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Rpl39P62892 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Rpl39P62892 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Rpl39P62892 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Rpl39P62892 Zbtb44-205ENSMUST00000216649 3157 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Rpl39P62892 Fancc-201ENSMUST00000073029 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Rpl39P62892 Prkce-201ENSMUST00000097274 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Rpl39P62892 Mpp3-202ENSMUST00000100400 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Rpl39P62892 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Rpl39P62892 Nwd2-201ENSMUST00000159584 8534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Rpl39P62892 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
Rpl39P62892 Iqsec3-203ENSMUST00000151397 8067 ntTSL 2 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Rpl39P62892 Plekha7-203ENSMUST00000181998 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Rpl39P62892 Neurl3-201ENSMUST00000056946 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Rpl39P62892 Gpd2-201ENSMUST00000028167 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Rpl39P62892 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Rpl39P62892 Rp2-202ENSMUST00000115387 4498 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Rpl39P62892 Shc1-203ENSMUST00000107417 3079 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Rpl39P62892 Snx14-207ENSMUST00000174806 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Rpl39P62892 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Rpl39P62892 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Rpl39P62892 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Rpl39P62892 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Rpl39P62892 Mapt-204ENSMUST00000106992 5253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Rpl39P62892 Cacna1c-225ENSMUST00000219223 7483 ntTSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Rpl39P62892 Slc8a2-201ENSMUST00000168693 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Rpl39P62892 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Rpl39P62892 Gm44891-201ENSMUST00000208817 2223 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
Rpl39P62892 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Rpl39P62892 Chst15-201ENSMUST00000077472 5041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Rpl39P62892 Bcl2l2-201ENSMUST00000022806 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Rpl39P62892 Bud13-201ENSMUST00000074957 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Rpl39P62892 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Rpl39P62892 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Rpl39P62892 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
Rpl39P62892 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Rpl39P62892 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
Rpl39P62892 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Rpl39P62892 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Rpl39P62892 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Rpl39P62892 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Rpl39P62892 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
Rpl39P62892 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Rpl39P62892 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Rpl39P62892 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
Rpl39P62892 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Rpl39P62892 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Rpl39P62892 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Rpl39P62892 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Rpl39P62892 Spock3-202ENSMUST00000117377 3066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Rpl39P62892 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Rpl39P62892 Pbrm1-206ENSMUST00000112094 5154 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Rpl39P62892 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Rpl39P62892 Tmem39a-201ENSMUST00000002924 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Rpl39P62892 Gm38355-201ENSMUST00000192514 1570 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
Rpl39P62892 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Rpl39P62892 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Rpl39P62892 Ptgr2-208ENSMUST00000147363 1869 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Rpl39P62892 Nmral1-204ENSMUST00000120056 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Rpl39P62892 Man1a2-201ENSMUST00000008907 7969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Rpl39P62892 Zbtb20-201ENSMUST00000079441 3086 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Rpl39P62892 Elovl6-202ENSMUST00000197070 2275 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Rpl39P62892 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Rpl39P62892 Tle6-201ENSMUST00000072020 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Rpl39P62892 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Rpl39P62892 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Rpl39P62892 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Rpl39P62892 Ptp4a3-204ENSMUST00000167582 2640 ntTSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Rpl39P62892 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Rpl39P62892 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Rpl39P62892 Slc16a2-201ENSMUST00000042664 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms