Protein–RNA interactions for Protein: P62315

Snrpd1, Small nuclear ribonucleoprotein Sm D1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 119 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snrpd1P62315 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Snrpd1P62315 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Snrpd1P62315 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Snrpd1P62315 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Snrpd1P62315 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Snrpd1P62315 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Snrpd1P62315 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Snrpd1P62315 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Snrpd1P62315 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Snrpd1P62315 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Snrpd1P62315 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Snrpd1P62315 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Snrpd1P62315 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Snrpd1P62315 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Snrpd1P62315 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Snrpd1P62315 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Snrpd1P62315 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Snrpd1P62315 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Snrpd1P62315 Gm17330-201ENSMUST00000221047 165 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Snrpd1P62315 Tada3-203ENSMUST00000099118 1282 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Snrpd1P62315 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Snrpd1P62315 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Snrpd1P62315 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Snrpd1P62315 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Snrpd1P62315 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Snrpd1P62315 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Snrpd1P62315 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Snrpd1P62315 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Snrpd1P62315 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Snrpd1P62315 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Snrpd1P62315 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Snrpd1P62315 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Snrpd1P62315 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Snrpd1P62315 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Snrpd1P62315 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Snrpd1P62315 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Snrpd1P62315 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Snrpd1P62315 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Snrpd1P62315 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Snrpd1P62315 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Snrpd1P62315 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Snrpd1P62315 Gm15429-201ENSMUST00000151268 798 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Snrpd1P62315 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Snrpd1P62315 Gm38223-201ENSMUST00000194484 695 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Snrpd1P62315 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Snrpd1P62315 AC150560.1-201ENSMUST00000227731 1187 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Snrpd1P62315 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Snrpd1P62315 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Snrpd1P62315 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Snrpd1P62315 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Snrpd1P62315 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Snrpd1P62315 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Snrpd1P62315 Sbno2-209ENSMUST00000219260 4850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Snrpd1P62315 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Snrpd1P62315 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Snrpd1P62315 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Snrpd1P62315 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Snrpd1P62315 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Snrpd1P62315 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Snrpd1P62315 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Snrpd1P62315 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Snrpd1P62315 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Snrpd1P62315 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Snrpd1P62315 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Snrpd1P62315 Nfasc-207ENSMUST00000187861 4927 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Snrpd1P62315 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Snrpd1P62315 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Snrpd1P62315 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Snrpd1P62315 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Snrpd1P62315 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Snrpd1P62315 Zfp618-203ENSMUST00000107415 8826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Snrpd1P62315 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Snrpd1P62315 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Snrpd1P62315 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Snrpd1P62315 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Snrpd1P62315 Mir692-1-201ENSMUST00000102263 109 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Snrpd1P62315 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Snrpd1P62315 Rab15-204ENSMUST00000122419 856 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Snrpd1P62315 Gm16342-201ENSMUST00000124025 1025 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Snrpd1P62315 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Snrpd1P62315 Gm13070-201ENSMUST00000146532 768 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Snrpd1P62315 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Snrpd1P62315 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Snrpd1P62315 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Snrpd1P62315 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Snrpd1P62315 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Snrpd1P62315 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Snrpd1P62315 Gm42550-201ENSMUST00000201553 960 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Snrpd1P62315 AC125117.1-201ENSMUST00000228121 468 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Snrpd1P62315 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Snrpd1P62315 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Snrpd1P62315 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Snrpd1P62315 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Snrpd1P62315 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Snrpd1P62315 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Snrpd1P62315 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Snrpd1P62315 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Snrpd1P62315 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Snrpd1P62315 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Snrpd1P62315 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.9 ms