Protein–RNA interactions for Protein: P61407

Tdrd6, Tudor domain-containing protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 2,134 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tdrd6P61407 Gm17870-201ENSMUST00000219489 1174 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Tdrd6P61407 B230118H07Rik-202ENSMUST00000099682 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tdrd6P61407 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tdrd6P61407 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tdrd6P61407 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tdrd6P61407 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tdrd6P61407 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tdrd6P61407 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tdrd6P61407 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tdrd6P61407 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tdrd6P61407 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tdrd6P61407 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tdrd6P61407 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tdrd6P61407 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tdrd6P61407 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tdrd6P61407 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tdrd6P61407 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tdrd6P61407 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tdrd6P61407 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tdrd6P61407 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tdrd6P61407 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tdrd6P61407 Gm14350-201ENSMUST00000116642 640 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Tdrd6P61407 Gm13612-201ENSMUST00000119276 390 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Tdrd6P61407 Snhg9-201ENSMUST00000161706 183 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tdrd6P61407 Far2os1-201ENSMUST00000162391 555 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tdrd6P61407 Mhrt-201ENSMUST00000181782 828 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tdrd6P61407 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tdrd6P61407 Gm27839-201ENSMUST00000184242 106 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Tdrd6P61407 AC073947.2-201ENSMUST00000215888 1130 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Tdrd6P61407 Gm18473-201ENSMUST00000220543 868 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Tdrd6P61407 Pcgf1-201ENSMUST00000092614 866 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tdrd6P61407 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tdrd6P61407 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tdrd6P61407 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tdrd6P61407 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tdrd6P61407 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tdrd6P61407 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tdrd6P61407 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tdrd6P61407 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tdrd6P61407 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tdrd6P61407 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tdrd6P61407 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tdrd6P61407 Cpsf4l-203ENSMUST00000106617 1123 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tdrd6P61407 4933427I22Rik-201ENSMUST00000138672 393 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tdrd6P61407 Pmepa1os-201ENSMUST00000150185 680 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tdrd6P61407 Shisa5-203ENSMUST00000154184 1038 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tdrd6P61407 1700094J05Rik-202ENSMUST00000190491 997 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tdrd6P61407 Gm42442-201ENSMUST00000197951 1133 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Tdrd6P61407 Gm5149-201ENSMUST00000199768 620 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tdrd6P61407 Fkbp7-201ENSMUST00000002809 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tdrd6P61407 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tdrd6P61407 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tdrd6P61407 Abhd6-203ENSMUST00000225234 1958 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Tdrd6P61407 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tdrd6P61407 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tdrd6P61407 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tdrd6P61407 Gm11638-201ENSMUST00000153672 1615 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tdrd6P61407 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tdrd6P61407 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tdrd6P61407 Mup-ps23-201ENSMUST00000118063 630 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Tdrd6P61407 Pelp1-202ENSMUST00000135148 562 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tdrd6P61407 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tdrd6P61407 Lrp8os1-201ENSMUST00000030352 672 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tdrd6P61407 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tdrd6P61407 Miat-205ENSMUST00000182953 9163 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tdrd6P61407 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tdrd6P61407 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tdrd6P61407 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tdrd6P61407 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tdrd6P61407 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tdrd6P61407 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tdrd6P61407 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tdrd6P61407 Gm7553-201ENSMUST00000185805 1426 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Tdrd6P61407 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tdrd6P61407 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tdrd6P61407 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tdrd6P61407 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tdrd6P61407 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tdrd6P61407 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tdrd6P61407 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tdrd6P61407 Timm10b-202ENSMUST00000106780 671 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tdrd6P61407 Pax5-206ENSMUST00000134968 969 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tdrd6P61407 Snora78-201ENSMUST00000158630 128 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Tdrd6P61407 Tmem52-204ENSMUST00000178188 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tdrd6P61407 Tmem52-205ENSMUST00000178238 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tdrd6P61407 1700065I16Rik-202ENSMUST00000185477 813 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tdrd6P61407 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tdrd6P61407 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tdrd6P61407 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tdrd6P61407 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tdrd6P61407 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tdrd6P61407 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tdrd6P61407 Sostdc1-201ENSMUST00000041407 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tdrd6P61407 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tdrd6P61407 6030458C11Rik-202ENSMUST00000227299 3206 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Tdrd6P61407 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tdrd6P61407 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tdrd6P61407 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tdrd6P61407 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tdrd6P61407 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms