Protein–RNA interactions for Protein: P59913

Pcmtd1, Protein-L-isoaspartate O-methyltransferase domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 357 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcmtd1P59913 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pcmtd1P59913 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pcmtd1P59913 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pcmtd1P59913 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pcmtd1P59913 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pcmtd1P59913 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pcmtd1P59913 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pcmtd1P59913 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pcmtd1P59913 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Pcmtd1P59913 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pcmtd1P59913 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pcmtd1P59913 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pcmtd1P59913 Uggt2-212ENSMUST00000156203 6456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pcmtd1P59913 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pcmtd1P59913 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pcmtd1P59913 Wiz-201ENSMUST00000064694 2871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pcmtd1P59913 Pde8b-207ENSMUST00000162153 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pcmtd1P59913 Gdf6-201ENSMUST00000057613 3532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pcmtd1P59913 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pcmtd1P59913 Fgfr3-209ENSMUST00000164207 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pcmtd1P59913 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pcmtd1P59913 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pcmtd1P59913 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Pcmtd1P59913 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pcmtd1P59913 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Pcmtd1P59913 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Pcmtd1P59913 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pcmtd1P59913 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Pcmtd1P59913 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pcmtd1P59913 Fcgr1-201ENSMUST00000029748 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pcmtd1P59913 Sp3-202ENSMUST00000102689 4181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pcmtd1P59913 Eme2-201ENSMUST00000119848 5226 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pcmtd1P59913 Stau1-204ENSMUST00000109238 2976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pcmtd1P59913 Fbxo34-205ENSMUST00000168833 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pcmtd1P59913 Madd-212ENSMUST00000111375 5706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pcmtd1P59913 Zbtb7b-203ENSMUST00000107433 3650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pcmtd1P59913 Plagl1-201ENSMUST00000121325 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pcmtd1P59913 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pcmtd1P59913 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pcmtd1P59913 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pcmtd1P59913 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pcmtd1P59913 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pcmtd1P59913 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pcmtd1P59913 Jade1-204ENSMUST00000170711 2896 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pcmtd1P59913 Usp24-204ENSMUST00000165709 10594 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pcmtd1P59913 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pcmtd1P59913 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pcmtd1P59913 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pcmtd1P59913 Ppara-202ENSMUST00000109422 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pcmtd1P59913 Cdc37l1-207ENSMUST00000225210 4163 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pcmtd1P59913 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pcmtd1P59913 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pcmtd1P59913 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Pcmtd1P59913 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pcmtd1P59913 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pcmtd1P59913 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pcmtd1P59913 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pcmtd1P59913 Gm20618-202ENSMUST00000177482 1227 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pcmtd1P59913 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pcmtd1P59913 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Pcmtd1P59913 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Pcmtd1P59913 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pcmtd1P59913 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pcmtd1P59913 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pcmtd1P59913 Col14a1-203ENSMUST00000110221 5679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pcmtd1P59913 Klhl18-201ENSMUST00000068025 4530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pcmtd1P59913 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pcmtd1P59913 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pcmtd1P59913 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pcmtd1P59913 Hnrnpf-210ENSMUST00000180341 1922 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pcmtd1P59913 Ackr4-204ENSMUST00000219146 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pcmtd1P59913 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pcmtd1P59913 Efr3a-205ENSMUST00000173858 2848 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pcmtd1P59913 Golim4-202ENSMUST00000117242 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pcmtd1P59913 Gm45638-201ENSMUST00000211507 2878 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Pcmtd1P59913 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pcmtd1P59913 Ankrd61-201ENSMUST00000079624 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pcmtd1P59913 Mb21d1-201ENSMUST00000034898 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pcmtd1P59913 Rnf44-218ENSMUST00000177950 3941 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pcmtd1P59913 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Pcmtd1P59913 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pcmtd1P59913 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pcmtd1P59913 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pcmtd1P59913 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Pcmtd1P59913 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Pcmtd1P59913 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pcmtd1P59913 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pcmtd1P59913 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pcmtd1P59913 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pcmtd1P59913 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Pcmtd1P59913 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pcmtd1P59913 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pcmtd1P59913 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pcmtd1P59913 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pcmtd1P59913 Ampd2-202ENSMUST00000102637 3586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pcmtd1P59913 Gabpb1-205ENSMUST00000110424 2613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pcmtd1P59913 Amer2-201ENSMUST00000022561 10506 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pcmtd1P59913 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pcmtd1P59913 Vrtn-201ENSMUST00000095551 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pcmtd1P59913 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.6 ms