Protein–RNA interactions for Protein: P58873

Rhbdl3, Rhomboid-related protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhbdl3P58873 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rhbdl3P58873 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rhbdl3P58873 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rhbdl3P58873 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rhbdl3P58873 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rhbdl3P58873 Ighv7-3-201ENSMUST00000103461 361 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rhbdl3P58873 Spata3-202ENSMUST00000113344 1047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rhbdl3P58873 Gm12347-201ENSMUST00000127883 470 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rhbdl3P58873 Spdye4b-202ENSMUST00000159781 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rhbdl3P58873 2610300A13Rik-201ENSMUST00000192930 503 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Rhbdl3P58873 Dnajb6-210ENSMUST00000196528 1018 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rhbdl3P58873 Gm44069-201ENSMUST00000204898 506 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Rhbdl3P58873 Wfdc1-202ENSMUST00000212901 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rhbdl3P58873 AC173210.1-201ENSMUST00000222341 1131 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Rhbdl3P58873 Net1-207ENSMUST00000223258 597 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rhbdl3P58873 Lim2-201ENSMUST00000004732 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rhbdl3P58873 Gm10268-201ENSMUST00000085340 555 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Rhbdl3P58873 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rhbdl3P58873 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rhbdl3P58873 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rhbdl3P58873 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rhbdl3P58873 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rhbdl3P58873 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rhbdl3P58873 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rhbdl3P58873 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rhbdl3P58873 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rhbdl3P58873 Alas1-201ENSMUST00000074082 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rhbdl3P58873 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rhbdl3P58873 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rhbdl3P58873 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rhbdl3P58873 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rhbdl3P58873 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rhbdl3P58873 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rhbdl3P58873 Pnoc-202ENSMUST00000224594 1388 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rhbdl3P58873 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rhbdl3P58873 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rhbdl3P58873 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rhbdl3P58873 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rhbdl3P58873 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rhbdl3P58873 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rhbdl3P58873 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rhbdl3P58873 AC096628.2-201ENSMUST00000225443 1413 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Rhbdl3P58873 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rhbdl3P58873 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rhbdl3P58873 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rhbdl3P58873 Ighv2-9-201ENSMUST00000103451 362 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rhbdl3P58873 Rps3-202ENSMUST00000107096 952 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rhbdl3P58873 Pla2g10os-201ENSMUST00000141172 174 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rhbdl3P58873 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rhbdl3P58873 Gm38002-201ENSMUST00000193255 180 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Rhbdl3P58873 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rhbdl3P58873 Gm45880-201ENSMUST00000213041 853 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Rhbdl3P58873 Gm9803-202ENSMUST00000216543 456 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rhbdl3P58873 Gm36634-201ENSMUST00000218356 1259 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rhbdl3P58873 AC144543.1-201ENSMUST00000221840 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rhbdl3P58873 St13-201ENSMUST00000023039 1089 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rhbdl3P58873 Ambp-201ENSMUST00000030041 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rhbdl3P58873 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rhbdl3P58873 Utp23-201ENSMUST00000059599 740 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rhbdl3P58873 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rhbdl3P58873 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rhbdl3P58873 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rhbdl3P58873 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rhbdl3P58873 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rhbdl3P58873 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rhbdl3P58873 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rhbdl3P58873 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rhbdl3P58873 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rhbdl3P58873 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rhbdl3P58873 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rhbdl3P58873 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rhbdl3P58873 Fsd1-201ENSMUST00000011733 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rhbdl3P58873 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rhbdl3P58873 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rhbdl3P58873 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rhbdl3P58873 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rhbdl3P58873 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rhbdl3P58873 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rhbdl3P58873 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rhbdl3P58873 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rhbdl3P58873 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rhbdl3P58873 Gm15684-201ENSMUST00000160605 1814 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rhbdl3P58873 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rhbdl3P58873 Ndufs5-202ENSMUST00000106206 599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rhbdl3P58873 Ppih-203ENSMUST00000106318 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rhbdl3P58873 Emd-204ENSMUST00000119197 768 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rhbdl3P58873 D930015M05Rik-201ENSMUST00000126002 1190 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rhbdl3P58873 Crb3-204ENSMUST00000163763 868 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rhbdl3P58873 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rhbdl3P58873 Comt-201ENSMUST00000000335 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rhbdl3P58873 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rhbdl3P58873 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rhbdl3P58873 Dlk1-204ENSMUST00000109843 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rhbdl3P58873 Krt40-201ENSMUST00000074253 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rhbdl3P58873 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rhbdl3P58873 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rhbdl3P58873 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rhbdl3P58873 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rhbdl3P58873 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rhbdl3P58873 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms