Protein–RNA interactions for Protein: P56399

Usp5, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 858 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp5P56399 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp5P56399 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp5P56399 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp5P56399 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp5P56399 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp5P56399 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp5P56399 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp5P56399 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp5P56399 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp5P56399 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp5P56399 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp5P56399 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp5P56399 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp5P56399 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp5P56399 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Usp5P56399 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Usp5P56399 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Usp5P56399 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Usp5P56399 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Usp5P56399 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Usp5P56399 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Usp5P56399 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Usp5P56399 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Usp5P56399 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Usp5P56399 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Usp5P56399 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Usp5P56399 Ptgr2-205ENSMUST00000135001 1286 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Usp5P56399 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Usp5P56399 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Usp5P56399 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Usp5P56399 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Usp5P56399 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Usp5P56399 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Usp5P56399 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Usp5P56399 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Usp5P56399 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Usp5P56399 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Usp5P56399 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Usp5P56399 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Usp5P56399 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Usp5P56399 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Usp5P56399 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Usp5P56399 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Usp5P56399 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Usp5P56399 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Usp5P56399 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Usp5P56399 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Usp5P56399 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Usp5P56399 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Usp5P56399 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Usp5P56399 Gm15755-201ENSMUST00000133698 659 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Usp5P56399 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Usp5P56399 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Usp5P56399 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Usp5P56399 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Usp5P56399 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Usp5P56399 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Usp5P56399 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Usp5P56399 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Usp5P56399 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Usp5P56399 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Usp5P56399 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Usp5P56399 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Usp5P56399 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Usp5P56399 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Usp5P56399 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Usp5P56399 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Usp5P56399 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Usp5P56399 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Usp5P56399 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Usp5P56399 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Usp5P56399 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Usp5P56399 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Usp5P56399 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Usp5P56399 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Usp5P56399 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Usp5P56399 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Usp5P56399 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Usp5P56399 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Usp5P56399 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Usp5P56399 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Usp5P56399 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Usp5P56399 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Usp5P56399 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Usp5P56399 AC150560.1-201ENSMUST00000227731 1187 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Usp5P56399 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Usp5P56399 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Usp5P56399 Tada3-203ENSMUST00000099118 1282 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Usp5P56399 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Usp5P56399 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Usp5P56399 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Usp5P56399 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Usp5P56399 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Usp5P56399 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Usp5P56399 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Usp5P56399 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Usp5P56399 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Usp5P56399 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Usp5P56399 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Usp5P56399 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51 ms