Protein–RNA interactions for Protein: P51682

Ccr5, C-C chemokine receptor type 5, mousemouse

Predictions only

Length 354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccr5P51682 AC126253.1-201ENSMUST00000227974 824 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccr5P51682 Gm11563-201ENSMUST00000092695 1012 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccr5P51682 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccr5P51682 Plaur-201ENSMUST00000002284 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccr5P51682 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccr5P51682 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccr5P51682 Gm7553-201ENSMUST00000185805 1426 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccr5P51682 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccr5P51682 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccr5P51682 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccr5P51682 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
Ccr5P51682 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccr5P51682 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccr5P51682 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccr5P51682 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccr5P51682 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccr5P51682 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccr5P51682 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccr5P51682 Gm23931-201ENSMUST00000103842 109 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccr5P51682 Spatc1l-202ENSMUST00000105414 1060 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccr5P51682 Gm12203-201ENSMUST00000118235 598 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccr5P51682 Gm12209-201ENSMUST00000120089 596 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccr5P51682 Gm16282-201ENSMUST00000162641 451 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccr5P51682 6030498E09Rik-202ENSMUST00000168144 510 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccr5P51682 Gm8565-201ENSMUST00000183259 1014 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccr5P51682 Dnm3os-203ENSMUST00000185878 557 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccr5P51682 Gm34549-203ENSMUST00000208300 896 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccr5P51682 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccr5P51682 Mrto4-ps1-201ENSMUST00000220565 721 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccr5P51682 Fkbp7-201ENSMUST00000002809 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccr5P51682 Upk2-201ENSMUST00000047740 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccr5P51682 Gm5129-201ENSMUST00000065372 300 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccr5P51682 4933436I20Rik-202ENSMUST00000190615 1509 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccr5P51682 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccr5P51682 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccr5P51682 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccr5P51682 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccr5P51682 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccr5P51682 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccr5P51682 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccr5P51682 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccr5P51682 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccr5P51682 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccr5P51682 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccr5P51682 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccr5P51682 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccr5P51682 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccr5P51682 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccr5P51682 Gm11725-201ENSMUST00000125607 1850 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccr5P51682 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccr5P51682 Prdx2-203ENSMUST00000109734 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccr5P51682 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccr5P51682 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccr5P51682 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccr5P51682 Dctn4-202ENSMUST00000223590 1530 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccr5P51682 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccr5P51682 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccr5P51682 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccr5P51682 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccr5P51682 Aqp6-201ENSMUST00000023754 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccr5P51682 Trav4d-2-201ENSMUST00000120914 335 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccr5P51682 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccr5P51682 Gm37592-201ENSMUST00000192741 373 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccr5P51682 Dnd1-ps-201ENSMUST00000196992 964 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccr5P51682 1810059H22Rik-208ENSMUST00000204941 642 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccr5P51682 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccr5P51682 Cox7a2-201ENSMUST00000034881 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccr5P51682 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccr5P51682 Rpl10l-201ENSMUST00000081908 1023 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccr5P51682 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccr5P51682 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccr5P51682 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccr5P51682 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccr5P51682 Celrr-202ENSMUST00000181433 1561 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccr5P51682 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccr5P51682 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccr5P51682 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccr5P51682 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccr5P51682 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccr5P51682 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccr5P51682 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccr5P51682 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccr5P51682 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccr5P51682 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccr5P51682 Ociad1-201ENSMUST00000031038 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccr5P51682 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccr5P51682 Gas8-201ENSMUST00000093043 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccr5P51682 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccr5P51682 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccr5P51682 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccr5P51682 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccr5P51682 Ssr4-208ENSMUST00000166518 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccr5P51682 Aif1-206ENSMUST00000173324 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccr5P51682 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccr5P51682 1700065I16Rik-202ENSMUST00000185477 813 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccr5P51682 Mturn-202ENSMUST00000187701 503 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccr5P51682 Myl10-202ENSMUST00000196068 911 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccr5P51682 Myl10-203ENSMUST00000196436 598 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccr5P51682 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccr5P51682 Gabarapl1-204ENSMUST00000204956 539 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.1 ms