Protein–RNA interactions for Protein: P50704

Defa6, Alpha-defensin 6/12, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa6P50704 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Defa6P50704 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Defa6P50704 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Defa6P50704 Fbxo34-205ENSMUST00000168833 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Defa6P50704 Megf11-201ENSMUST00000068967 6680 ntTSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Defa6P50704 Dip2a-202ENSMUST00000105417 6383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Defa6P50704 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Defa6P50704 Coro2b-201ENSMUST00000048043 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Defa6P50704 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Defa6P50704 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Defa6P50704 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Defa6P50704 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Defa6P50704 Slc4a3-202ENSMUST00000124341 7182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Defa6P50704 Grik3-201ENSMUST00000030676 8973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Defa6P50704 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Defa6P50704 Armcx1-206ENSMUST00000113201 2228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Defa6P50704 2610011E03Rik-201ENSMUST00000200128 2235 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Defa6P50704 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Defa6P50704 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Defa6P50704 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Defa6P50704 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Defa6P50704 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Defa6P50704 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Defa6P50704 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Defa6P50704 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Defa6P50704 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Defa6P50704 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Defa6P50704 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Defa6P50704 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Defa6P50704 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Defa6P50704 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Defa6P50704 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Defa6P50704 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Defa6P50704 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Defa6P50704 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Defa6P50704 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Defa6P50704 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Defa6P50704 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Defa6P50704 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Defa6P50704 Egr2-202ENSMUST00000105438 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Defa6P50704 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Defa6P50704 Fam198a-203ENSMUST00000214536 2789 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Defa6P50704 Pitpnm2-201ENSMUST00000086123 6620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Defa6P50704 Ubqln5-201ENSMUST00000053743 1915 ntAPPRIS P1 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Defa6P50704 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Defa6P50704 Ift140-201ENSMUST00000024983 5489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Defa6P50704 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Defa6P50704 Pex5-205ENSMUST00000112532 3148 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Defa6P50704 Klhl26-203ENSMUST00000209415 2919 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Defa6P50704 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Defa6P50704 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Defa6P50704 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Defa6P50704 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Defa6P50704 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Defa6P50704 Pdxk-201ENSMUST00000041616 5124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Defa6P50704 Fam43a-201ENSMUST00000059078 3075 ntAPPRIS P1 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Defa6P50704 Slc8a2-201ENSMUST00000168693 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Defa6P50704 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Defa6P50704 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Defa6P50704 Smim1-213ENSMUST00000182151 5091 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Defa6P50704 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Defa6P50704 Ap2a1-201ENSMUST00000085399 3442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Defa6P50704 Acvr1c-201ENSMUST00000028178 9162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Defa6P50704 AL732309.2-201ENSMUST00000228052 3210 ntAPPRIS P1 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Defa6P50704 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Defa6P50704 Ripor3-201ENSMUST00000099073 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Defa6P50704 Anks1b-221ENSMUST00000182786 3042 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Defa6P50704 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Defa6P50704 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Defa6P50704 4931429P17Rik-201ENSMUST00000061899 2012 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Defa6P50704 Gm35040-201ENSMUST00000206829 5094 ntTSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Defa6P50704 Jph2-202ENSMUST00000109425 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Defa6P50704 Zbtb7b-202ENSMUST00000107432 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Defa6P50704 Myo18a-221ENSMUST00000167856 6132 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Defa6P50704 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Defa6P50704 Sh3pxd2a-202ENSMUST00000111800 10380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Defa6P50704 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Defa6P50704 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Defa6P50704 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Defa6P50704 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Defa6P50704 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Defa6P50704 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Defa6P50704 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Defa6P50704 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Defa6P50704 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Defa6P50704 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Defa6P50704 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Defa6P50704 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Defa6P50704 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Defa6P50704 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Defa6P50704 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Defa6P50704 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Defa6P50704 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Defa6P50704 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Defa6P50704 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Defa6P50704 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Defa6P50704 F2-202ENSMUST00000111335 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Defa6P50704 Xpnpep1-209ENSMUST00000183108 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Defa6P50704 Podn-202ENSMUST00000106708 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Defa6P50704 Slit2-216ENSMUST00000174313 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms