Protein–RNA interactions for Protein: P49813

Tmod1, Tropomodulin-1, mousemouse

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Length 359 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmod1P49813 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmod1P49813 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmod1P49813 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmod1P49813 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmod1P49813 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmod1P49813 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmod1P49813 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmod1P49813 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
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Tmod1P49813 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmod1P49813 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmod1P49813 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmod1P49813 Fktn-204ENSMUST00000221657 6241 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmod1P49813 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmod1P49813 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmod1P49813 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmod1P49813 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmod1P49813 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
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Tmod1P49813 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmod1P49813 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmod1P49813 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmod1P49813 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmod1P49813 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmod1P49813 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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Tmod1P49813 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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Tmod1P49813 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmod1P49813 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
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Tmod1P49813 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmod1P49813 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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Tmod1P49813 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmod1P49813 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmod1P49813 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmod1P49813 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmod1P49813 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
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Tmod1P49813 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmod1P49813 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmod1P49813 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tmod1P49813 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tmod1P49813 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tmod1P49813 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Tmod1P49813 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tmod1P49813 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Tmod1P49813 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Tmod1P49813 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tmod1P49813 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tmod1P49813 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Tmod1P49813 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tmod1P49813 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tmod1P49813 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Tmod1P49813 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tmod1P49813 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tmod1P49813 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tmod1P49813 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tmod1P49813 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tmod1P49813 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tmod1P49813 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tmod1P49813 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tmod1P49813 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tmod1P49813 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tmod1P49813 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tmod1P49813 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tmod1P49813 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tmod1P49813 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tmod1P49813 Mir692-1-201ENSMUST00000102263 109 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Tmod1P49813 Gm14127-201ENSMUST00000117906 678 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Tmod1P49813 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Tmod1P49813 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tmod1P49813 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tmod1P49813 Gm37667-201ENSMUST00000193103 752 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tmod1P49813 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
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Tmod1P49813 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
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