Protein–RNA interactions for Protein: P48410

Abcd1, ATP-binding cassette sub-family D member 1, mousemouse

Predictions only

Length 736 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcd1P48410 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Abcd1P48410 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Abcd1P48410 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Abcd1P48410 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Abcd1P48410 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Abcd1P48410 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Abcd1P48410 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Abcd1P48410 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Abcd1P48410 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Abcd1P48410 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Abcd1P48410 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Abcd1P48410 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Abcd1P48410 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Abcd1P48410 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Abcd1P48410 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Abcd1P48410 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Abcd1P48410 Aida-201ENSMUST00000109166 4279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Abcd1P48410 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Abcd1P48410 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Abcd1P48410 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Abcd1P48410 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Abcd1P48410 Bace1-201ENSMUST00000034591 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Abcd1P48410 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Abcd1P48410 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Abcd1P48410 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Abcd1P48410 Dst-213ENSMUST00000183302 8788 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Abcd1P48410 Kcnt1-204ENSMUST00000114176 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Abcd1P48410 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Abcd1P48410 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Abcd1P48410 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Abcd1P48410 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Abcd1P48410 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Abcd1P48410 0610010F05Rik-208ENSMUST00000180260 4128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Abcd1P48410 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Abcd1P48410 Pax2-203ENSMUST00000174490 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Abcd1P48410 Pcdh19-202ENSMUST00000149154 10289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Abcd1P48410 Ak4-201ENSMUST00000102780 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Abcd1P48410 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Abcd1P48410 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Abcd1P48410 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Abcd1P48410 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Abcd1P48410 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Abcd1P48410 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Abcd1P48410 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Abcd1P48410 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Abcd1P48410 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Abcd1P48410 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Abcd1P48410 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Abcd1P48410 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Abcd1P48410 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Abcd1P48410 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Abcd1P48410 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Abcd1P48410 Plxnb2-202ENSMUST00000109331 6377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Abcd1P48410 Gm14752-201ENSMUST00000120719 2075 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Abcd1P48410 Sertad2-203ENSMUST00000109586 5515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Abcd1P48410 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Abcd1P48410 Zc3h4-202ENSMUST00000209289 5853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Abcd1P48410 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Abcd1P48410 Cdc14a-202ENSMUST00000106491 4292 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Abcd1P48410 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Abcd1P48410 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Abcd1P48410 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Abcd1P48410 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Abcd1P48410 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Abcd1P48410 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Abcd1P48410 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Abcd1P48410 Ankrd17-201ENSMUST00000014421 10458 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Abcd1P48410 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Abcd1P48410 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Abcd1P48410 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Abcd1P48410 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Abcd1P48410 Chst3-201ENSMUST00000068690 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Abcd1P48410 Tnrc6c-201ENSMUST00000026658 8724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Abcd1P48410 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Abcd1P48410 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Abcd1P48410 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Abcd1P48410 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Abcd1P48410 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Abcd1P48410 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Abcd1P48410 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Abcd1P48410 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Abcd1P48410 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Abcd1P48410 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Abcd1P48410 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Abcd1P48410 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Abcd1P48410 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Abcd1P48410 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Abcd1P48410 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Abcd1P48410 Esr1-204ENSMUST00000105590 6339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Abcd1P48410 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Abcd1P48410 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Abcd1P48410 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Abcd1P48410 Fzd1-201ENSMUST00000054294 4197 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Abcd1P48410 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Abcd1P48410 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Abcd1P48410 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Abcd1P48410 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Abcd1P48410 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Abcd1P48410 Tbx3-203ENSMUST00000121021 4777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Abcd1P48410 Tecpr1-201ENSMUST00000085701 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.4 ms