Protein–RNA interactions for Protein: P48030

Tgfa, Protransforming growth factor alpha, mousemouse

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Length 159 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TgfaP48030 Pnck-203ENSMUST00000114473 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
TgfaP48030 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
TgfaP48030 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
TgfaP48030 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
TgfaP48030 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
TgfaP48030 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
TgfaP48030 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC11.86□□□□□ -0.51
TgfaP48030 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
TgfaP48030 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
TgfaP48030 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
TgfaP48030 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
TgfaP48030 Fchsd1-201ENSMUST00000043437 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
TgfaP48030 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
TgfaP48030 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
TgfaP48030 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
TgfaP48030 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
TgfaP48030 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
TgfaP48030 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
TgfaP48030 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
TgfaP48030 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
TgfaP48030 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
TgfaP48030 Gm11793-201ENSMUST00000120433 981 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
TgfaP48030 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
TgfaP48030 Gm16087-201ENSMUST00000124395 964 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
TgfaP48030 Gm11791-201ENSMUST00000139327 336 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
TgfaP48030 Gm13070-201ENSMUST00000146532 768 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
TgfaP48030 Ube4bos1-202ENSMUST00000151896 1286 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
TgfaP48030 Egfl7-211ENSMUST00000152988 723 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
TgfaP48030 Gm14209-201ENSMUST00000154946 462 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
TgfaP48030 Borcs5-202ENSMUST00000166591 792 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
TgfaP48030 Rn7s1-201ENSMUST00000174924 300 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
TgfaP48030 Rn7s2-201ENSMUST00000175032 300 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
TgfaP48030 Gm26461-201ENSMUST00000175064 290 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
TgfaP48030 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
TgfaP48030 Gm37922-201ENSMUST00000195596 455 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
TgfaP48030 Gm44127-201ENSMUST00000203565 291 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
TgfaP48030 Olfr284-202ENSMUST00000206647 966 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
TgfaP48030 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
TgfaP48030 Gm33056-201ENSMUST00000213234 1120 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
TgfaP48030 Cts7-204ENSMUST00000225321 1257 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
TgfaP48030 AC134335.2-201ENSMUST00000227660 440 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
TgfaP48030 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
TgfaP48030 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
TgfaP48030 Mea1-201ENSMUST00000002845 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
TgfaP48030 Bphl-201ENSMUST00000040656 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
TgfaP48030 Capg-201ENSMUST00000071044 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
TgfaP48030 Olfr171-201ENSMUST00000079891 945 ntAPPRIS P2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
TgfaP48030 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
TgfaP48030 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
TgfaP48030 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
TgfaP48030 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
TgfaP48030 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
TgfaP48030 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
TgfaP48030 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
TgfaP48030 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
TgfaP48030 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
TgfaP48030 Psmc3-203ENSMUST00000111441 1419 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
TgfaP48030 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
TgfaP48030 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
TgfaP48030 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
TgfaP48030 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
TgfaP48030 Olfr61-202ENSMUST00000210241 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
TgfaP48030 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
TgfaP48030 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
TgfaP48030 Gas8-201ENSMUST00000093043 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
TgfaP48030 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
TgfaP48030 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
TgfaP48030 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
TgfaP48030 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
TgfaP48030 Gm9755-201ENSMUST00000032981 1356 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
TgfaP48030 Myh3-201ENSMUST00000007301 5992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
TgfaP48030 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
TgfaP48030 Mad2l2-203ENSMUST00000105707 949 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
TgfaP48030 Cdkn1a-202ENSMUST00000119901 748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
TgfaP48030 Isg20-204ENSMUST00000121645 1087 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
TgfaP48030 Ecscr-204ENSMUST00000133064 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
TgfaP48030 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
TgfaP48030 Gm26927-201ENSMUST00000182385 965 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
TgfaP48030 Gm38000-201ENSMUST00000192390 1215 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
TgfaP48030 Gm36937-201ENSMUST00000192957 429 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
TgfaP48030 Atp6v0c-ps1-201ENSMUST00000206596 463 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
TgfaP48030 Gm17870-201ENSMUST00000219489 1174 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
TgfaP48030 Gm17330-201ENSMUST00000221047 165 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
TgfaP48030 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
TgfaP48030 Tescl-201ENSMUST00000069562 855 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
TgfaP48030 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
TgfaP48030 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
TgfaP48030 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
TgfaP48030 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
TgfaP48030 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
TgfaP48030 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
TgfaP48030 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
TgfaP48030 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
TgfaP48030 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
TgfaP48030 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
TgfaP48030 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
TgfaP48030 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
TgfaP48030 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
TgfaP48030 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
TgfaP48030 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
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