Protein–RNA interactions for Protein: P47242

Pax9, Paired box protein Pax-9, mousemouse

Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pax9P47242 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pax9P47242 Gm10433-202ENSMUST00000146364 1984 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pax9P47242 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pax9P47242 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pax9P47242 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pax9P47242 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pax9P47242 Wiz-201ENSMUST00000064694 2871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pax9P47242 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pax9P47242 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pax9P47242 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pax9P47242 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pax9P47242 Asb10-201ENSMUST00000048302 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pax9P47242 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pax9P47242 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pax9P47242 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pax9P47242 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pax9P47242 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pax9P47242 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pax9P47242 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pax9P47242 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pax9P47242 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pax9P47242 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pax9P47242 Gm7002-201ENSMUST00000221386 2165 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Pax9P47242 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pax9P47242 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pax9P47242 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pax9P47242 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pax9P47242 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pax9P47242 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pax9P47242 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pax9P47242 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Pax9P47242 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pax9P47242 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pax9P47242 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pax9P47242 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Pax9P47242 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pax9P47242 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pax9P47242 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pax9P47242 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pax9P47242 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pax9P47242 Ifi47-201ENSMUST00000046704 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pax9P47242 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pax9P47242 Gm43134-201ENSMUST00000199434 1886 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Pax9P47242 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pax9P47242 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pax9P47242 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pax9P47242 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pax9P47242 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pax9P47242 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pax9P47242 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pax9P47242 Pigq-209ENSMUST00000140304 1835 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pax9P47242 Cbs-203ENSMUST00000118504 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pax9P47242 Slc4a1ap-209ENSMUST00000202214 2806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pax9P47242 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pax9P47242 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pax9P47242 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pax9P47242 Adcyap1r1-206ENSMUST00000167234 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pax9P47242 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pax9P47242 Mul1-201ENSMUST00000044058 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pax9P47242 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pax9P47242 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pax9P47242 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pax9P47242 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pax9P47242 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pax9P47242 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pax9P47242 Ccdc116-203ENSMUST00000115711 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pax9P47242 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pax9P47242 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pax9P47242 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pax9P47242 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pax9P47242 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pax9P47242 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pax9P47242 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pax9P47242 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pax9P47242 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Pax9P47242 Tsku-206ENSMUST00000179780 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pax9P47242 Map10-201ENSMUST00000053078 3542 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pax9P47242 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pax9P47242 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pax9P47242 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pax9P47242 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pax9P47242 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pax9P47242 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pax9P47242 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pax9P47242 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pax9P47242 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pax9P47242 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pax9P47242 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Pax9P47242 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pax9P47242 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pax9P47242 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pax9P47242 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pax9P47242 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pax9P47242 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pax9P47242 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pax9P47242 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pax9P47242 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pax9P47242 AC131997.1-201ENSMUST00000228611 1229 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Pax9P47242 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pax9P47242 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms