Protein–RNA interactions for Protein: P41274

Tnfsf9, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 9, mousemouse

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Length 309 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf9P41274 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tnfsf9P41274 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Tnfsf9P41274 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tnfsf9P41274 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tnfsf9P41274 Clec4g-201ENSMUST00000058040 1441 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tnfsf9P41274 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tnfsf9P41274 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tnfsf9P41274 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tnfsf9P41274 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tnfsf9P41274 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tnfsf9P41274 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tnfsf9P41274 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tnfsf9P41274 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tnfsf9P41274 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tnfsf9P41274 Dysf-201ENSMUST00000081904 6660 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tnfsf9P41274 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tnfsf9P41274 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tnfsf9P41274 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Tnfsf9P41274 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tnfsf9P41274 Cit-203ENSMUST00000112008 6087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tnfsf9P41274 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tnfsf9P41274 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Tnfsf9P41274 Gm10863-205ENSMUST00000148028 905 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tnfsf9P41274 Pmepa1os-201ENSMUST00000150185 680 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tnfsf9P41274 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tnfsf9P41274 Cradd-202ENSMUST00000217809 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tnfsf9P41274 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tnfsf9P41274 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Tnfsf9P41274 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tnfsf9P41274 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tnfsf9P41274 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Tnfsf9P41274 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tnfsf9P41274 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tnfsf9P41274 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tnfsf9P41274 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tnfsf9P41274 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tnfsf9P41274 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tnfsf9P41274 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tnfsf9P41274 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tnfsf9P41274 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tnfsf9P41274 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Tnfsf9P41274 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tnfsf9P41274 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tnfsf9P41274 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tnfsf9P41274 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tnfsf9P41274 Bcl11a-202ENSMUST00000109514 5989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tnfsf9P41274 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tnfsf9P41274 Pcdh19-202ENSMUST00000149154 10289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tnfsf9P41274 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tnfsf9P41274 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tnfsf9P41274 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tnfsf9P41274 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tnfsf9P41274 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tnfsf9P41274 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tnfsf9P41274 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Tnfsf9P41274 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Tnfsf9P41274 Gm15824-201ENSMUST00000119516 955 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Tnfsf9P41274 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tnfsf9P41274 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tnfsf9P41274 Gm17232-201ENSMUST00000164515 453 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tnfsf9P41274 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tnfsf9P41274 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tnfsf9P41274 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Tnfsf9P41274 4930438A08Rik-202ENSMUST00000208022 918 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tnfsf9P41274 Gm17794-201ENSMUST00000220252 955 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Tnfsf9P41274 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tnfsf9P41274 Tnfrsf19-205ENSMUST00000225730 744 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tnfsf9P41274 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tnfsf9P41274 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tnfsf9P41274 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tnfsf9P41274 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tnfsf9P41274 Cacna1g-202ENSMUST00000100561 8125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tnfsf9P41274 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tnfsf9P41274 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tnfsf9P41274 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tnfsf9P41274 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tnfsf9P41274 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tnfsf9P41274 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tnfsf9P41274 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tnfsf9P41274 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tnfsf9P41274 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tnfsf9P41274 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tnfsf9P41274 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tnfsf9P41274 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tnfsf9P41274 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tnfsf9P41274 Phka1-203ENSMUST00000113611 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tnfsf9P41274 Phka1-205ENSMUST00000120270 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tnfsf9P41274 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tnfsf9P41274 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
Tnfsf9P41274 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Tnfsf9P41274 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Tnfsf9P41274 Fchsd1-201ENSMUST00000043437 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Tnfsf9P41274 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Tnfsf9P41274 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Tnfsf9P41274 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Tnfsf9P41274 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Tnfsf9P41274 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tnfsf9P41274 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tnfsf9P41274 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tnfsf9P41274 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
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