Protein–RNA interactions for Protein: P37913

Lig1, DNA ligase 1, mousemouse

Predictions only

Length 916 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lig1P37913 Gm8062-201ENSMUST00000139696 444 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Lig1P37913 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lig1P37913 Gm26721-201ENSMUST00000181723 992 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lig1P37913 1600017P15Rik-202ENSMUST00000193960 890 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Lig1P37913 Gm43818-201ENSMUST00000200605 466 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Lig1P37913 Chd3os-203ENSMUST00000218008 1026 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lig1P37913 Gstt2-203ENSMUST00000218500 794 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lig1P37913 Snx24-201ENSMUST00000025417 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lig1P37913 Tex26-201ENSMUST00000031667 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lig1P37913 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lig1P37913 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lig1P37913 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Lig1P37913 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lig1P37913 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lig1P37913 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lig1P37913 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lig1P37913 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lig1P37913 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lig1P37913 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lig1P37913 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lig1P37913 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lig1P37913 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lig1P37913 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lig1P37913 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lig1P37913 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lig1P37913 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lig1P37913 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lig1P37913 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lig1P37913 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lig1P37913 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lig1P37913 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lig1P37913 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lig1P37913 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lig1P37913 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lig1P37913 Gm7553-201ENSMUST00000185805 1426 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Lig1P37913 Gm42693-201ENSMUST00000196779 631 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Lig1P37913 Gm45331-201ENSMUST00000209868 554 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Lig1P37913 Gm36634-201ENSMUST00000218356 1259 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lig1P37913 AC126253.1-201ENSMUST00000227974 824 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Lig1P37913 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lig1P37913 Mrps22-201ENSMUST00000035034 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lig1P37913 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lig1P37913 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lig1P37913 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lig1P37913 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lig1P37913 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lig1P37913 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lig1P37913 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lig1P37913 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lig1P37913 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lig1P37913 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lig1P37913 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lig1P37913 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lig1P37913 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lig1P37913 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lig1P37913 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lig1P37913 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lig1P37913 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lig1P37913 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lig1P37913 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lig1P37913 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Lig1P37913 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lig1P37913 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lig1P37913 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lig1P37913 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lig1P37913 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lig1P37913 Glrx2-202ENSMUST00000111957 580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lig1P37913 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lig1P37913 Sbk3-201ENSMUST00000133272 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lig1P37913 Gm6152-201ENSMUST00000151704 340 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Lig1P37913 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lig1P37913 Gm20652-201ENSMUST00000177314 383 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lig1P37913 1700037C18Rik-205ENSMUST00000177323 915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lig1P37913 Mir6420-201ENSMUST00000185032 102 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Lig1P37913 Cryaa-201ENSMUST00000019192 1176 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lig1P37913 Sct-204ENSMUST00000211667 506 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lig1P37913 Wfdc1-202ENSMUST00000212901 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lig1P37913 AC140451.2-201ENSMUST00000228030 664 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Lig1P37913 Cox7a2-201ENSMUST00000034881 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lig1P37913 Gm11562-201ENSMUST00000073853 817 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lig1P37913 Ifitm10-202ENSMUST00000084412 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lig1P37913 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lig1P37913 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lig1P37913 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lig1P37913 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lig1P37913 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lig1P37913 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lig1P37913 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lig1P37913 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lig1P37913 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lig1P37913 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lig1P37913 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lig1P37913 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lig1P37913 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lig1P37913 Gm8213-201ENSMUST00000118191 441 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Lig1P37913 Gm5687-201ENSMUST00000118252 640 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Lig1P37913 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lig1P37913 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lig1P37913 Gm16282-201ENSMUST00000162641 451 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lig1P37913 Ighv2-3-201ENSMUST00000178229 347 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.6 ms