Protein–RNA interactions for Protein: P23812

Hoxd12, Homeobox protein Hox-D12, mousemouse

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Length 268 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd12P23812 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Hoxd12P23812 Fbxw7-201ENSMUST00000029727 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Hoxd12P23812 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Hoxd12P23812 Bcs1l-203ENSMUST00000113733 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Hoxd12P23812 Gm8706-201ENSMUST00000197372 1491 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Hoxd12P23812 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Hoxd12P23812 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Hoxd12P23812 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hoxd12P23812 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hoxd12P23812 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hoxd12P23812 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hoxd12P23812 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hoxd12P23812 Ube2j2-204ENSMUST00000105582 1394 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hoxd12P23812 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hoxd12P23812 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hoxd12P23812 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hoxd12P23812 Hnf4aos-203ENSMUST00000141329 839 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hoxd12P23812 Creb3-206ENSMUST00000167751 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hoxd12P23812 D930030I03Rik-201ENSMUST00000180735 920 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hoxd12P23812 Gm11523-203ENSMUST00000184482 802 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hoxd12P23812 Gm45865-201ENSMUST00000211815 945 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Hoxd12P23812 Ifi30-202ENSMUST00000222087 981 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hoxd12P23812 Mea1-201ENSMUST00000002845 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hoxd12P23812 Cldnd2-201ENSMUST00000040227 664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hoxd12P23812 Cryge-201ENSMUST00000087359 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hoxd12P23812 Olfr521-201ENSMUST00000098263 967 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hoxd12P23812 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hoxd12P23812 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hoxd12P23812 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hoxd12P23812 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hoxd12P23812 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hoxd12P23812 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hoxd12P23812 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hoxd12P23812 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hoxd12P23812 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hoxd12P23812 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hoxd12P23812 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hoxd12P23812 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hoxd12P23812 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hoxd12P23812 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hoxd12P23812 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hoxd12P23812 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hoxd12P23812 Hyal1-204ENSMUST00000144392 1332 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hoxd12P23812 Gm15336-201ENSMUST00000128894 1571 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hoxd12P23812 Gm45684-201ENSMUST00000210244 1571 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Hoxd12P23812 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hoxd12P23812 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hoxd12P23812 Itk-202ENSMUST00000101306 1185 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hoxd12P23812 Phlda2-201ENSMUST00000010904 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hoxd12P23812 Gm13886-201ENSMUST00000117876 1183 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Hoxd12P23812 Drap1-209ENSMUST00000136579 734 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hoxd12P23812 Gm5637-201ENSMUST00000153890 1119 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Hoxd12P23812 Gm20636-201ENSMUST00000176660 707 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hoxd12P23812 Gm27320-201ENSMUST00000184892 109 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Hoxd12P23812 Gm37259-201ENSMUST00000193903 849 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Hoxd12P23812 Gm43597-201ENSMUST00000201650 1057 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hoxd12P23812 Gm43763-201ENSMUST00000201761 683 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hoxd12P23812 Gabarapl1-204ENSMUST00000204956 539 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hoxd12P23812 Rfxank-203ENSMUST00000212320 1121 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hoxd12P23812 Gm9176-201ENSMUST00000219955 1120 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Hoxd12P23812 Mrap-201ENSMUST00000038197 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hoxd12P23812 Lats2-202ENSMUST00000038381 933 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hoxd12P23812 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Hoxd12P23812 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hoxd12P23812 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hoxd12P23812 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hoxd12P23812 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hoxd12P23812 Zfp384-202ENSMUST00000054553 2451 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hoxd12P23812 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hoxd12P23812 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hoxd12P23812 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hoxd12P23812 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hoxd12P23812 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hoxd12P23812 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hoxd12P23812 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hoxd12P23812 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hoxd12P23812 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hoxd12P23812 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hoxd12P23812 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Hoxd12P23812 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Hoxd12P23812 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Hoxd12P23812 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Hoxd12P23812 Gm6203-201ENSMUST00000209575 1342 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Hoxd12P23812 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Hoxd12P23812 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Hoxd12P23812 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Hoxd12P23812 Gm13657-201ENSMUST00000135682 1939 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Hoxd12P23812 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Hoxd12P23812 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Hoxd12P23812 Toe1-202ENSMUST00000106455 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Hoxd12P23812 Tmod4-202ENSMUST00000107227 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Hoxd12P23812 Rpl3-ps2-201ENSMUST00000117131 1214 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Hoxd12P23812 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Hoxd12P23812 Gm25261-201ENSMUST00000157416 134 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Hoxd12P23812 Gm7029-201ENSMUST00000173226 450 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Hoxd12P23812 A930009A15Rik-201ENSMUST00000173620 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Hoxd12P23812 4930516B21Rik-201ENSMUST00000181600 1195 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Hoxd12P23812 Gm5850-201ENSMUST00000192923 1206 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Hoxd12P23812 Gm4610-201ENSMUST00000198222 905 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Hoxd12P23812 Gm7619-201ENSMUST00000210649 1282 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.2 ms