Protein–RNA interactions for Protein: P20444

Prkca, Protein kinase C alpha type, mousemouse

Predictions only

Length 672 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkcaP20444 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
PrkcaP20444 Zfp142-203ENSMUST00000113737 7473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
PrkcaP20444 Astl-204ENSMUST00000179618 2236 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
PrkcaP20444 Ccdc116-203ENSMUST00000115711 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
PrkcaP20444 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
PrkcaP20444 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
PrkcaP20444 Cbs-203ENSMUST00000118504 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
PrkcaP20444 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
PrkcaP20444 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.45□□□□□ -0.42
PrkcaP20444 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
PrkcaP20444 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
PrkcaP20444 5830487J09Rik-201ENSMUST00000198600 1256 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
PrkcaP20444 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
PrkcaP20444 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
PrkcaP20444 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
PrkcaP20444 Oas1e-201ENSMUST00000100785 1801 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
PrkcaP20444 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
PrkcaP20444 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
PrkcaP20444 Etl4-201ENSMUST00000045555 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
PrkcaP20444 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
PrkcaP20444 Olfr279-202ENSMUST00000205772 5330 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.45□□□□□ -0.42
PrkcaP20444 Glis2-201ENSMUST00000014447 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
PrkcaP20444 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
PrkcaP20444 Nol10-201ENSMUST00000046011 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
PrkcaP20444 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
PrkcaP20444 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
PrkcaP20444 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
PrkcaP20444 Ralgps2-214ENSMUST00000191605 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
PrkcaP20444 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
PrkcaP20444 Prrc2a-201ENSMUST00000025253 6888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
PrkcaP20444 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
PrkcaP20444 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
PrkcaP20444 D430019H16Rik-201ENSMUST00000178224 5786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
PrkcaP20444 Gm10728-201ENSMUST00000194292 1829 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
PrkcaP20444 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
PrkcaP20444 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
PrkcaP20444 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
PrkcaP20444 Prkce-202ENSMUST00000097275 6254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
PrkcaP20444 AC155298.2-201ENSMUST00000225485 6226 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
PrkcaP20444 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC12.44□□□□□ -0.42
PrkcaP20444 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
PrkcaP20444 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
PrkcaP20444 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
PrkcaP20444 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
PrkcaP20444 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
PrkcaP20444 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
PrkcaP20444 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
PrkcaP20444 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
PrkcaP20444 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
PrkcaP20444 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
PrkcaP20444 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC12.44□□□□□ -0.42
PrkcaP20444 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
PrkcaP20444 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
PrkcaP20444 Pde4d-205ENSMUST00000119507 2163 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
PrkcaP20444 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
PrkcaP20444 Eif5b-201ENSMUST00000027252 7797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
PrkcaP20444 Plcd3-201ENSMUST00000103077 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
PrkcaP20444 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
PrkcaP20444 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
PrkcaP20444 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
PrkcaP20444 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
PrkcaP20444 Spata21-201ENSMUST00000051907 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
PrkcaP20444 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
PrkcaP20444 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC12.44□□□□□ -0.42
PrkcaP20444 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
PrkcaP20444 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
PrkcaP20444 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
PrkcaP20444 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
PrkcaP20444 BC048403-202ENSMUST00000136432 2968 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
PrkcaP20444 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
PrkcaP20444 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
PrkcaP20444 Prrc2b-201ENSMUST00000036691 8612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
PrkcaP20444 Ret-201ENSMUST00000032201 5456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
PrkcaP20444 Plagl1-202ENSMUST00000121646 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
PrkcaP20444 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
PrkcaP20444 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
PrkcaP20444 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC12.43□□□□□ -0.42
PrkcaP20444 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
PrkcaP20444 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC12.43□□□□□ -0.42
PrkcaP20444 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
PrkcaP20444 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
PrkcaP20444 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
PrkcaP20444 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
PrkcaP20444 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
PrkcaP20444 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
PrkcaP20444 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
PrkcaP20444 Crybg2-213ENSMUST00000227683 5578 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
PrkcaP20444 Angel2-203ENSMUST00000110899 3673 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
PrkcaP20444 Acap1-201ENSMUST00000001631 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
PrkcaP20444 Sema4a-214ENSMUST00000166237 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
PrkcaP20444 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
PrkcaP20444 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
PrkcaP20444 Dnpep-203ENSMUST00000185419 2833 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
PrkcaP20444 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
PrkcaP20444 Shank2-203ENSMUST00000105902 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
PrkcaP20444 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
PrkcaP20444 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
PrkcaP20444 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
PrkcaP20444 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
PrkcaP20444 Gpr107-201ENSMUST00000056433 6134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms