Protein–RNA interactions for Protein: P16546

Sptan1, Spectrin alpha chain, non-erythrocytic 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sptan1P16546 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Sptan1P16546 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Sptan1P16546 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Sptan1P16546 Msra-205ENSMUST00000210428 1180 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Sptan1P16546 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Sptan1P16546 Nmnat1-201ENSMUST00000030845 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Sptan1P16546 Rcan2-202ENSMUST00000044895 3363 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Sptan1P16546 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Sptan1P16546 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Sptan1P16546 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Sptan1P16546 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Sptan1P16546 Fam118b-202ENSMUST00000063782 1662 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Sptan1P16546 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Sptan1P16546 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Sptan1P16546 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Sptan1P16546 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Sptan1P16546 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Sptan1P16546 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Sptan1P16546 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Sptan1P16546 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Sptan1P16546 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Sptan1P16546 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Sptan1P16546 Gm37324-201ENSMUST00000194500 4504 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Sptan1P16546 Bud23-203ENSMUST00000111205 1169 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Sptan1P16546 Cep97-206ENSMUST00000122280 1057 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Sptan1P16546 F630206G17Rik-201ENSMUST00000137002 685 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Sptan1P16546 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Sptan1P16546 Gm12167-201ENSMUST00000148132 578 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Sptan1P16546 Gm5565-201ENSMUST00000199463 1162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Sptan1P16546 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Sptan1P16546 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Sptan1P16546 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Sptan1P16546 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Sptan1P16546 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Sptan1P16546 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Sptan1P16546 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Sptan1P16546 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Sptan1P16546 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Sptan1P16546 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Sptan1P16546 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Sptan1P16546 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Sptan1P16546 Add2-203ENSMUST00000203279 1454 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Sptan1P16546 Fam71e1-201ENSMUST00000107927 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Sptan1P16546 Dusp13-204ENSMUST00000120984 976 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Sptan1P16546 Gm28638-201ENSMUST00000188152 288 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Sptan1P16546 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Sptan1P16546 Fn3k-201ENSMUST00000026175 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Sptan1P16546 3300002I08Rik-201ENSMUST00000051153 650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Sptan1P16546 Nkiras2-202ENSMUST00000051947 831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Sptan1P16546 Pax7-202ENSMUST00000174681 1725 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Sptan1P16546 Zfp558-202ENSMUST00000034647 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Sptan1P16546 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Sptan1P16546 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Sptan1P16546 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Sptan1P16546 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Sptan1P16546 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Sptan1P16546 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Sptan1P16546 Rnf214-201ENSMUST00000058720 3964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Sptan1P16546 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Sptan1P16546 Usp19-204ENSMUST00000178075 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Sptan1P16546 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Sptan1P16546 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Sptan1P16546 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Sptan1P16546 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Sptan1P16546 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Sptan1P16546 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Sptan1P16546 Stat3-203ENSMUST00000127638 4516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Sptan1P16546 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Sptan1P16546 Gm9431-201ENSMUST00000119765 1051 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Sptan1P16546 Gsto2-202ENSMUST00000120645 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Sptan1P16546 Gm12566-201ENSMUST00000121479 359 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Sptan1P16546 Gm25732-201ENSMUST00000175168 60 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Sptan1P16546 Gm42997-202ENSMUST00000200321 985 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Sptan1P16546 Nit2-201ENSMUST00000023432 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Sptan1P16546 Crip3-201ENSMUST00000024764 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Sptan1P16546 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Sptan1P16546 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Sptan1P16546 Dlk1-204ENSMUST00000109843 1300 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Sptan1P16546 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Sptan1P16546 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Sptan1P16546 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Sptan1P16546 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Sptan1P16546 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Sptan1P16546 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Sptan1P16546 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Sptan1P16546 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Sptan1P16546 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Sptan1P16546 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Sptan1P16546 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Sptan1P16546 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Sptan1P16546 Cav2-202ENSMUST00000115459 974 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Sptan1P16546 Cox16-204ENSMUST00000166723 579 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Sptan1P16546 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Sptan1P16546 Gm10608-202ENSMUST00000213924 676 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Sptan1P16546 Ifi30-202ENSMUST00000222087 981 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Sptan1P16546 AC122371.3-201ENSMUST00000223402 1061 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Sptan1P16546 St13-201ENSMUST00000023039 1089 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Sptan1P16546 Crabp2-201ENSMUST00000005019 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Sptan1P16546 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Sptan1P16546 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms