Protein–RNA interactions for Protein: P13373

Vpreb2, Immunoglobulin omega chain, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb2P13373 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.95
Vpreb2P13373 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.95
Vpreb2P13373 AF529169-201ENSMUST00000044491 7202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Vpreb2P13373 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Vpreb2P13373 Clspn-201ENSMUST00000048391 5027 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Vpreb2P13373 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Vpreb2P13373 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Vpreb2P13373 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Vpreb2P13373 Gm43321-201ENSMUST00000198897 2409 ntBASIC9.14□□□□□ -0.95
Vpreb2P13373 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Vpreb2P13373 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Vpreb2P13373 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Vpreb2P13373 Hdac11-201ENSMUST00000041736 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Vpreb2P13373 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Vpreb2P13373 Dstyk-201ENSMUST00000045110 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Vpreb2P13373 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Vpreb2P13373 Acacb-201ENSMUST00000031583 8482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Vpreb2P13373 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.14□□□□□ -0.95
Vpreb2P13373 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Vpreb2P13373 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC9.14□□□□□ -0.95
Vpreb2P13373 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Vpreb2P13373 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.14□□□□□ -0.95
Vpreb2P13373 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Vpreb2P13373 Gpr139-201ENSMUST00000084650 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Vpreb2P13373 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Vpreb2P13373 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC9.14□□□□□ -0.95
Vpreb2P13373 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Vpreb2P13373 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC9.14□□□□□ -0.95
Vpreb2P13373 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.14□□□□□ -0.95
Vpreb2P13373 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC9.14□□□□□ -0.95
Vpreb2P13373 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC9.14□□□□□ -0.95
Vpreb2P13373 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Vpreb2P13373 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC9.14□□□□□ -0.95
Vpreb2P13373 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC9.14□□□□□ -0.95
Vpreb2P13373 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC9.14□□□□□ -0.95
Vpreb2P13373 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Vpreb2P13373 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Vpreb2P13373 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Vpreb2P13373 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Vpreb2P13373 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.14□□□□□ -0.95
Vpreb2P13373 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.14□□□□□ -0.95
Vpreb2P13373 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Vpreb2P13373 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Vpreb2P13373 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Vpreb2P13373 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Vpreb2P13373 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC9.14□□□□□ -0.95
Vpreb2P13373 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Vpreb2P13373 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Vpreb2P13373 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Vpreb2P13373 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Vpreb2P13373 Paupar-201ENSMUST00000194826 3482 ntBASIC9.14□□□□□ -0.95
Vpreb2P13373 Gm37861-201ENSMUST00000193534 2869 ntBASIC9.14□□□□□ -0.95
Vpreb2P13373 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC9.14□□□□□ -0.95
Vpreb2P13373 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC9.14□□□□□ -0.95
Vpreb2P13373 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Vpreb2P13373 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Vpreb2P13373 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.13□□□□□ -0.95
Vpreb2P13373 Myo18b-201ENSMUST00000086617 8280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.13□□□□□ -0.95
Vpreb2P13373 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Vpreb2P13373 Ptch2-201ENSMUST00000030443 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Vpreb2P13373 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Vpreb2P13373 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Vpreb2P13373 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Vpreb2P13373 Kars-202ENSMUST00000093120 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Vpreb2P13373 Arhgap27-204ENSMUST00000107024 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.13□□□□□ -0.95
Vpreb2P13373 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Vpreb2P13373 Pcdhgb1-201ENSMUST00000192931 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Vpreb2P13373 Gm4780-202ENSMUST00000215200 2644 ntBASIC9.13□□□□□ -0.95
Vpreb2P13373 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.13□□□□□ -0.95
Vpreb2P13373 Ints1-210ENSMUST00000200393 7070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Vpreb2P13373 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Vpreb2P13373 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Vpreb2P13373 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Vpreb2P13373 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC9.13□□□□□ -0.95
Vpreb2P13373 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC9.13□□□□□ -0.95
Vpreb2P13373 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC9.13□□□□□ -0.95
Vpreb2P13373 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC9.13□□□□□ -0.95
Vpreb2P13373 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.13□□□□□ -0.95
Vpreb2P13373 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC9.13□□□□□ -0.95
Vpreb2P13373 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC9.13□□□□□ -0.95
Vpreb2P13373 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC9.13□□□□□ -0.95
Vpreb2P13373 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Vpreb2P13373 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC9.13□□□□□ -0.95
Vpreb2P13373 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Vpreb2P13373 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Vpreb2P13373 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC9.13□□□□□ -0.95
Vpreb2P13373 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Vpreb2P13373 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Vpreb2P13373 Cenpo-201ENSMUST00000020981 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Vpreb2P13373 Xndc1-201ENSMUST00000094130 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Vpreb2P13373 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Vpreb2P13373 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Vpreb2P13373 Taf1c-201ENSMUST00000093099 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Vpreb2P13373 Irak2-202ENSMUST00000089022 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Vpreb2P13373 Ccdc162-203ENSMUST00000099932 2742 ntTSL 5 BASIC9.13□□□□□ -0.95
Vpreb2P13373 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Vpreb2P13373 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Vpreb2P13373 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.13□□□□□ -0.95
Vpreb2P13373 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Vpreb2P13373 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms